計算化学・遺伝子工学・分子生物学を基盤とした植物二次代謝酵素の解析と設計
計算化学・遺伝子工学・分子生物学を基盤とした植物二次代謝酵素の解析と設計
批准号:
20J01256
负责人:
佐藤 玄
金额:
$3.08万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-24 至 2023-03-31
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採用からわずか9ヶ月間の研究期間ではあったが、当初の計画よりも研究が進展したと考えている。ホソバルピナス由来のリジン・オルニチン脱炭酸脱炭酸酵素 (L/ODC)については、共同研究者の取得した X 線結晶構造解析に基づき、約 30 種類の変異体酵素の作成とその活性評価を行うことができ、各アミノ酸側鎖がどのように酵素活性に寄与しているかを明らかにすることが出来た。また、研究計画に従い、L/ODC の近縁酵素であるアルギニン脱炭酸脱炭酸酵素 (ADC)、ジアミノピメリン酸脱炭酸脱炭酸酵素 (DapDC)との比較も進めた。ホソバルピナス(Tanjil品種)から La-DapDC と La-ADC をそれぞれクローニングしてくることに成功し、このうち、La-DapDC については、in vitro で酵素活性を確認することが出来た。また、La-L/ODC と La-DapDC の構造を計算化学により比較することにより、重要なアミノ酸残基を予測した。その結果、La- L/ODC F344H と La- L/ODC F344Y という2種の点変異体酵素が DapDC 活性を示すことを見出した。このことは、酵素の基質特異性や反応機構に新たな知見を与えるに留まらず、L/ODC 近縁種の酵素の進化の議論にもつながる大きな成果であると考える。また、40 年以上にわたり謎とされてきたブラシラン型骨格の生合成反応機構を計算化学を駆使することによって明らかにし、アメリカ化学会誌(J. Am. Chem. Soc.)に掲載され、表紙にも選出された。さらに、多様な天然物骨格の構築を目的とし、酸化酵素の反応機構解析にも取り組み、インドールジテルペン化合物 Lolitrem 生合成研究におけるラジカル閉環反応の詳細を明らかにすることに成功し、Angew. Chem. Int. Ed. 誌に掲載された。
期刊论文(3)
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科研奖励(0)
会议论文
DFT Study on the Biosynthesis of Preasperterpenoid A: Role of Secondary Carbocations in the Carbocation Cascade
前黑萜 A 生物合成的 DFT 研究:次级碳阳离子在碳阳离子级联中的作用
DOI:
10.1248/cpb.c20-00037
发表时间:
2020
期刊:
Chemical and Pharmaceutical Bulletin
影响因子:
1.7
作者:
[Sato Hajime, Yamazaki Mami, Uchiyama Masanobu]
通讯作者:
Uchiyama Masanobu
DOI:
10.1002/anie.202007280
发表时间:
2020-10-05
期刊:
ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION
影响因子:
16.6
作者:
[Jiang, Yulu, Ozaki, Taro, Oikawa, Hideaki]
通讯作者:
Oikawa, Hideaki
計算化学を利活用したVariexenol生合成の反応制御機構の解析と合理的改変
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批准号:24K01626
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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资助金额:$11.81万
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财政年份:2024
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负责人:佐藤 玄
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依托单位:
Analysis of terpene cyclization reactions based on computational chemistry, synthetic organic chemistry, and biochemistry
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批准号:22K14791
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2022
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负责人:佐藤 玄
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依托单位:
国内基金
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基于DFT计算的单/双原子锚定二维C2N催化剂的设计合成及NOx降解性能研究
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批准号:2026JJ60417
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:柳鑫淼
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依托单位:
数字产业生态下芯片产权保护与安全DFT协同设计关键技术研究
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批准号:2026JJ30111
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:王伟征
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依托单位:
“DFT+ML”协同探索原子精确金纳米团簇的类酶催化性质
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:孙芳
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依托单位:
硼相关的孤立及负载型团簇电催化C-N偶联合成尿素的DFT高通量筛选
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批准号:12364039
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:31万元
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批准年份:2023
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负责人:王海锋
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依托单位:
水稻晚花基因DFT1调控抽穗期的分子机制及其应用研究
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批准号:32301882
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2023
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负责人:朱义旺
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依托单位:
基于SSITKA-DFT-kMC的铁基模型催化剂上费托合成反应机理研究
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批准号:22372120
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:滕波涛
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依托单位:
基于有限元和DFT计算的超临界CO2/O2环境中碳钢—不锈钢电偶腐蚀及缓蚀机理研究
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批准号:52371064
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2023
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负责人:张国安
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依托单位:
基于DFT理论揭示多因素诱导的区域选择性机制指导高效合成C4-/C7-吲哚衍生物的研究
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批准号:--
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项目类别:地区科学基金项目
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资助金额:35万元
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批准年份:2021
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负责人:李金凤
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依托单位:
ZIFs限域多酸协同催化脱硝性能的DFT理论分析与实验研究
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批准号:22111530286
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项目类别:国际(地区)合作与交流项目
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资助金额:20万元
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批准年份:2021
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负责人:王睿
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依托单位:
基于DFT的FexCu2-x(OH)PO4可控合成及其对噬菌体病毒的吸附与Vis-NIR光催化灭活机制
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2021
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负责人:赵德强
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依托单位: