Ecological role of marine viruses infecting zooplankton

感染浮游动物的海洋病毒的生态作用

• 批准号: 20H03057
• 负责人: 平井 惇也
• 金额: $ 11.4万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2020
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2020-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-20H03057/
• 关键词: 動物プランクトン; ウイルス; 共生寄生; カイアシ類; 個体群動態

研究3年目である2022年度は北海道紋別市における海洋モニタリングとの連携を継続し、動物プランクトンの採集を行った。対象生物であるカイアシ類Pseudocalanus newmaniの個体数変化を継続的に調査し、前年度までにP. newmaniから検出されたウイルスのコピー数の測定をqPCRにより各個体で行った。また、各ウイルスが餌由来でカイアシ類に取り込まれる可能性を調べるため、P. newmani以外の動物プランクトンでも同様のウイルス検出を行い、電子顕微鏡でP. newmaniの消化管内容物内にウイルス粒子が存在するか否かを確かめた。これらの解析の結果、カイアシ類独自のウイルスと外部から取り込まれるウイルスがいることが判明している。各ウイルスの存在下および非存在下のカイアシ類の発現遺伝子変動をトランスクリプトーム解析で調べたところ、生理的応答はウイルスごとに異なることも明らかになった。また、前年度までに行った集団遺伝解析に加え、ウイルス以外の要因がカイアシ類の個体群動態に及ぼす影響も評価するため、カイアシ類の捕食者となる動物プランクトンの個体数変化やウイルス以外の真核生物の寄生者の検出を行った。得られた成果の一部は論文として公表され（Hirai et al. 2023, Marine Biodiversity）、国内外の研究集会で成果の発表も行った。ウイルスがカイアシ類や海洋生態系に及ぼす影響や、カイアシ類のウイルスに対する免疫応答の有無、カイアシ類の遺伝的集団とウイルスの関係等、生態学的な知見においては課題も残ることとなった。そのため、前年度応募により新規課題に切り替え、動物プランクトンのウイルスに関する研究のさらなる発展を目指すこととなった。

The research is conducted in the year of 2022 in Hokkaido, Japan. The individual number of Pseudocalanus newmani was investigated in the previous year. The number of individuals detected by qPCR was determined. The possibility of adjusting the origin of each animal except P. newmani and the possibility of adjusting the origin of each animal except P. newmani and the possibility of adjusting the origin of each animal except P. newmani and P. newmani. The presence of particles in the contents of the digestive tract of newmani The result of this analysis is that the class is independent of the class. In the presence or absence of each species, there is a change in the expression of the species, and the physiological response is different. In the past year, the analysis of population dynamics and the evaluation of individual population dynamics of predator species in the presence of important factors other than species have been carried out. The results of this paper were published in Hirai et al. 2023, Marine Biodiversity. It is the first time for the United States to establish a diplomatic relationship with China. The research and development of the new project in the past year

项目成果

オホーツク海における浮遊性カイアシ類Pseudocalanus acuspesの初記録および遺伝的集団構造の近縁種比較

鄂霍次克海浮游桡足类Pseudocalanus acuspes的首次记录及与相关物种的遗传种群结构比较

• 发表时间: 2022
• 作者: 平井 惇也;片倉 靖次;長井 敏
• 通讯作者: 長井 敏

ウイルス存在下におけるカイアシ類Pseudocalanus newmaniの網羅的遺伝子発現解析

病毒存在下桡足类拟哲水牛的基因表达综合分析

• 发表时间: 2021
• 作者: 平井惇也;片倉靖次;長井 敏
• 通讯作者: 長井 敏

Large-scale metabarcoding analysis of epipelagic and mesopelagic copepods in the Pacific

• DOI: 10.1371/journal.pone.0233189
• 发表时间: 2020-05-14
• 期刊: PLOS ONE
• 影响因子: 3.7
• 作者: Hirai, Junya;Tachibana, Aiko;Tsuda, Atsushi
• 通讯作者: Tsuda, Atsushi

Ecological dynamics of marine copepods and viruses in the Okhotsk Sea

鄂霍次克海海洋桡足类和病毒的生态动态

• 发表时间: 2022
• 作者: Junya Hirai;Seiji Katakura;Satoshi Nagai
• 通讯作者: Satoshi Nagai

Feeding Ecology of Three Euphausiid Species in the North Pacific Ocean Inferred From 18S V9 Metabarcoding and Stable Isotope Analysis

• DOI: 10.3389/fmars.2021.756067
• 发表时间: 2021-10
• 作者: Fanyu Zhou;Junya Hirai;K. Hamasaki;S. Horii;A. Tsuda