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Engineering antibody stability using molecular simulations and machine learning

使用分子模拟和机器学习工程抗体稳定性

基本信息

批准号：
17K18113
负责人：
Kuroda Daisuke
金额：
$ 2.66万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份：
2017
资助国家：
日本
起止时间：
2017-04-01 至 2020-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

项目成果

期刊论文数量（15）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

MD法による抗HIV抗体PG16のCDR-H3の変異における中和能への影響の解析

MD法分析抗HIV抗体PG16的CDR-H3突变对中和能力的影响

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
桐林遼;近藤寛子;黒田大祐;齋藤徹;香田次郎;釘宮章光;中野靖久;鷹野優
通讯作者：
鷹野優

コンピュータ技術を用いたタンパク質のモデリング計算とその応用

计算机技术的蛋白质建模计算及其应用

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
KAWADE;Raiji; AKIBA;Hiroki; NAKAKIDO;Makoto; KURODA;Daisuke; MARUYAMA;Toshiaki; OKUMURA;Shigeru; ENTZMINGER;Kevin; CAAVEIRO;Jose; TSUMOTO;Kouhei;黒田大祐
通讯作者：
黒田大祐

Analysis of the denaturation midpoint to design the VHH with high thermal stability

变性中点分析设计高热稳定性VHH

DOI：
发表时间：
2018
期刊：
影响因子：
0
作者：
Emina Ikeuchi,Daisuke Kuroda;Makoto Nakakido;Maiko Yoshida;Narutoshi Tsukahara;Akikazu Murakami;Kouhei Tsumoto
通讯作者：
Kouhei Tsumoto

抗原配列の硫酸化が抗体との相互作用に与える影響の熱力学的解析

抗原序列硫酸化对与抗体相互作用影响的热力学分析

DOI：
发表时间：
2017
期刊：
影响因子：
0
作者：
宮鍋一紘;秋葉宏樹;カアベイロホセ;黒田大祐;中木戸誠;高松祐一郎;山下雄史;津本浩平
通讯作者：
津本浩平

Intramolecular H-bonds govern the recognition of a flexible peptide by an antibody

DOI：
10.1093/jb/mvy032
发表时间：
2018-07-01
期刊：
JOURNAL OF BIOCHEMISTRY
影响因子：
2.7
作者：
Miyanabe, Kazuhiro;Akiba, Hiroki;Tsumoto, Kouhei
通讯作者：
Tsumoto, Kouhei

DOI：
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作者：
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作者：
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Kuroda Daisuke其他文献

高速回転球殻内の熱対流により引き起こされる表面縞状構造への超粘性の影響

超粘性对快速旋转球壳中热对流引起的表面条纹的影响

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
Hasegawa Sunao;Kasuga Toshihiro;Usui Fumihiko;Kuroda Daisuke;佐々木洋平,竹広真一,石岡圭一,榎本剛,中島健介,林祥介
通讯作者：
佐々木洋平,竹広真一,石岡圭一,榎本剛,中島健介,林祥介

Cold Atoms and Molecules

冷原子和分子

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Geem Jooyeon;Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P.;Kuroda Daisuke;Naito Hiroyuki;Hanayama Hidekazu;Kim Yoonyoung;Kwon Yuna G.;Jin Sunho;Sekiguchi Tomohiko;Okazaki Ryo;Vaubaillon Jeremie J.;Imai Masataka;Oono Tatsuharu;Futamura Yuki;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Masatoshi Kajita
通讯作者：
Masatoshi Kajita

Oligo(N‐methylalanine) as a Peptide‐Based Molecular Scaffold with a Minimal Structure and High Density of Functionalizable Sites

寡聚（N-甲基丙氨酸）作为基于肽的分子支架，具有最小的结构和高密度的功能位点

DOI：
10.1002/anie.202200119
发表时间：
2022
期刊：
Angewandte Chemie International Edition
影响因子：
0
作者：
Yokomine Marin;Morimoto Jumpei;Fukuda Yasuhiro;Shiratori Yota;Kuroda Daisuke;Ueda Takumi;Takeuchi Koh;Tsumoto Kouhei;Sando Shinsuke
通讯作者：
Sando Shinsuke

Review of theoretical models explaining the XENON1T excess

解释 XENON1T 过量的理论模型回顾

DOI：
发表时间：
2020
期刊：
影响因子：
0
作者：
Geem Jooyeon;Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P.;Kuroda Daisuke;Naito Hiroyuki;Hanayama Hidekazu;Kim Yoonyoung;Kwon Yuna G.;Jin Sunho;Sekiguchi Tomohiko;Okazaki Ryo;Vaubaillon Jeremie J.;Imai Masataka;Oono Tatsuharu;Futamura Yuki;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Masatoshi Kajita;高橋　史宜
通讯作者：
高橋　史宜

Polarimetric properties of the near-Sun asteroid (155140) 2005 UD in comparison with other asteroids and meteoritic samples

近太阳小行星 (155140) 2005 UD 的偏振特性与其他小行星和陨石样本的比较

DOI：
10.1093/mnras/stab3198
发表时间：
2021
期刊：
Monthly Notices of the Royal Astronomical Society
影响因子：
4.8
作者：
Ishiguro Masateru;Bach Yoonsoo P;Geem Jooyeon;Naito Hiroyuki;Kuroda Daisuke;Im Myungshin;Lee Myung Gyoon;Seo Jinguk;Jin Sunho;Kwon Yuna G;Oono Tatsuharu;Takagi Seiko;Sato Mitsuteru;Kuramoto Kiyoshi;Ito Takashi;Hasegawa Sunao;Yoshida Fumi;他12名
通讯作者：
他12名