植物RNAウイルスの感染個体内におけるゲノム多様化と病徴発現の分子機構

植物RNA病毒感染个体基因组多样性和疾病症状表达的分子机制

• 批准号: 20F20392
• 负责人: 小松 健
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: Tokyo University of Agriculture and Technology
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-11-13 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20F20392/
• 关键词: potexvirus; necrosis; RNA-seq

ユリに甚大な被害を及ぼす壊そ病の病原ウイルスであるオオバコモザイクウイルス(PlAMV)を自然生態系中の多様な野草から見出し、その全塩基配列を決定した。系統解析および集団遺伝学的解析により、PlAMVは大きく５つのクレードに分かれること、鑑賞ユリの分離株は一つのクレードにまとまり、他のクレードと明確な分化が認められることがわかった。各クレードの分離株のモデル植物およびオオバコ、ユリへの接種試験を行ったところ、植物への感染性はクレードごとに異なり、５つのクレードの分離株は生物学的な性状についても異なることが明らかになった。一方、鑑賞ユリに全身感染し壊疽を引き起こす分離株は得られなかった。このことは、鑑賞ユリでは感染植物内でのゲノム多様性が感染性に重要である可能性を考え、次世代ロングリードシーケンサーを用いたアンプリコンシーケンスで、PlAMVのゲノムで最も多様性が大きいリンカー領域についてウイルス配列の多様性を調べた。その結果、感染植物におけるPlAMVのリンカー領域の配列はいくつかのハプロタイプに分かれており、多様な集団を形成していることが示唆された。さらに、PlAMVの鑑賞ユリでの壊そのように、ウイルスが感染植物で引き起こす壊そ症状の原因について調べるため、ゲノム配列が解析され一過的発現系などが簡便に行えるタバコ属のNicotiana benthamianaを用いて解析を行なった。既に壊そ症状を誘導しうるウイルス因子として同定しているPlAMVの複製酵素のHELドメインを一過的発現させてRNAseqによる遺伝子発現解析を行なったところ、小胞体ストレス関連遺伝子が壊そ誘導時に高発現していることが明らかになった。

The pathogens of the disease, the pathogen, the pathogen, the disease, the pathogen, the pathogen, the System analysis of system analysis, PlAMV system analysis, analysis, analysis and analysis. Each plant is divided into different plants, each plant is divided into different plants, On the one hand, we identified the infection of the whole body and induced the isolation of the strains. In order to infect the plant, it is necessary to identify the possibility of infection, the possibility of infection. The results show that the infected plants are in the field of PlAMV infection. They are divided into two groups, and the results show that the infected plants are infected. After analyzing the symptoms, the causes of symptoms, the causes of symptoms, the analysis of Both the symptoms and signs lead to the determination of the same as that of the PlAMV copy enzyme HEL. The detection of the RNAseq response was performed in the first time, and the high temperature was detected during the response of the cell body.

项目成果

RNA-seqを用いたウイルス誘導性の壊死症状に関わる宿主因子の探索

使用 RNA-seq 寻找与病毒诱导的坏死症状相关的宿主因子

• 发表时间: 2022
• 作者: 新井和菜;Hamim Islam;齊藤大幹;有江力;小松健
• 通讯作者: 小松健