RNA高次構造による老化促進メカニズムの解明
RNA高次構造による老化促進メカニズムの解明
批准号:
21K14742
负责人:
松本 咲
金额:
$3.0万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-02-01 至 2024-03-31
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細胞の大きさは細胞機能を維持するために厳密に制御されている。その一方で、がん細胞では小さく、老化細胞では大きくなる。近年、細胞を肥大化させると、細胞内遺伝子発現が変化し、老化細胞様の形質が発言することが報告された。また、老化による細胞の肥大化により、細胞質の濃度が低下することも示唆されている。細胞が自身の大きさを制御するメカニズムや細胞老化メカニズムの解明は、老化関連疾患治療戦略の確立に必須であるものの、細胞内環境の変化が遺伝子発現に及ぼす影響については未だ理解されていない。本研究では、細胞サイズの変化による細胞質の分子環境の変化が遺伝子発現に及ぼす影響を、核酸の構造および熱安定性から定量的に理解することを目指す。そのため、下記の2ステップに分けて研究を行う。(1)In vitroにおける分子クラウディングが翻訳に及ぼす影響を明らかにする。(2)老化細胞における核酸構造による翻訳制御機構を明らかにする。令和4年度は(2)について検討した。ヘアピン構造やグアニン四重らせん構造などの高次構造を形成するRNAが転写されるテンプレートDNAとなるプラスミドベクターを遺伝子工学実験により設計、取得した。プラスミドを正常細胞および継代により老化した細胞に導入し、導入した遺伝子の発現を調べた。その結果、老化が進むにつれて翻訳効率の低下が観測された。またその翻訳効率の低下は安定な構造を形成するRNAほど顕著であった。令和5年度は老化が転写に及ぼす影響についてもqPCRを用いて調べ、老化の促進と翻訳効率の低下との関連を詳細に明らかにする予定である。
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Nucleic Acids Chemistry beyond the Watson-Crick Double Helix (68) : Topological control of DNA G-quadruplexes in CpG islands by changes of surrounding environments during senescence
沃森-克里克双螺旋之外的核酸化学 (68):衰老过程中周围环境变化对 CpG 岛中 DNA G 四链体的拓扑控制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[松本咲, 建石寿枝, 杉本直己, 千葉知世, Saki Matsumoto;Hisae Tateishi-Karimata;Tatsuya Ohyama;Naoki Sugimoto]
通讯作者:
Saki Matsumoto;Hisae Tateishi-Karimata;Tatsuya Ohyama;Naoki Sugimoto
脱ワトソン・クリックの核酸化学 (87): 高圧力を用いたグアニン四重鎖の水和解析によるリガンド結合予測
De-Watson-Crick 核酸化学 (87):通过高压鸟嘌呤四链体水合分析预测配体结合
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[高橋 俊太郎, 松本 咲, 大山 達也, Sudipta Bhowmik, 杉本 直己]
通讯作者:
杉本 直己
The effect of stability and topology of G-quadruplex on DNA methylation
G-四链体的稳定性和拓扑结构对 DNA 甲基化的影响
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, N. Sugimoto]
通讯作者:
N. Sugimoto
Effect of DNA modifications on the changes of DNA structure in CpG islands
DNA修饰对CpG岛DNA结构变化的影响
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[S. Matsumoto, H. Tateishi-Karimata, O. Tatsuya, N. Sugimoto]
通讯作者:
N. Sugimoto
DOI:
10.1007/s41061-021-00329-7
发表时间:
2021-03
期刊:
Topics in Current Chemistry
影响因子:
8.6
作者:
[Saki Matsumoto;N. Sugimoto]
通讯作者:
Saki Matsumoto;N. Sugimoto
共 12 条
DNA非標準構造によるDNAメチル化制御メカニズムの解明
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批准号:23K13846
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:松本 咲
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依托单位:
小分子によるRNAシュードノット構造の形成と遺伝子発現制御への応用
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批准号:14J05460
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.6万
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财政年份:2014
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负责人:松本 咲
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依托单位: