流体構造生化学連成解析によるニューロンの移動モードと大脳皮質形成の力学の解明
流体構造生化学連成解析によるニューロンの移動モードと大脳皮質形成の力学の解明
批准号:
21H04541
负责人:
今井 陽介
金额:
$27.71万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-05 至 2024-03-31
中文摘要
哺乳類の大脳皮質深部で誕生した神経細胞(ニューロン)は,三種類の移動モードを駆使して脳表層に到着し,インサイドアウトと呼ばれる六層構造の大脳皮質を形成する.本研究の目的は,流体構造生化学連成解析とイン・ビボ細胞実験の統合的な手法によって,ニューロンの移動モードの変化とインサイドアウト構造の形成メカニズムを力学に基づいて明らかにすることである.そのための基盤計算技術として,細胞膜の固体力学,細胞質と細胞外の液体の流体力学,細胞接着タンパクと細胞骨格タンパクの生化学反応を連成するトランススケール流体構造生化学連成解析手法を開発する.2022年度は,第一に,2021年度に開発した局所的な生体膜の面積増加と薄膜の力学を記述する計算モデルを,細胞質および細胞外環境の流体力学と連成する計算手法を開発した.具体的には,ストークス流れの流体力学を境界積分方程式を用いて記述し,アイソジオメトリック解析に基づく境界積分法(アイソジオメトリック境界積分法)を新たに開発した.第二に,神経細胞の力学特性のみ(細胞膜の弾性と細胞質の粘性)を考慮した計算モデルを用いて,トランスロケーションにおける神経細胞の先導突起の短縮に必要となる力学条件を検討した.数値実験と過去の細胞実験の時間スケールを比較し,先導突起の短縮には,細胞骨格がブレーキのような作用している可能性が示唆された.これらの結果に基づき,細胞骨格の重合・脱重合と細胞膜の面積変化の数理モデル化に着手した.
英文摘要
哺乳類の大脳皮質深部で誕生した神経細胞(ニューロン)は,三種類の移動モードを駆使して脳表層に到着し,インサイドアウトと呼ばれる六層構造の大脳皮質を形成する.本研究の目的は,流体構造生化学連成解析とイン・ビボ細胞実験の統合的な手法によって,ニューロンの移動モードの変化とインサイドアウト構造の形成メカニズムを力学に基づいて明らかにすることである.そのための基盤計算技術として,細胞膜の固体力学,細胞質と細胞外の液体の流体力学,細胞接着タンパクと細胞骨格タンパクの生化学反応を連成するトランススケール流体構造生化学連成解析手法を開発する.2022年度は,第一に,2021年度に開発した局所的な生体膜の面積増加と薄膜の力学を記述する計算モデルを,細胞質および細胞外環境の流体力学と連成する計算手法を開発した.具体的には,ストークス流れの流体力学を境界積分方程式を用いて記述し,アイソジオメトリック解析に基づく境界積分法(アイソジオメトリック境界積分法)を新たに開発した.第二に,神経細胞の力学特性のみ(細胞膜の弾性と細胞質の粘性)を考慮した計算モデルを用いて,トランスロケーションにおける神経細胞の先導突起の短縮に必要となる力学条件を検討した.数値実験と過去の細胞実験の時間スケールを比較し,先導突起の短縮には,細胞骨格がブレーキのような作用している可能性が示唆された.これらの結果に基づき,細胞骨格の重合・脱重合と細胞膜の面積変化の数理モデル化に着手した.
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DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yamaguchi, Y., Takeda, H., Asai, Y., Ishida, S., and Imai, Y.]
通讯作者:
Y.
A computational model of leukocyte rolling
白细胞滚动的计算模型
DOI:
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发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[2.Seike, D., Ishida, S., Asai, Y., Takeda, H., Kitamura, N., Gonda, K., Imai, Y.]
通讯作者:
Y.
Computational fluid dynamics analysis of effect of ciliary motion on cerebrospinal fluid flow
纤毛运动对脑脊液流动影响的计算流体动力学分析
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yoshida, H., Ishida, S., Yamamoto, T., Takeuchi, K., Nagata, Y., Ueno, H., and Imai, Y.]
通讯作者:
Y.
Escape of small capsules from large capsules aligned in confined shear flow: a computational study
小胶囊从在受限剪切流中排列的大胶囊中逸出:一项计算研究
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Yohsuke Imai, Shunichi Ishida, Daiki Matsunaga]
通讯作者:
Daiki Matsunaga
Effect of cilia-induced surface velocity on cerebrospinal fluid exchange in the lateral ventricles
纤毛诱导的表面速度对侧脑室脑脊液交换的影响
DOI:
10.1098/rsif.2022.0321
发表时间:
2022
期刊:
Journal of The Royal Society Interface
影响因子:
3.9
作者:
[Yoshida Haruki, Ishida Shunichi, Yamamoto Taiki, Ishikawa Takayuki, Nagata Yuichi, Takeuchi Kazuhito, Ueno Hironori, Imai Yohsuke]
通讯作者:
Imai Yohsuke
生体らしい形と動き:自発的に塑性変形する曲面の流体構造連成問題
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批准号:24H00292
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$31.45万
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财政年份:2024
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负责人:今井 陽介
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依托单位:
消化管内容物輸送シミュレータによる消化器系疾患の病態生理研究
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批准号:18800006
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
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资助金额:$1.78万
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财政年份:2006
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负责人:今井 陽介
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依托单位:
消化管内容物輸送シミュレータによる非潰瘍性消化不良と消化管運動異常の関係の解明
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批准号:05J08334
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.64万
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财政年份:2005
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负责人:今井 陽介
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依托单位:
海外基金