Analysis of molecular evolution of various respiratory viruses in an area of the Philippines

菲律宾某地区各种呼吸道病毒的分子进化分析

• 批准号: 19KK0204
• 负责人: 押谷 仁
• 金额: $ 11.81万
• 依托单位: Tohoku University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-10-07 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19KK0204/
• 关键词: 呼吸器感染症; フィリピン; コロナウイルス; ライノウイルス; RSウイルス; 呼吸器ウイルス; ウイルス学; インフルエンザ; 分子進化; 疫学

フィリピンのビリラン島で実施してきた呼吸器感染症に関する研究で得られたさまざまな呼吸器ウイルスの解析を行うことを目的としてきた。ビリラン島の研究はCOVID-19パンデミックのために中断していたが、2022年9月に研究が再開され、RSウイルスなど多くの呼吸器ウイルスが検出されてきている。また、COVID-19流行以前に採取された検体についてもさまざまな観点から解析を行った。ライノウイルスは最も高い頻度で検出される呼吸器ウイルスであるが、その病因的意義は十分に確立していない。特に新たに検出されたライノウイルスC（RV-C）は重症化に関与している可能性が指摘されているが、重症化に関与しているという確実なデータは得られていなかった。ビリラン島におけるデータから既存のRV-A・RV-BとRV-Cの重症度を比較した結果、RV-Cは重症例が多く、特にRV-CとRV-AのRecombinationの結果生じたと考えられるウイルスの感染例で重症例が多いことが明らかになった（Open Forum Infect Dis. 2022 ）。また、既存のヒトコロナウイルスであるOC43について全ゲノムシークエンスを行い、OC43ではSARS-CoV-2に比べて進化速度が遅いことが明らかになった。また、ビリラン島で採取された小児血清から既存のヒトコロナウイルス（OC43, 229E, NL63, HKU1)に対する抗体価を分析した結果、いずれのウイルスに対しても高い抗体価を保有することが明らかになった。ELISAではSARS-CoV-2に対して交差反応を示したが、明らかな中和抗体がある検体は認められなかった（Sci Rep. 2023）。

フ ィ リ ピ ン の ビ リ ラ ン island で be applied し て き た respirator adapting just-in-time inventory に masato す る study で ら れ た さ ま ざ ま な respirator ウ イ ル ス の parsing line を う こ と を purpose と し て き た. ビ リ ラ ン island の research は COVID - 19 パ ン デ ミ ッ ク の た め に interrupt し て い た が, in September 2022 に が to open さ れ, RS ウ イ ル ス な ど more く の respirator ウ イ ル ス が 検 out さ れ て き て い る. ま た, COVID - 19 popular に before taking さ れ た 検 body に つ い て も さ ま ざ ま な 観 point か ら parsing line を っ た. ラ イ ノ ウ イ ル ス は most も い high frequency で 検 out さ れ る respirator ウ イ ル ス で あ る が, そ の etiology significance は very に establish し て い な い. Special に new た に 検 out さ れ た ラ イ ノ ウ イ ル ス C (RV - C) は intensive に masato and し て い る possibility が blame さ れ て い る が, severe に masato and し て い る と い う indeed be な デ ー タ は have ら れ て い な か っ た. ビ リ ラ ン island に お け る デ ー タ か ら existing の RV - A と RV, RV - B - C の intensive degree を compare し た results, RV - C は が く more severe cases, と RV に RV - C - A の Recombination の result born じ た と exam え ら れ る ウ イ ル ス の infection cases で severe cases more than が い こ と が Ming ら か に な っ た (Op) en Forum Infect Dis. 2022. ま た, existing の ヒ ト コ ロ ナ ウ イ ル ス で あ る OC43 に つ い て full ゲ ノ ム シ ー ク エ ン ス を い, OC43 で は SARS - CoV - 2 に than べ て evolution speed が 遅 い こ と が Ming ら か に な っ た. ま た, ビ リ ラ ン island で take さ れ た small where serum か ら existing の ヒ ト コ ロ ナ ウ イ ル ス (OC43, 229 e, NL63, HKU1) に す seaborne る antibody 価 を analysis し た results, い ず れ の ウ イ ル ス に し seaborne て も high い antibody 価 を retain す る こ と が Ming ら か に な っ た. ELISA で は SARS - CoV - 2 に し seaborne て job against 応 を shown し た が, Ming ら か な neutralizing antibody が あ る は 検 body to recognize め ら れ な か っ た (Sci Rep., 2023).

项目成果

公衆衛生・国際保健・感染症対策の実際 ―エボラとコロナの経験から―

公共卫生、国际卫生和传染病控制的现实 - 来自埃博拉和冠状病毒的经验 -

• 发表时间: 2022
• 作者: Daiki Oshikawa;Shintaro Inaba;Yudai Kitagawa;Kaori Tsukakoshi;Kazunori Ikebukuro;古瀬祐気
• 通讯作者: 古瀬祐気

Risk of Transmission and Viral Shedding From the Time of Infection for Respiratory Syncytial Virus in Households.

• DOI: 10.1093/aje/kwab181
• 发表时间: 2021-12-01
• 期刊: American journal of epidemiology
• 影响因子: 5
• 作者: Otomaru H;Sornillo JBT;Kamigaki T;Bado SLP;Okamoto M;Saito-Obata M;Inobaya MT;Segubre-Mercado E;Alday PP;Saito M;Tallo VL;Quiambao BP;Oshitani H;Cook AR
• 通讯作者: Cook AR

岩手医科大学 医学部 微生物学講座 感染症学・免疫学分野

岩手医科大学医学部微生物学系、传染病免疫学系

National Institute of Public Health(カンボジア)

国家公共卫生研究所（柬埔寨）

Near-Complete Genome Sequencing of Influenza C Virus in the Philippines between 2014 and 2019.

• DOI: 10.1128/mra.00900-21
• 发表时间: 2021-12-09
• 期刊: Microbiology resource announcements
• 影响因子: 0.8
• 作者: Fujita D;Dapat C;Kagning Tsinda E;Saito M;Okamoto M;Saito-Obata M;Quiambao BP;Lupisan SP;Oshitani H
• 通讯作者: Oshitani H