ユビキチン修飾による鉄代謝制御系の最上流因子の探索
ユビキチン修飾による鉄代謝制御系の最上流因子の探索
批准号:
20J20906
负责人:
市原 知哉
金额:
$1.6万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-24 至 2023-03-31
中文摘要
本研究は、FBXL5を分解制御する因子を同定することを目的とする。予備的実験においてFBXL5の分解を蛍光でモニターできるレポーター細胞を作製した。CRISPR/Cas9システムを用いたゲノムワイドスクリーニングをおこなうために、レンチウイルスを用いてsgRNA (single guide RNA)ライブラリーを蛍光レポーター細胞に導入した。ライブラリー導入細胞の中で鉄欠乏条件下において蛍光が安定化している細胞集団をセルソーターで回収し、次世代シークエンサー解析により回収後の細胞に濃縮されたsgRNA配列を探索した。しかしながら、回収できた蛍光安定化細胞はごく少数であったため、今回の解析では統計学的に有意に回収後の細胞に濃縮されたsgRNA配列を同定することが出来なかった。並行して、生化学的手法によるスクリーニングをおこなった。FBXL5の野生型鉄結合ドメインまたはデグロンを欠損した変異型鉄結合ドメインを過剰発現した細胞を用いてIP-MSをおこない、野生型鉄結合ドメインに特異的に結合するユビキチンリガーゼを複数同定した。しかし、これらの候補因子を個別にノックダウンしてもFBXL5の安定化を確認することが出来なかった。この結果は、FBXL5の分解制御に複数のユビキチンリガーゼが関与している可能性を示唆しており、さらに文献情報を踏まえると、ある一群のユビキチンリガーゼが協調的にFBXL5を分解制御しているという仮説が考えられる。
英文摘要
本研究は、FBXL5を分解制御する因子を同定することを目的とする。予備的実験においてFBXL5の分解を蛍光でモニターできるレポーター細胞を作製した。CRISPR/Cas9システムを用いたゲノムワイドスクリーニングをおこなうために、レンチウイルスを用いてsgRNA (single guide RNA)ライブラリーを蛍光レポーター細胞に導入した。ライブラリー導入細胞の中で鉄欠乏条件下において蛍光が安定化している細胞集団をセルソーターで回収し、次世代シークエンサー解析により回収後の細胞に濃縮されたsgRNA配列を探索した。しかしながら、回収できた蛍光安定化細胞はごく少数であったため、今回の解析では統計学的に有意に回収後の細胞に濃縮されたsgRNA配列を同定することが出来なかった。並行して、生化学的手法によるスクリーニングをおこなった。FBXL5の野生型鉄結合ドメインまたはデグロンを欠損した変異型鉄結合ドメインを過剰発現した細胞を用いてIP-MSをおこない、野生型鉄結合ドメインに特異的に結合するユビキチンリガーゼを複数同定した。しかし、これらの候補因子を個別にノックダウンしてもFBXL5の安定化を確認することが出来なかった。この結果は、FBXL5の分解制御に複数のユビキチンリガーゼが関与している可能性を示唆しており、さらに文献情報を踏まえると、ある一群のユビキチンリガーゼが協調的にFBXL5を分解制御しているという仮説が考えられる。
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Identification and characterization of novel proteins associated with CHD4
与 CHD4 相关的新型蛋白质的鉴定和表征
DOI:
10.1111/gtc.12909
发表时间:
2021
期刊:
Genes to Cells
影响因子:
2.1
作者:
[Sakaguchi Chihiro, Ichihara Kazuya, Nita Akihiro, Katayama Yuta, Nakayama Keiichi I.]
通讯作者:
Nakayama Keiichi I.
セントラルドグマの新常識
中心法则新常识
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山崎智弘, 山本哲也, 廣瀬哲郎(担当, 分担執筆, 範囲:RNAの新常識6:細胞内構造体の骨格として働くRNA)]
通讯作者:
範囲:RNAの新常識6:細胞内構造体の骨格として働くRNA)
精密な翻訳開始点の同定により明らかとなったNon-AUG翻訳開始の分子機構と生物学的意義
通过精确翻译起始位点的鉴定揭示非AUG翻译起始的分子机制和生物学意义
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[市原 知哉, 松本 有樹修, 中山 敬一]
通讯作者:
中山 敬一
翻訳開始因子eIF2Dは翻訳伸長中の内発的リボソーム不安定化 (IRD)を抑制する
翻译起始因子 eIF2D 在翻译延伸过程中抑制内源性核糖体不稳定 (IRD)
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[市原 知哉, 松本 有樹修, 幡野 敦, 松本 雅記, 茶谷 悠平, 田口 英樹, 中山 敬一]
通讯作者:
中山 敬一
eIF2D surveils intrinsic ribosome destabilization (IRD) during translation elongation
eIF2D 监测翻译延伸过程中内在核糖体不稳定 (IRD)
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[市原 知哉, 幡野 敦, 松本 雅記, 茶谷 悠平, 田口 英樹, 中山 敬一, 松本 有樹修]
通讯作者:
松本 有樹修
共 6 条
内発的リボソーム不安定化 (IRD)におけるeIF2Dの機能解明
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批准号:24K18054
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:市原 知哉
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依托单位:
海外基金