In situエピジェネティクス:分化・発生のH3K27me3機能解析の新戦略
In situエピジェネティクス:分化・発生のH3K27me3機能解析の新戦略
批准号:
20K06449
负责人:
新井 大祐
金额:
$2.83万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2020
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2020-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
ヒストンH3の27番目のリジンのトリメチル化(H3K27me3)によるエピジェネティック制御は分化・発生に伴う遺伝子の使い分けの基盤として重要視されているが、従来の研究ではゲノム上の特定の領域のH3K27me3(in situ H3K27me3)が対応する遺伝子の制御に本当に関与しているのか、重要なのはH3K27me3ではなくPRC2の非触媒性機能ではないか、という問題が放置されていた。本研究では「ゲノム上の特定の領域のH3K27me3の機能解析(in situエピジェネティクス)」の手法を確立し、細胞分化に伴うNodal遺伝子のH3K27me3による制御機構の解明を目指している。H3K27me3とPRC2自身のどちらが機能に必要なのかを調べるために、H3K27me3の機能とPRC2の非触媒性の機能を独立にON・OFF可能なES細胞(PRC2スイッチES細胞)の作出を進めている。PRC2は触媒サブユニットとしてEZH2とEZH1のどちらか一つを含む。当初計画では内在性のEZH2をAID法により分解除去する予定だったが、最近、分解効果と特異性の高いAID2法が発表されたため、こちらを採用することとした。OsTIR(F74G)の発現カセットと酵素活性を持たないEZH2変異体のTet-ON発現カセットをROSA26領域にノックイン導入したES細胞株を樹立した。本研究において開発されたノックイン新手法(BiPoD法)は2領域への同時両アリルノックインが可能である。ES細胞の分化能を保つためには、細胞株樹立に要する時間は短いほど望ましい。そこでEzh1遺伝子全長の欠失とEzh2 C末端へのAIDタグの挿入を同時に行えるか、条件を検討した。
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マウスES細胞に対する高効率な両アリルノックイン手法の開発
小鼠ES细胞高效双等位基因敲入方法的开发
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[小野寺絵麻, 藤井秀司, 中村吉伸, 遊佐真一, 新井大祐,中尾洋一]
通讯作者:
新井大祐,中尾洋一
DOI:
10.1038/s41598-021-97579-8
发表时间:
2021-09-13
期刊:
Scientific reports
影响因子:
4.6
作者:
[Arai D, Nakao Y]
通讯作者:
Nakao Y
DOI:
10.1021/acs.jafc.2c00020
发表时间:
2022-03-16
期刊:
Journal of agricultural and food chemistry
影响因子:
6.1
作者:
[Otsuka S, Kawamura M, Fujino S, Nakamura F, Arai D, Fusetani N, Nakao Y]
通讯作者:
Nakao Y
Improvement of homology-directed repair-mediated knock-in efficiency in mouse embryonic stem cells by using small compounds
使用小化合物提高小鼠胚胎干细胞同源修复介导的敲入效率
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Arai, D.; Nakao, Y.]
通讯作者:
Y.
実験医学2022年2月号『BiPoD:正確かつ高効率な両アレルノックイン新手法』
实验医学2022年2月号“BiPoD:新型准确高效的双等位基因敲入方法”
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hashimoto M, Goto A, Endo Y, Sugimoto M, Ueda J, and Yamashita H, 新井大祐]
通讯作者:
新井大祐
エピゲノム解析による蝸牛支持細胞の遺伝子発現制御機構の全体像の解明
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批准号:23K08997
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2023
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负责人:新井 大祐
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依托单位:
ポリコーム遺伝子群による左右軸形成のエピジェネティック制御
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批准号:09J04214
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.9万
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财政年份:2009
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负责人:新井 大祐
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依托单位:
海外基金