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異質三倍体ブラーミニメクラヘビの現生親種系統の探索とミトゲノム両性遺伝現象の実証

寻找现生异源三倍体婆罗门盲蛇亲本谱系并论证线粒体基因组中的雌雄同体遗传现象

基本信息

批准号：
20J22729
负责人：
神林千晶
金额：
$ 2.18万
依托单位：
Nagahama Institute of Bio-Science and Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2020
资助国家：
日本
起止时间：
2020-04-24 至 2023-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

異種間交雑によって生じた異質三倍体のブラーミニメクラヘビについて、（１）親種の探索、（２）ミトコンドリアゲノムの両性遺伝現象の実証、（３）本種の属するインドメクラヘビ属の分類学的再検討を目的として研究を行った。（１）親種の探索については、南アジア２カ国（スリランカ・バングラデシュ）からメクラヘビ類のサンプルを輸送頂くことで研究を遂行した。ブラーミニメクラヘビから発見された２種類のmtDNA様配列（以下、既知mtDNAをタイプA、新規発見mtDNAをタイプBとする）を用いて系統解析を行った結果、タイプBはブラーミニメクラヘビとは異なる種のクレードに内包され、これが本種の父親系統であると考えられた。一方、タイプAはインドから報告されているインドメクラヘビ種と近縁になり（塩基配列類似性95%）、本種はブラーミニメクラヘビの有力な母親種候補となった。（３）分類学的再検討のためには南アジア地域でのサンプリングが不可欠であったが、新型コロナウイルスの影響で海外渡航が叶わなかった。しかしながら、（１）によってインドメクラヘビ属における種多様性の高さや未記載種の存在が浮き彫りになり、分類学的研究の必要性が改めて示された。また、（２）ミトゲノム両性遺伝の実証については、昨年度までの研究によりタイプBが核移行したmtDNA（NUMT）である可能性が示されていたことから、ブラーミニメクラヘビの全ゲノム配列の決定を行った。得られたドラフトゲノムを解析したところ、実際に核DNA配列に隣接した19 kbに及ぶmtDNA様配列が発見され、タイプBがNUMTであることが明らかになった。（１）の研究結果と合わせ、タイプBは異種間交雑時に導入された父方由来のNUMTである可能性が高いと考えられた。

The purpose of this study is to investigate the genetic diversity of heterotriploids,(1) the exploration of parent species,(2) the demonstration of the genetic diversity of heterotriploids,(3) the reexamination of the taxonomic characteristics of the genus. (1) The parent species is explored in the middle and south of the country.(2) The research is carried out in the top of the country. The mtDNA alignment of two species (hereinafter, known mtDNA A, new mtDNA B) was analyzed by system analysis. The results showed that mtDNA B was the parent system of this species. A party, A party (3) Taxonomic re-examination and discussion of the influence of new types of taxonomies on overseas voyages. The diversity of species is high, and the existence of unrecorded species is high. The necessity of taxonomic research is also shown. (2) The possibility of nuclear transition (NUMT) is shown in the study conducted last year. The DNA sequence was analyzed, and the DNA sequence was found to be adjacent to 19 kb, and the mtDNA sequence was found to be adjacent to NUMT. (1) The results of this study show that the possibility of introducing NUMT from parents is high when heterosexual interactions occur.