Molecular design of real proteins in virtual space

虚拟空间中真实蛋白质的分子设计

基本信息

项目摘要

项目成果

期刊论文数量(8)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Engineering Stability, Viscosity, and Immunogenicity of Antibodies by Computational Design
  • DOI:
    10.1016/j.xphs.2020.01.011
  • 发表时间:
    2020-05-01
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.8
  • 作者:
    Kuroda, Daisuke;Tsumoto, Kouhei
  • 通讯作者:
    Tsumoto, Kouhei
How the protonation state of a phosphorylated amino acid governs molecular recognition: insights from classical molecular dynamics simulations
磷酸化氨基酸的质子化状态如何控制分子识别:经典分子动力学模拟的见解
  • DOI:
    10.1002/1873-3468.13674
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Kawade Raiji;Kuroda Daisuke;Tsumoto Kouhei
  • 通讯作者:
    Tsumoto Kouhei
Addressing the Benefits of Simulations in Computer-aided Antibody Engineering
发挥计算机辅助抗体工程中模拟的优势
  • DOI:
  • 发表时间:
    2019
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Mihara Jun-ichi;Fujimoto Kenzo;Daisuke Kuroda
  • 通讯作者:
    Daisuke Kuroda
Per-Residue Program of Multiple Backbone Dihedral Angles of β-Peptoids via Backbone Substitutions
  • DOI:
    10.1021/jacs.9b10496
  • 发表时间:
    2020-02-05
  • 期刊:
  • 影响因子:
    15
  • 作者:
    Morimoto, Jumpei;Kim, Jungyeon;Sando, Shinsuke
  • 通讯作者:
    Sando, Shinsuke
Effects of a remote mutation from the contact paratope on the structure of CDR-H3 in the anti-HIV neutralizing antibody PG16
  • DOI:
    10.1038/s41598-019-56154-y
  • 发表时间:
    2019-12-27
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.6
  • 作者:
    Kondo, Hiroko X.;Kiribayashi, Ryo;Takano, Yu
  • 通讯作者:
    Takano, Yu
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

Kuroda Daisuke其他文献

高速回転球殻内の熱対流により引き起こされる表面縞状構造への超粘性の影響
超粘性对快速旋转球壳中热对流引起的表面条纹的影响
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hasegawa Sunao;Kasuga Toshihiro;Usui Fumihiko;Kuroda Daisuke;佐々木洋平,竹広真一,石岡圭一,榎本剛,中島健介,林祥介
  • 通讯作者:
    佐々木洋平,竹広真一,石岡圭一,榎本剛,中島健介,林祥介
Oligo(N‐methylalanine) as a Peptide‐Based Molecular Scaffold with a Minimal Structure and High Density of Functionalizable Sites
寡聚(N-甲基丙氨酸)作为基于肽的分子支架,具有最小的结构和高密度的功能位点
  • DOI:
    10.1002/anie.202200119
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yokomine Marin;Morimoto Jumpei;Fukuda Yasuhiro;Shiratori Yota;Kuroda Daisuke;Ueda Takumi;Takeuchi Koh;Tsumoto Kouhei;Sando Shinsuke
  • 通讯作者:
    Sando Shinsuke
Cold Atoms and Molecules
冷原子和分子
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Geem Jooyeon;Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P.;Kuroda Daisuke;Naito Hiroyuki;Hanayama Hidekazu;Kim Yoonyoung;Kwon Yuna G.;Jin Sunho;Sekiguchi Tomohiko;Okazaki Ryo;Vaubaillon Jeremie J.;Imai Masataka;Oono Tatsuharu;Futamura Yuki;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Masatoshi Kajita
  • 通讯作者:
    Masatoshi Kajita
Polarimetric properties of the near-Sun asteroid (155140) 2005 UD in comparison with other asteroids and meteoritic samples
近太阳小行星 (155140) 2005 UD 的偏振特性与其他小行星和陨石样本的比较
  • DOI:
    10.1093/mnras/stab3198
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    4.8
  • 作者:
    Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P;Geem Jooyeon;Naito Hiroyuki;Kuroda Daisuke;Im Myungshin;Lee Myung Gyoon;Seo Jinguk;Jin Sunho;Kwon Yuna G;Oono Tatsuharu;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Kuramoto Kiyoshi;Ito Takashi;Hasegawa Sunao;Yoshida Fumi;他12名
  • 通讯作者:
    他12名
Review of theoretical models explaining the XENON1T excess
解释 XENON1T 过量的理论模型回顾
  • DOI:
  • 发表时间:
    2020
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Geem Jooyeon;Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P.;Kuroda Daisuke;Naito Hiroyuki;Hanayama Hidekazu;Kim Yoonyoung;Kwon Yuna G.;Jin Sunho;Sekiguchi Tomohiko;Okazaki Ryo;Vaubaillon Jeremie J.;Imai Masataka;Oono Tatsuharu;Futamura Yuki;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Masatoshi Kajita;高橋 史宜
  • 通讯作者:
    高橋 史宜

Kuroda Daisuke的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('Kuroda Daisuke', 18)}}的其他基金

Engineering antibody stability using molecular simulations and machine learning
使用分子模拟和机器学习工程抗体稳定性
  • 批准号:
    17K18113
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 10.98万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
Development of antibody modeling methods toward rational antibody design
开发抗体建模方法以实现合理的抗体设计
  • 批准号:
    15H06606
  • 财政年份:
    2015
  • 资助金额:
    $ 10.98万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

相似海外基金

共溶媒分子動力学計算を用いた薬剤標的タンパク質の選抜と環状ペプチド設計の同時実行
使用共溶剂分子动力学计算同时执行药物靶蛋白选择和环肽设计
  • 批准号:
    23K28185
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 10.98万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
安全な抗菌ペプチドのin silico分子設計へ資する分子動力学法と機械学習による研究
使用分子动力学方法和机器学习的研究有助于安全抗菌肽的计算机分子设计
  • 批准号:
    24K18085
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 10.98万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
アレルギー免疫療法の高度化に向けたリン酸化ペプチドの合理的設計と実用的応用
先进过敏免疫治疗磷酸化肽的合理设计与实际应用
  • 批准号:
    24K01697
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 10.98万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
環状ペプチドの複合体構造データベース構築と分子設計技術の開発
环肽复杂结构数据库构建及分子设计技术发展
  • 批准号:
    23K28186
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 10.98万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
脂質二重膜透過アッセイ系と人工知能による膜透過性環状ペプチドの合理的設計
利用脂质双层膜渗透检测系统和人工智能合理设计可渗透膜的环肽
  • 批准号:
    23K27311
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 10.98万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了