Development of novel exosomal glyco-biomarker with glycogenomics

利用糖基因组学开发新型外泌体糖生物标志物

• 批准号: 19K16078
• 负责人: 松田 厚志
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Keio University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K16078/
• 关键词: 糖鎖; エクソソーム; 定量解析; バイオマーカー; リキッドバイオプシー; レクチンマイクロアレイ

エクソソームは癌を含む様々な細胞から放出される細胞外小胞の一つで、タンパク質やDNAを含んでいることからリキッドバイオプシーの新たな標的とされている。タンパク質翻訳後修飾の一つである糖鎖もエクソソーム最外殻を覆っておりその標的とされるが機能を含めた全貌は未だ明らかとされていない。医療応用ツールとしてエクソソームを活用するには、糖タンパク質・ゲノムをはじめ包括的に理解する必要がある。また、エクソソームには様々な亜型が存在し、多様な機能を構成する。これらを理解するためにはマルチオミクス解析によるアプローチが有効であると考えられる。従って本研究課題は、疾患特異的糖鎖をもつエクソソームを同定し、ゲノム解析とのマルチオミクス解析からより詳細な解析を目的とする。まず、エクソソーム表層糖鎖解析のため、レクチンマイクロアレイを用いたエクソソーム表層比較糖鎖プロファイリング法を確立した。膵臓癌培養細胞を用いて、培養上清中分泌糖タンパク質、エクソソーム、細胞ライセートを比較したところ、各細胞株はエクソソーム固有の糖鎖を持つことが示された。更にエクソソームサブポピュレーションにおける比較糖鎖解析法も確立した。本法の確立により、これらエクソソームは各エクソソームマーカー (CD9, CD63, CD81) に応じて、その糖鎖構造も異なることが示された。

エ ク ソ ソ ー ム は carcinoma を containing む others 々 な cells か ら release さ れ る extracellular vesicular の a つ で, タ ン パ ク qualitative や contains DNA を ん で い る こ と か ら リ キ ッ ド バ イ オ プ シ ー の new た な mark と さ れ て い る. Modification after タ ン パ ク qualitative double 訳 の a つ で あ る sugar lock も エ ク ソ ソ ー ム most shell を fu っ て お り そ の mark と さ れ る を が functions including め た whole は not だ Ming ら か と さ れ て い な い. Medical 応 with ツ ー ル と し て エ ク ソ ソ ー ム を use す る に は, sugar タ ン パ ク qualitative · ゲ ノ ム を は じ め including に understand す る necessary が あ る. ま た, エ ク ソ ソ ー ム に は others 々 な 亜 が exist し, others more な function を constitute す る. Youdaoplaceholder6 れらを understand するために するために するために するために チ チ チ チ チ <s:1> ス ス analyze によるアプロ チが チが is effective for であると test えられる. は 従 っ て this research subject, disease specific sugar lock を も つ エ ク ソ ソ ー ム を with し, ゲ ノ ム parsing と の マ ル チ オ ミ ク ス parsing か ら よ り detailed analytical purpose を と な す る. ま ず, エ ク ソ ソ ー ム surface analytical の sugar lock た め, レ ク チ ン マ イ ク ロ ア レ イ を with い た エ ク ソ ソ ー ム surface more sugar lock プ ロ フ ァ イ リ ン を グ method established し た. Cui viscera cancer cultured cells を with い て, secreted in the culture supernatant sugar タ ン パ ク qualitative, エ ク ソ ソ ー ム, cell ラ イ セ ー ト を compare し た と こ ろ, each cell lines は エ ク ソ ソ ー ム inherent の sugar lock を hold つ こ と が shown さ れ た. Further にエ, ソソ, <s:1>, ムサブポピュレ, ショ, た, における compare the sugar lock analysis method to establish that た た. This law の establish に よ り, こ れ ら エ ク ソ ソ ー ム は each エ ク ソ ソ ー ム マ ー カ ー (CD9, CD63, CD81) に 応 じ て, そ の sugar lock も different structures な る こ と が shown さ れ た.

项目成果

Discovery of Pancreatic Ductal Adenocarcinoma-Related Aberrant Glycosylations: A Multilateral Approach of Lectin Microarray-Based Tissue Glycomic Profiling With Public Transcriptomic Datasets

• DOI: 10.3389/fonc.2020.00338
• 发表时间: 2020-03
• 期刊: Frontiers in Oncology
• 影响因子: 4.7
• 作者: Takanori Wagatsuma;Chiaki Nagai-Okatani;A. Matsuda;Y. Masugi;M. Imaoka;K. Yamazaki;M. Sakamoto

Comparative glycome analysis between exosomes, cell surface, and secreted glycoproteins with lectin microarray

使用凝集素微阵列对外泌体、细胞表面和分泌糖蛋白进行比较糖组分析

• 发表时间: 2019
• 作者: Atsushi Matsuda;Maki Yoshida;Tomomi Nakagawa;Takanori Wagatsuma;Makoto Suematsu;Hisashi Narimatsu;Yasuaki Kabe;Atsushi Kuno
• 通讯作者: Atsushi Kuno

Comparative Glycomic Analysis of Exosome Subpopulations Derived from Pancreatic Cancer Cell Lines

• DOI: 10.1021/acs.jproteome.0c00200
• 发表时间: 2020-06-05
• 期刊: JOURNAL OF PROTEOME RESEARCH
• 影响因子: 4.4
• 作者: Matsuda, Atsushi;Kuno, Atsushi;Narimatsu, Hisashi
• 通讯作者: Narimatsu, Hisashi

Lectin Bead Array in a Single Tip Facilitates Fully Automatic Glycoprotein Profiling

单头凝集素珠阵列有助于全自动糖蛋白分析

• DOI: 10.1021/acs.analchem.9b01876
• 发表时间: 2019
• 期刊: Analytical Chemistry
• 影响因子: 7.4
• 作者: Shimazaki Hiroko;Saito Kozue;Matsuda Atsushi;Sawakami Kazumi;Kariya Minoru;Segawa Osamu;Miyashita Yukiko;Ueda Tetsuya;Koizuka Michinori;Nakamura Kazuhiro;Kaji Hiroyuki;Tajima Hideji;Kuno Atsushi
• 通讯作者: Kuno Atsushi