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BW変換技術の深化による大規模データ処理基盤技術の開発

深化BW转换技术开发大规模数据处理基础技术

基本信息

批准号：
19K20213
负责人：
井智弘
金额：
$ 2.66万
依托单位：
Kyushu Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

BW変換は文字列中の各文字をその後ろに続く文字列（文脈）によってソートして得られる可逆変換である．それ自体では，文字を並べ替えただけなので圧縮になっていないが，文脈が似通っている文字を隣接する位置に配置することで同じ文字が連続しやすくなるため，連長圧縮などの単純な手法で圧縮することが可能となる．特に，高度反復文字列に対して，BW変換文字列の連長圧縮サイズは非常に小さくなり，データによっては数百分の一のサイズまで大幅に圧縮可能であることが知られている．BW変換は単に圧縮の前処理に止まらず，様々な文字列処理に応用されている．例えば，FerraginaとManziniはBW変換文字列を索引構造のように使えることを示し，文字列を簡潔な領域で保持しながら効率的なパターン照合機能を提供する簡潔データ構造FM-indexを提案した．FM-indexはテキスト中でパタン文字列と完全に一致する部分文字列の位置を検索できるが，完全一致の照合問題を一般化した照合に対してはそのまま使うことはできない．近年，パラメタ化文字列照合に対するFM-indexをはじめとして，様々な一般化文字列照合に対するFM-indexが盛んに研究されている．本年度は，回文構造の一致に基づいた一般化文字列照合に対するFM-indexを提案し，成果をまとめた論文はAnnual Symposium on Combinatorial Pattern Matching 2023に投稿し採択された．この結果は，FM-index的な索引構造を設計するために必要な条件を明らかにするための一助になると考えられる．

Each character in the BW 変change は character sequence is をその后ろに続くcharacter sequence (context) によってソートしてget られる reversible 変change である．それ自体では, 字　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　ifies いないが, 文 ContextにConfiguration することで同じ文が连続しやすくなるため, Company commander 姧 shrink などの単pure な technique で姧 shrink することがpossible となる． Special, highly repetitive character string, BW changing character string, even long compression, very small, small character string , It is possible to shrink the pressure by hundreds of percent, and it is possible to shrink it by a large amount. BW changes the pre-processing of compression and compression, and the character string processing of 様々な uses されている. Example えば, Ferragina と Manzini は BW 変 change the text string を index structure のように使えることを SHOW し, text string In the field of simplicity, we propose a simple structure FM-index that maintains the efficiency of the camera function. FM-index is the complete character sequence in the character sequence and the position of the partial character sequence in FM-index.できるが, the generalization of できるが, which is completely consistent with the のphotographing problem, したphotographing and に対してはそのまま使うことはできない. In recent years, the research on the パラメタ changed character list and the に対するFM-indexをはじめとして, and the 様々なgeneralized character list and the に対するFM-indexが生んに research されている. This year, a proposal for a generalization of the syntax of the palindrome structure based on FM-index and a paper on the results of the Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching 2023 was submitted.このRESULTS は, なindex structure をdesign of FM-index するためにNecessary conditions を明らかにするための一help になると考えられる.

项目成果

期刊论文数量（20）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

Faster Privacy-Preserving Computation of Edit Distance with Moves.

通过移动更快地计算编辑距离的隐私保护。

DOI：
发表时间：
2019
期刊：
影响因子：
0
作者：
Yohei Yoshimoto;Masaharu Kataoka;Yoshimasa Takabatake;Tomohiro I;Kilho Shin;Hiroshi Sakamoto:
通讯作者：
Hiroshi Sakamoto:

PHONI: Streamed Matching Statistics with Multi-Genome References.

DOI：
10.1109/dcc50243.2021.00027
发表时间：
2021-03
期刊：
Proceedings. Data Compression Conference
影响因子：
0
作者：
Boucher C;Gagie T;Tomohiro I;Köppl D;Langmead B;Manzini G;Navarro G;Pacheco A;Rossi M
通讯作者：
Rossi M

k-Abelian Pattern Matching: Revisited, Corrected, and Extended

DOI：
发表时间：
2019-08
期刊：
Algorithmica
影响因子：
1.1
作者：
Golnaz Badkobeh;H. Bannai;M. Crochemore;⋆⋆ TomohiroI4;Shunsuke Inenaga;Shiho Sugimoto
通讯作者：
Golnaz Badkobeh;H. Bannai;M. Crochemore;⋆⋆ TomohiroI4;Shunsuke Inenaga;Shiho Sugimoto

Deterministic Sparse Suffix Sorting in the Restore Model