权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

Study of biodiversity of rust fungi on tropical useful plants in Vietnam

越南热带有用植物锈菌生物多样性研究

基本信息

批准号：
20H03006
负责人：
岡根泉
金额：
$ 11.32万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-01 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

ベトナム北部、中部、南部のコーヒープランテーションで収集されたコーヒーさび病菌を供試し、コーヒーノキとその近縁植物を宿主とするHemileia属サビキンの種の特定と、遺伝子解析による本菌の種内変異について調査を行った結果、ベトナムの主要コーヒー栽培地域では本病が広く発生しており、原因サビキンはHemileia vastatrixであることが形態および分子情報により確認された（昨年度報告）。以上を踏まえ、昨年より引き続いて核リボゾームDNA ITS領域の塩基配列の違いに基づいたハプロタイプを識別し、タイおよび南米各国で発生したサビキンのデータも加えて分子系統学・集団遺伝学的調査を進めた。その結果、ベトナムのH. vastatrix集団に36のハプロタイプを見出し、祖先ハプロタイプとそこから派生したハプロタイプの分布状況から、ベトナムでの本病の発生が主要生産地である北西部を起源として南部へ広がったと推定した。また、現在ベトナムでのコーヒーの主要生産地の1つである南部の中央高原を起源としたサビキン集団が、ベトナム南部でさらに拡大している可能性についても認めた。そして、これらの成果を論文化し公表に至った。さらに、ベトナムのH. vastatrix集団について、集団内での系統関係、遺伝子流動等に基づいた集団遺伝学的特徴を明らかにするため、MIG-Seq法を用いてゲノム中のマクロサテライトに挟まれた領域（Inter Simple Sequence Repeat：ISSR）の一塩基多型（SNP）を検出し、ゲノムワイド一塩基多型の遺伝子型決定を行った。その結果、118の分離株で合計1075のSNPが同定された。

ベトナム northern, central, southern のコーヒープランテーションで収 set されたコーヒーさをび germs were し, コーヒーノキとその nearly try を host plants とする Hemileia genus サビキンのの specific と, but 伝 analytic による this bacterium の intraspecific variations different についを line って survey た results, ベトナムの main コーヒー cultivated area では disease が hiroo く発 raw しており, cause サビキンは Hemileia vastatrix であることが form および molecular intelligence により confirm された annual report (yesterday). Above tread をまえ, yesterday より lead き続いて nuclear リボゾーム DNA ITS field の salt base with column の violations いに base づいたハプロタイプを identification し, タイおよび countries around the south rice で発 raw したサビキンのデータも plus えて molecular systematics, set 団 heritage を伝 learn investigation into めた. その results, ベトナムの h. vastatrix set 団に 36 のハプロタイプを see し, ancestors ハプロタイプとそこから derived したハプロタイプの distribution から, ベトナムでの disease の発 raw leading producer がである north west を origin として in southern へ hiroo がったと presumption した. また, now ベトナムでのコーヒー leading producer のの 1 つであるの south central plateau を origin としたサビキン set 団が, ベトナム southern でさらに company, big している possibility についても recognize めた. Youdaoplaceholder0 て, れら, <s:1> results を on cultural public table に to った. さらに, ベトナムの h. vastatrix set 団について, set 団での system masato department, but 伝 flow に base づいた set 団 heritage 伝 study of 徴を Ming らかにするため, MIG - Seq を with いてゲノム in のマクロサテライトに carry まれた areas (system Simple Sequence Repeat: ISSR) <s:1> monosalt polymorphs (SNPS) を検 give を検, ゲノムワドドド monosalt polymorphs 伝 subtypes determine を rows った. Youdaoplaceholder0 そ results, 118 isolates で total 1075 SNPS が agreed された.