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Search for treatment seeds of high grade renal cell carcinoma

寻找高级别肾细胞癌的治疗种子

基本信息

批准号：
19K16875
负责人：
大江知里
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kansai Medical University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K16875/
关键词：
腎細胞癌融合遺伝子次世代シーケンサー治療薬シーズ

项目摘要

本研究で検出された融合遺伝子を伴う腎癌は2例のTFE3融合遺伝子と1例のALK融合遺伝子のみであり、他の癌腫で治療薬が確立されているドライバー融合遺伝子の異常を伴う腎癌は発見されなかった。そこで、2021年度は今回の研究で構築した腎癌の臨床病理学的データベースを用いて、淡明細胞型腎細胞癌の予後やバイオマーカーに関する論文報告を行った。2022年度はThe Cancer Genome Atlas （TCGA）で公開されているデジタルスライドを用いて、我々の明らかにした予後や治療選択につながる病理学的指標を人工知能（AI）に機械学習させ、AIによる淡明型または好酸性型の判定は病理学的予後因子や治療選択に関わる遺伝子発現と相関することを論文報告した。今回、非淡明細胞型腎細胞癌において、ALK以外に新規に治療ターゲットとなりうる融合遺伝子は認めなかったため、既知の治療薬である免疫チェックポイント阻害薬の奏効性につながる病理学的所見について解析を行った。2021年度に淡明細胞型腎細胞癌におけるヘマトキシリン・エオジン（HE）染色で施行した免疫フェノタイプはCD8陽性T細胞やPD-L1などの蛋白発現と免疫系の遺伝子発現と相関することを明らかにしたが、非淡明細胞型腎細胞癌においても相関があるかどうかは不明である。乳頭状腎細胞癌や嫌色素性腎細胞癌などの代表的な非淡明細胞型腎細胞癌においても、HE染色標本による免疫フェノタイプが蛋白発現や遺伝子異常と相関するかどうか、当院の症例とTCGAの症例を用いて検討中である。

In this study, we identified 2 cases of TFE3 fusion gene and 1 case of ALK fusion gene associated with renal cell carcinoma, and established treatment options for other cancers. This paper reports on the current study of renal cell carcinoma in 2021. In 2022, The Cancer Genome Atlas (TCGA) will be published in the journal Pathology, Human Intelligence (AI), Machine Learning (ML), AI, Light Type (ML), Pathology, Path Now, non-light cell renal cell carcinoma, ALK, new regulations, treatment, fusion, recognition, known treatment, immunity, resistance, effectiveness, pathological findings, analysis. In 2021, the expression of CD8-positive T cells and PD-L1-positive proteins in light cell renal cell carcinoma and non-light cell renal cell carcinoma were correlated with HE staining. Papillary renal cell carcinoma and pigmented renal cell carcinoma are representative of non-light cell renal cell carcinoma, HE staining, immune protein expression, gene abnormality, correlation, and clinical diagnosis of TCGA.