课题基金 / 基金详情

Cooperative mechanism of molecular chaperone complexes revealed by a hybrid approach of paramagnetic NMR and Cryo-EM

Cooperative mechanism of molecular chaperone complexes revealed by a hybrid approach of paramagnetic NMR and Cryo-EM
顺磁核磁共振和冷冻电镜混合方法揭示分子伴侣复合物的协同机制
批准号:
20J20761
负责人:
川越 聡一郎
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-24 至 2023-03-31

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项目成果

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細胞質で合成されたタンパク質の約3割は細胞質外へと輸送されるが、この生体膜をこえるタンパク質輸送においては、複数のシャペロンにより構成されるSec pathwayが主要な役割を担っている。本研究では、Sec pathwayにおける最初のステップである、trigger factor (TF) シャペロンとSecBシャペロンとの複合体形成反応に着目し、TF-SecB複合体の立体構造決定による相互作用様式の解明を目的としている。溶液NMR法、cryo-EM法どちらの測定手法についても、TFとSecBとの解離定数Kdが20 μM程度であることから予想される、TF-SecB複合体の安定性の低さが課題となる。そこで、安定なTF-SecB複合体を取得するため、共発現系によるTF-SecB複合体の調製に着手した。TFとSecBをペプチドリンカーにより連結したTF-SecBとSecB単体を共発現する系を構築し、この2種のベクターのコピー数の制御により、TF-SecBとSecBを1:3の比で発現させることに成功した。その結果、単離精製された目的タンパク質は、SEC-MALS測定により分子質量116 KDaと決定でき、これはSecBの四量体にTFが一分子だけ結合したTFmono-SecBtet複合体であると考えられた。TFmono-SecBtet複合体について高度安定同位体標識法を適用し、 NMR測定を行なった結果、TFとSecBとの間の会合界面に存在するメチル基間のNOE信号の観測に成功し、その構造計算によって、低分解能ながらも複合体構造の算出をすることができた。また、cryo-EMによる構造決定では、複合体全体の三次元密度マップは得られていないものの、部分的な密度マップを取得することには成功した。
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Soichiro Kawagoe, Tomohide Saio, Hiroshi Nakagawa , Hiroyuki Kumeta, Koichiro Ishimori]
通讯作者: Koichiro Ishimori
転写因子Hsf1の多状態転移を駆動する相互作用ネットワークの構造基盤
  • 批准号:
    24K18063
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 资助金额:
    $3.0万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    川越 聡一郎
  • 依托单位:
Kinetic analysis of multivalent interaction regulating the dynamic molecular assembly
  • 批准号:
    23K19353
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
  • 资助金额:
    $1.83万
  • 财政年份:
    2023
  • 负责人:
    川越 聡一郎
  • 依托单位:
国内基金
海外基金
适用膜蛋白-配体复合物结构测定的1H和19F距离约束检测的固体NMR方法研究
  • 批准号:
    JCZRYB202500181
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2025
  • 负责人:
  • 依托单位:
NMR-CRISPR体系的构建及在肝癌ctDNA及miRNA联合检测中的应 用
基于 NMR 指纹特征图谱与代谢组学结合模式追踪土家药 血筒果实中抗类风湿关节炎的效应物质
  • 批准号:
    2024JJ6347
  • 项目类别:
    省市级项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    苏维
  • 依托单位:
基于ResNet-CNN和2D1H.13C HSQC NMR技术的多基原藏药'阿布卡'品质整合评控体系构建
  • 批准号:
    --
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
  • 资助金额:
    --
  • 批准年份:
    2024
  • 负责人:
    杜欢
  • 依托单位: