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Mechanism of bundle-like aggregation structure in populations of E. coli in the stationary phase

稳定期大肠杆菌群体束状聚集结构的机制

基本信息

批准号：
20J10682
负责人：
嶋屋拓朗
金额：
$ 1.34万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-24 至 2022-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

昨年度までは、束状凝集現象のメカニズム候補として、細胞サイズ分布の変化について調査を行っていた。本年度は、当初計画段階で考慮していた細胞外高分子(EPS)による枯渇引力の影響と、細胞の成長停止による影響を、本格的に調査した。まず、EPSによる束状凝集現象への影響を調べるために、EPS分泌を網羅的に阻害できるビスマスジメルカプロール(BisBAL)を投与した状態で、栄養飢餓下で束状凝集が引き起こされるかを調査した。すると、BisBALがない場合に比べて有意に束状凝集の頻度が下がることを発見し、EPSが束状凝集現象に関わっていることを立証した。また、EPSの網羅的な阻害だけではなく、細胞外蛋白質や膜小胞など具体的な物質による効果も調査し、EPSのみが束状凝集の主要因ではないことを見出した。そこで、飢餓による細胞成長の停止も束状凝集現象に関わることを以下の通り示した。まず、束状凝集の強さを定量的に評価する秩序変数を定義することに成功した。この秩序変数を用いて、飢餓による束状凝集が起きた後(束状凝集を引き起こすのに十分な量のEPSが分泌された後)に、再び栄養を供給し、細胞成長が再開した際の束構造の変化を評価した。すると、細胞成長の再開によって束構造が破壊されることを定量的に発見した。つまり、束状凝集現象には、EPSだけではなく、細胞成長の停止も重要であることを見出した。上記の結果の一部は国内学会にて発表済みであり、成果全体をまとめた論文は投稿準備中である。また、上記の研究のみならず、前年度に取り組んでいた、物質表面に固着したコロニーの調査を継続した。すると、局所的に細胞の向きが揃わない「トポロジカル欠陥」と呼ばれる場所で、細胞が決まった方向に三次元的に傾く「極性秩序」の創発を発見した。この内容は、論文としてarXivに公開済である。

Last year, the bundles of agglutination showed that they were waiting for the first time, and the cells were distributed in the first place. This year and at the beginning of the project, the extracellular high molecular weight (EPS) has a significant impact on the gravitational pull, the growth of the cell has no effect on the growth of the cell, and the growth of the cell has a negative effect on the growth of the cell. The cluster agglutination of EPS and EPS is similar to the impact of the impact on the network, the impact of the EPS secretion network, the impact on the network, the impact on the status, and the impact on the cluster agglutination on the network. The combination of BisBAL and EPS clumps is more common than that of intentional bundles and bundles of EPS. The main reasons for this are the blocking effect of the EPS network, the inhibition of the extracellular protein, the membrane cell of the extracellular protein, the specific product of the membrane cell, and the bundle agglutination of the EPS. The bundles of cell growth and growth are stopped as shown in the diagram below. Cluster agglutination is used to determine the number of quantitative data in the order of success. In the order of temperature, the number of cells is in the form of bundles of agglutination (after the bundles of agglutination are used to induce the release of EPS), then supply to the cells, and then open the bundles to make the bundles. The growth of the cells and the growth of the cells are necessary to make a quantitative analysis of the growth of the cells. Clump agglutination, bundle agglutination, EPS cell growth and cell growth stop the growth of important cells. According to the results of the previous paper, we are in the process of preparing for the submission of a copy of the report of the National Institute of Science and Technology and all the results. In the previous year, the system was selected for the previous year, and the surface of the material was fixed. The cells of the department and the bureau are in need of information on the three dimensions of the order of sex, the order of sex and the order of sex. Please check the content and text to make sure that the arXiv is open for public use.