高選択的に標的核酸塩基を認識可能な人工核酸の創製と核酸医薬への展開
高度选择性识别靶碱基的人工核酸的构建及其核酸药物的开发
基本信息
- 批准号:19J10113
- 负责人:
- 金额:$ 1.09万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2019
- 资助国家:日本
- 起止时间:2019-04-25 至 2021-03-31
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
平成31(令和元)年度は、環構造を拡張したチミジン誘導体2-オキソベンゾ[b][1,8]ナフチリジン骨格を有する人工核酸OBNを含むオリゴ核酸の更なる物性評価のため、以下の実験を行った。・環拡張によるスタッキング相互作用の向上が示唆されたOBNを含むオリゴ核酸の三重鎖形成能を評価し、アンチジーン法への応用の可能性を精査した。その結果、OBNを含む三重鎖形成核酸(TFO)は標的の二重鎖DNAに対し、概ね三重鎖形成能を向上させた。特にOBNを連続で含むTFOで、その傾向が顕著であった。これは設計通り、OBN同士がTFO中で積層することで、スタッキングとそれに伴う三重鎖形成能を向上させるためだと推察された。・標的となる標的オリゴ核酸中のアデニン塩基とのより選択的で強固な水素結合の形成を目指し、OBN塩基部8位にカルボキシメトキシ基(8-CMO)を導入したOBN8-CMOのモノマー合成に着手した。16工程を経てOBN8-CMOをDNA自動合成機に適用可能な化合物へと変換後、本分子を含むオリゴ核酸を合成した。予期に反し、本オリゴ核酸の二重鎖形成能は相補鎖DNA、RNAの双方に対して低下した。分子モデリング結果から、相補鎖DNAとの二重鎖形成において、OBN8-CMOと隣接する核酸塩基とのスタッキングが芳しくなく、オリゴ鎖内の平面構造を乱す可能性が示された。具体的には置換基の導入により、二重鎖形成能を低下させる電子密度変化が生じていると示唆された。CDスペクトルの結果から、OBN8-CMOを含むオリゴ核酸と相補鎖DNA、並びにRNAとの二重鎖形成の際の顕著な二重鎖構造の変化は誘起されなかったことより、分子設計コンセプト自体の正しさは示唆された。以上よりベンゾナフチリジン骨格に、二重鎖形成能を向上させる置換基を導入する難度の高さが示され、その様式もフェノキサジン環と異なることが示された。
Pingcheng 31 (Ling and Yuan) year, the following is the following: artificial nucleic acid OBN contains artificial nucleic acid, nucleic acid content, physical property, physical property, physical property and so on. The environmental protection system (OBN) has been used to indicate and abet the possibility of triple formation of nucleic acid (Nucleic acid) containing DNA in the environment. The results showed that OBN contained double DNA nucleic acid (TFO) nucleic acid, and almost triple nucleic acid could be formed upwards. The special OBN link contains "TFO" and "click" in the direction of the link. The design of the device, the OBN and the customer in the TFO have the ability to improve the performance of the device by the formation of a triple device. In the nucleic acid of OBN, the selected fortified water binds to form the target, and the base 8 of the OBN8-CMO is inserted into the target OBN8-CMO. 16 the engineering engineering OBN8-CMO DNA automatic synthesis machine has been used to synthesize nucleic acid in this molecule after the treatment of the possible compound. It is expected that the double formation of nucleic acid and nucleic acid can interact with each other, DNA and RNA. The results show that the molecular structure, the DNA phase, the nucleic acid base, and the inner plane of the OBN8-CMO bond show the possibility of chaos. Specific devices can be used to reduce the density of electrons, and the formation of duplex can be used to reduce the density of electrons. The results of the CD test results, the OBN8-CMO contains the nucleic acid sequence of the nucleic acid sequence DNA, and the combination of RNA and DNA results in the formation of a two-fold system in the world, and the molecular design protocol is used to detect the presence of the virus. The above information is related to the structure of the bone and the formation of the double structure, which can be used to increase the temperature of the environment.
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Evaluation of oligonucleotides containing tricyclic 2-oxobenzo[b][1,8]naphthyridine that targets adenine nucleobase
含有靶向腺嘌呤核碱基的三环 2-氧代苯并[b][1,8]萘啶的寡核苷酸的评估
- DOI:
- 发表时间:2020
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:KISHIMOTO;Yuki; FUJII;Akane; NOZAKI;Natsumi; NAKAGAWA;Osamu; OBIKA;Satoshi
- 通讯作者:Satoshi
2-オキソベンゾ[b][1,8]ナフチリジン骨格を導入した新規人工塩基核酸の二重鎖・三重鎖形成能評価
引入2-氧代苯并[b][1,8]萘啶骨架的新型人工碱基核酸双链体/三链体形成能力的评价
- DOI:
- 发表时间:2019
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:岸本 悠希;藤井 茜;野崎 夏実;中川 治;小比賀 聡
- 通讯作者:小比賀 聡
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岸本 悠希其他文献
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