鉄硫黄クラスター生合成マシナリーの反応過程における過渡的な中間状態の解明

铁硫簇生物合成机器反应过程中瞬态中间态的阐明

基本信息

  • 批准号:
    20H03204
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 11.56万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 财政年份:
    2020
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2020-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

1) IscUは、ISCマシナリーにおいてFe-Sクラスターの組み立てを担う中核成分である。われわれは2021年度、会合面に2つの [2Fe-2S] クラスターを集積した、対称的な二量体構造を明らかにしている。本年(2022年)度は、IscUのD40A/H106A二重変異型が、野生型とは異なる非対称な二量体を形成すること、また二量体を架橋する形で1つの [2Fe-2S] クラスターを持つことを明らかにした。これらの構造は、IscUにおけるFe-Sクラスターの配位構造や二量体の会合様式に、著しい柔軟性があることを示している。2) シクロセリンは、結核の治療などに用いられる抗生物質であり、D-体とL-体の2つの異なる光学異性体が知られている。これら2つの異なるシクロセリン光学異性体が、鉄硫黄クラスター生合成系SUFマシナリーのPLP依存性システイン脱硫酵素SufSに対して、それぞれ異なる機構で阻害作用を示すことを明らかにした。この結果は、病原性微生物による感染症治療において、SufSを標的とする新たな創薬の可能性を示すものである。3) 偏性嫌気性のバクテリアやアーキアの中には、sufBとsufCのみをコードしている(sufD, sufS, sufE, sufU, isc関連遺伝子を持たない)ものが見られる。その一つについて結晶構造を決定し、SufB2C2複合体を形成することを明らかにした。また、大腸菌のFe-Sクラスター生合成欠損株で発現させて異種間での相補能を検討したところ、嫌気かつNa2Sを添加した培養条件でのみ相補することを見出した。したがって、このSufB2C2複合体は、嫌気条件下で遊離のS2-(HS-)を硫黄源とする、Fe-Sクラスター生合成系のプロトタイプと考えられる。
1)IscU, ISC, Fe-S, Fe-S For the year 2021, the convergence plane of the [2Fe-2S] crystal structure and the corresponding two-dimensional structure are clearly defined. This year (2022), IscU's D40A/H106A double heteromorph, wild type, heteromorph, asymmetric binary formation, binary bridging, 1 [2Fe-2S], heteromorph, heteromorph. The structure of the coordination structure of the Fe-S complex and the convergence formula of the two quantities are shown in the figure. 2)Antibiotics, D-bodies, L-bodies, and 2-bodies are used in the treatment of tuberculosis. 2. The mechanism for inhibiting the formation of PPLP-dependent sulfases in the synthesis of optical isomers, iron and sulfur compounds These results demonstrate the potential for new infections in the treatment of infectious diseases caused by pathogenic microorganisms. 3)The partial dissimilarity is caused by the fact that the subsequence of the subsequence. The formation of SufB2C2 complex is determined by the crystal structure. In addition, the development of Fe-S complex in E. coli and the development of complementary energy between heterospecies were discussed. The SufB2C2 complex is free from sulfur source and Fe-S complex under anaerobic conditions.

项目成果

期刊论文数量(21)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Evidence for dynamic in vivo interconversion of the conformational states of IscU during iron?sulfur cluster biosynthesis
铁硫簇生物合成过程中 IscU 构象状态动态体内相互转化的证据
  • DOI:
    10.1111/mmi.14646
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.6
  • 作者:
    Sato Sakiko;Matsushima Yumeka;Kanazawa Miaki;Tanaka Naoyuki;Fujishiro Takashi;Kunichika Kouhei;Nakamura Ryosuke;Tomioka Hiroaki;Wada Kei;Takahashi Yasuhiro
  • 通讯作者:
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Analysis of cell death in <i>Bacillus subtilis</i> caused by sesquiterpenes from <i>Chrysopogon</i> <i>zizanioides</i> (L.) Roberty<i> </i>
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  • DOI:
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  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Shinjyo Y;Midorikawa N;Matsumoto T;Sugaya Y;Ozawa Y;Oana A;Horie C;Yoshikawa H;Takahashi Y;Hasegawa T;Asai K.
  • 通讯作者:
    Asai K.
The Structure of the Dimeric State of IscU Harboring Two Adjacent [2Fe-2S] Clusters Provides Mechanistic Insights into Cluster Conversion to [4Fe-4S]
  • DOI:
    10.1021/acs.biochem.1c00112
  • 发表时间:
    2021-05-03
  • 期刊:
  • 影响因子:
    2.9
  • 作者:
    Kunichika, Kouhei;Nakamura, Ryosuke;Takahashi, Yasuhiro
  • 通讯作者:
    Takahashi, Yasuhiro
鉄硫黄クラスター生合成マシナリーのシステイン脱硫酵素のシクロセリンによる阻害機構の解明
阐明铁硫簇生物合成机制中环丝氨酸对半胱氨酸脱硫酶的抑制机制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小川翔子;中村亮裕;小松茉里佳;引田理英;藤城貴史;高橋康弘
  • 通讯作者:
    高橋康弘
鉄硫黄クラスター生合成を担うSUFマシナリーの構造機能解析
负责铁硫簇生物合成的SUF机械的结构和功能分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    和田啓;田中良和;高橋康弘
  • 通讯作者:
    高橋康弘
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 作者:
    中村 亮裕;小松 茉莉佳;小川 翔子;國近 航平;藤城 貴史;高橋 康弘
  • 通讯作者:
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