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Regime shifts in coastal marine ecosystems: an empirical approach based on advanced monitoring and nonlinear dynamical theory

Regime shifts in coastal marine ecosystems: an empirical approach based on advanced monitoring and nonlinear dynamical theory
沿海海洋生态系统的政权转变:基于先进监测和非线性动力学理论的实证方法
批准号:
19H05641
负责人:
近藤 倫生
金额:
$127.88万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-06-26 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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魚類を中心とした群集変動を観測し、レジームシフトを検出するために稼働する、全国多地点での高頻度環境DNA観測網「ANEMONE」は順調に稼働している。大学や国研による観測に加えて、市民連携観測や企業・自治体と連携した調査も実施され、毎週から毎月の観測を実施、今後の追加分析を可能にする抽出DNAサンプルも蓄積している。今年度は80以上の地点より800以上の試料を得た。14地点では毎週の高頻度観測が実施できた。DNA配列データ、環境DNAメタバーコーディングパイプラインClaidentを利用して獲得したオカレンスデータは、社会での利用を促進するため、2022年6月に実験条件と調査情報とともにオープンデータベース「ANEMONE DB」において公開した。また、データ解析については、環境DNA時系列データに適用する事で群集構造や種間相互作用、環境との因果関係、力学的安定性を評価するための従来手法の改善、新手法の開発を進めた。特にレジームシフトの機構に関しては、多種の時系列データをもとに群集構造の変化を抽出し、別途推定した安定性の時間変化と対応させることで、レジームシフトがどのように群集動態の力学的安定性と関連するかを明らかにする手法開発に成功した。このほかにも昨年度に引き続き、群集生態学における種間相互作用係数に対応するヤコビアンを時系列データから高精度に推定するLMDr (Local Manifold Distance regression)の開発に成功し、この手法を実データ(長期海洋・湖沼生態系プランクトン観測データ)に適用することで、群集動態の非線形性を駆動する環境要因の特定が可能であることを確認した。ANEMONE観測データを活用した解析も行い、適切な時系列解析によって地域間の動的類似性を駆動する環境・生物要因を特定可能であることを確認できた。
期刊论文(129)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1007/s10164-019-00605-6
发表时间: 2019
期刊: Journal of Ethology
影响因子: 0.9
作者: [Kohji Takahashi, Reiji Masuda]
通讯作者: Reiji Masuda
ANEMONE: All Nippon eDNA Monitoring Network
ANEMONE:全日本 eDNA 监控网络
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
環境DNAから見たクロダイの河川進入の季節性と地域性
从环境DNA看黑鲷入河的季节性和区域特征
DOI: --
发表时间: 2023
期刊:
影响因子: --
作者: [笹野祥愛・村上弘章・河合賢太郎・海野徹也・山下洋・益田玲爾]
通讯作者: 笹野祥愛・村上弘章・河合賢太郎・海野徹也・山下洋・益田玲爾
Ocean as Core Biome
海洋作为核心生物群落
DOI: --
发表时间: 2022
期刊:
影响因子: --
作者: [Nanaura Hitoki, Aiba Yuichiro, Nakanishi Mari, Shiota Tomo, Hibino Masaki, Kikuchi Sotaro, Nagata Riko, Morikawa Naritaka, Iguchi Naohiko, Kiriyama Takao, Nagamori Shushi, Sugie Kazuma, Saio Tomohide, Yoshizawa Takuya, Mori Eiichiro et al., Masuda R.]
通讯作者: Masuda R.
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    在来・外来種間の遭遇経験の欠如と獲得が生物学的侵入において果たす役割に関する理論
    • 批准号:
      17770022
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
    • 资助金额:
      $1.09万
    • 财政年份:
      2005
    • 负责人:
      近藤 倫生
    • 依托单位:
    生態系の物質リサイクル系における生物多様性の役割と創出・維持機構
    • 批准号:
      01J02948
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $2.3万
    • 财政年份:
      2001
    • 负责人:
      近藤 倫生
    • 依托单位:
    海外基金