「missing heritability」問題解決に向けた人類遺伝学研究

人类遗传学研究旨在解决“遗传性缺失”问题

• 批准号: 20F20413
• 负责人: 藤本 明洋
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-11-13 至 2023-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20F20413/
• 关键词: missing heritability

ヒトゲノムには、個人差（多型）が存在し、疾患へのかかりやすさ（疾患感受性）や表現型の個人差に影響することが知られている。疾患に関係する多型を検出し、疾患発症機序の解明、疾患発症予測などにつなげるため、数多くの多型解析プロジェクトが行われている。しかしながら、ありふれた疾患（common disease）において、現在の多型解析は遺伝率（疾患発症リスクのうち遺伝的多様性が説明する割合）のうち一部しか説明ができない（「missing heritability（見逃されている遺伝率）」問題）。この問題には、次の3つの可能性が考えられる。（可能性１）ヒトゲノムには効果の弱い多型が非常に多く存在しており、非常に多くのサンプル（数十万人）を用いた解析を行うことで遺伝率を説明する多型を同定することができる。（可能性２）一塩基の違い以外に機能的な構造異常が存在し、疾患のリスクに関係している。（可能性３）頻度が低いアミノ酸多型が存在し疾患に関連している。おそらく、これらの中の一つだけが正しいわけではなく、この３つが、ヒトの疾患と遺伝の関係を形成していると考えられる。（可能性１）については、国際コンソーシアムでの大規模研究が進行中である。しかし、（可能性２）、（可能性３）に関しては、研究手法が未だ確立されていない。そこで、これらの確立と疾患解析への応用を目指した研究を行う。2020年度は、長鎖シークエンサーからの構造異常検出を行なった。外国人特別研究員は辞退するが、引き続き所属教室の助教として本研究に従事する予定である。

There is a difference between individual and individual (polytype), and the difference between individual and individual (susceptibility) is known. The relationship between multiple types of disease detection, disease development mechanism analysis, disease development prediction, multiple types of analysis and development The problem of "missing heritability"(see "missing heritability") is a part of the problem of "missing heritability"(see "missing heritability"). This problem is the third possibility of the problem. (Possibility 1) Multi-type analysis results in multi-type analysis (hundreds of thousands of people) (Possibility 2) A structural anomaly other than a basic violation exists, and a disease exists. (Possibility 3) Frequency is low, acid polymorphism is present, disease is associated. The relationship between the disease and the disease is formed. (Possibility 1) Large-scale international research is underway. The research method is not established yet. The analysis of the disease and the application of the disease In 2020, the structural anomaly occurred in the long lock. The Special Fellow for Foreigners will be dismissed from the teaching assistant position in the classroom to which he belongs.

项目成果

Characterization of intermediate-sized insertions using whole-genome sequencing data and analysis of their functional impact on gene expression

• DOI: 10.1007/s00439-021-02291-2
• 发表时间: 2021-05-12
• 期刊: HUMAN GENETICS
• 影响因子: 5.3
• 作者: Ashouri, Saeideh;Wong, Jing Hao;Fujimoto, Akihiro
• 通讯作者: Fujimoto, Akihiro