Molecular mechanisms of a Condensin molecular motor explored by DNA curtain assays and coarse-grained molecular dynamics simulations

通过 DNA 帘式分析和粗粒度分子动力学模拟探索 Condensin 分子马达的分子机制

• 批准号: 19H03194
• 负责人: Terakawa Tsuyoshi
• 金额: $ 11.56万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19H03194/
• 关键词: １分子蛍光イメージング; DNAカーテン; 粗視化分子動力学シミュレーション; コンデンシン; 蛍光顕微鏡観察; 一分子実験; 分子モーター

项目成果

The lane switch mechanism: Nucleosome repositioning induced by a DNA translocase

泳道切换机制：DNA 易位酶诱导的核小体重新定位

• 发表时间: 2021
• 作者: Fritz Nagae;Giovanni B. Brandani;Shoji Takada;Tsuyoshi Terakawa
• 通讯作者: Tsuyoshi Terakawa

Evaluation of DNA binding of yeast replisome toward single-molecule observation of DNA replication

评估酵母复制体的 DNA 结合对 DNA 复制的单分子观察

• 发表时间: 2021
• 作者: Mayu S. Terakawa;Tsuyoshi Terakawa
• 通讯作者: Tsuyoshi Terakawa

Reconstitution of protein functions on chromatin curtain

染色质幕上蛋白质功能的重建

• 发表时间: 2020
• 作者: Fritz Nagae;Giovanni B. Brandani;Shoji Takada;Tsuyoshi Terakawa;寺川剛
• 通讯作者: 寺川剛

Molecular dynamics simulations of the yeast condensin holo complex towards elucidation of the mechanism of DNA loop extrusion

酵母凝缩蛋白全息复合物的分子动力学模拟，以阐明 DNA 环挤出的机制

• 发表时间: 2021
• 作者: Hiiroki Koide;Shoji Takada;Tsuyoshi Terakawa
• 通讯作者: Tsuyoshi Terakawa

Molecular mechanism of MutS sliding on DNA explored by coarse-grained molecular dynamics simulations

粗粒度分子动力学模拟探索 MutS 在 DNA 上滑动的分子机制

• 发表时间: 2021
• 作者: Keisuke Inoue;Shoji Takada;Tsuyoshi Terakawa
• 通讯作者: Tsuyoshi Terakawa