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High Throughput Measurement of Radioactive Tracers for Searching QTL of Ion Dynamics in Plants

高通量测量放射性示踪剂用于寻找植物离子动力学 QTL

基本信息

批准号：
20H02885
负责人：
田野井慶太朗
金额：
$ 11.15万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

3年目の本年度は、実験材料としてのイネの品種選抜においてイネの拡大版コアコレクション約200系統、インディカ200系統、aus200系統の、合計600系統を対象とし、イオンの転流の影響が大きいと考えられる止め葉（穂が出てくる直前に出てくる最後の葉）の葉身に焦点をあて、2020年に8月の出穂期と10月の収穫期の2回に分けてサンプリングをした止め葉について、合計約6000点について、硝酸にて湿式分解の後、ICP-MSによる網羅的なイオン測定を実施した。測定対象とした元素は、B, Na, Mg, Al, P, S, K, Ca, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, As, Rb, Sr, Mo, Cd, Cs, Baであった。これらを一度の測定で完了するためのプログラムを構築して、測定を進め、全てのサンプルの測定を終えることができた。測定結果をもとに、イオノーム解析を実施した。興味のあった転流を解析するにあたり、得られたデータをクリーニングした後、多変量解析を行ったところ、PC3までで60％となった。とりわけ30％を超えるPC1について各元素のグルーピングを見てみると、2つのグループに別れ、止め葉からの転流が多いと見られるグループには、Mo, Mg, Zn, Rb, Cu, K, Pが、転流なしと見られるグループには、Mn, Ca, Sr, Co, Feがグルーピングされた。PC1を転流を示す軸とみなし、PC1の値でQTLを実施したところ、有意に差があるとされるピークが複数見られた。他、As, Mg, KについてGWASを実施し、それぞれ有意に差があるとされるピークを見出すことに成功した。また、引き続き確立した測定系やRI実験法を活用した共同研究も展開した。

3 years of this year's production of materials and varieties of selection, production and distribution of large version of the United States, about 200 systems, 200 systems, aus 200 systems, a total of 600 systems, the impact of the image, the impact of the flow of large version of the United States The focus of the leaf body is about 6000 points in total. The wet decomposition of nitric acid and the measurement of ICP-MS are carried out. Determination of elements such as Na, Mg, Al, P, S, K, Ca, Mn, Fe, Co, Ni, Cu, Zn, As, Rb, Sr, Mo, Cd, Cs, Ba. The first step is to complete the measurement, construct the measurement, and complete the measurement. The results of the test were analyzed. The analysis of interest and flow is 60%. 30% more than PC1, 2% more than PC1, 3, 2% more than PC1, 2% more than PC1, 2% more than PC PC1 is the most important component of the QTL. He, As, Mg, K, and GWAS were successful. To establish a system for joint research and development

项目成果

期刊论文数量（23）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

シンチレータの植物研究応用

闪烁体的植物研究应用

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
D.X Makaula;K. T. Konadu;Opitz;K. Sasaki;S.T.L Harrison;田野井慶太朗
通讯作者：
田野井慶太朗

マグネシウム含量の低いイネ変異体の解析と原因遺伝子OsRZF1の同定

水稻低镁突变体分析及致病基因OsRZF1的鉴定

DOI：
发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
0
作者：
小林奈通子;高木宏樹;楊笑雨;横井彩子;瀬川天太;星名辰信;大西孝幸;鈴木寿;岩田錬;土岐精一; 中西友子;田野井慶太朗
通讯作者：
田野井慶太朗

液胞局在型マグネシウム輸送体の機能解析

液泡定位镁转运蛋白的功能分析

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
K. Ishibashi;S. Iihama;Y. Takeuchi;K. Furuya;S. Kanai;S. Fukami;S. Mizukami;渡辺賢二;小林奈通子・楊笑雨・大西麻美・栗田悠子・加藤美砂子・田野井慶太朗
通讯作者：
小林奈通子・楊笑雨・大西麻美・栗田悠子・加藤美砂子・田野井慶太朗

シンチレータを用いた植物体内の放射性同位体の可視化

使用闪烁体可视化植物中的放射性同位素