Cooperative mechanism of molecular chaperone complexes revealed by a hybrid approach of paramagnetic NMR and Cryo-EM
Cooperative mechanism of molecular chaperone complexes revealed by a hybrid approach of paramagnetic NMR and Cryo-EM
批准号:
20J20761
负责人:
川越 聡一郎
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-24 至 2023-03-31
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細胞質で合成されたタンパク質の約3割は細胞質外へと輸送されるが、この生体膜をこえるタンパク質輸送においては、複数のシャペロンにより構成されるSec pathwayが主要な役割を担っている。本研究では、Sec pathwayにおける最初のステップである、trigger factor (TF) シャペロンとSecBシャペロンとの複合体形成反応に着目し、TF-SecB複合体の立体構造決定による相互作用様式の解明を目的としている。溶液NMR法、cryo-EM法どちらの測定手法についても、TFとSecBとの解離定数Kdが20 μM程度であることから予想される、TF-SecB複合体の安定性の低さが課題となる。そこで、安定なTF-SecB複合体を取得するため、共発現系によるTF-SecB複合体の調製に着手した。TFとSecBをペプチドリンカーにより連結したTF-SecBとSecB単体を共発現する系を構築し、この2種のベクターのコピー数の制御により、TF-SecBとSecBを1:3の比で発現させることに成功した。その結果、単離精製された目的タンパク質は、SEC-MALS測定により分子質量116 KDaと決定でき、これはSecBの四量体にTFが一分子だけ結合したTFmono-SecBtet複合体であると考えられた。TFmono-SecBtet複合体について高度安定同位体標識法を適用し、 NMR測定を行なった結果、TFとSecBとの間の会合界面に存在するメチル基間のNOE信号の観測に成功し、その構造計算によって、低分解能ながらも複合体構造の算出をすることができた。また、cryo-EMによる構造決定では、複合体全体の三次元密度マップは得られていないものの、部分的な密度マップを取得することには成功した。
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会议论文
The catalytic mechanism of a PPIase chaperone investigated by the structural analysis at the transition state using NMR and MD simulation
使用 NMR 和 MD 模拟通过过渡态结构分析研究 PPIase 伴侣的催化机制
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Soichiro Kawagoe, Tomohide Saio, Hiroshi Nakagawa , Hiroyuki Kumeta, Koichiro Ishimori]
通讯作者:
Koichiro Ishimori
転写因子Hsf1の多状態転移を駆動する相互作用ネットワークの構造基盤
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批准号:24K18063
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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财政年份:2024
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负责人:川越 聡一郎
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依托单位:
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批准号:23K19353
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项目类别:Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
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资助金额:$1.83万
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财政年份:2023
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负责人:川越 聡一郎
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依托单位:
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适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
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批准号:JCZRYB202500181
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负责人:
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用
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批准号:
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