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世界流行を引き起こしている新興家畜由来サルモネラの環境抵抗性と宿主内生残性の解析

造成全球流行病的新出现的畜源性沙门氏菌的环境抵抗力和宿主生存分析

基本信息

批准号：
19J10415
负责人：
新井暢夫
金额：
$ 1.09万
依托单位：
Osaka Prefecture University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-25 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19J10415/
关键词：
Salmonella Typhimurium 家畜サルモネラ症小進化

项目摘要

これまでに我々はSalmonella Typhimurium（ST）と非定型（単相変異型）STを9つの遺伝子型に区分できるSNP遺伝子型別法を開発し、過去40年間に国内の家畜から分離された菌株の遺伝子型変遷を調べてきた。本研究では近年の最優勢系統であり、ほとんどが非定型STで構成されるSNP9型の小進化と本系統が特異的に保有するSalmonella genomic island 3（SGI3）の機能を明らかにすることを目的とした。1998～2017年に日本とイタリアで分離されたSNP9型STと非定型ST、227株の全ゲノム塩基配列を解読し、さらに公共データベースから非定型ST 3株の全ゲノム情報を加えて時系列系統解析を実施した。その結果、1998年に分離されたSTの2株と非定型STは共通祖先を有することがわかった。この2株はSNP9型を特徴づける複合トランスポゾン（Tn）を2相鞭毛抗原遺伝子（fljB）の近傍に保有していた。2000年頃の分岐を基準にサブクレード1と2に区分できた。サブクレード1はTn由来IS26の分子内転移によりfljBを欠失したと考えられた。サブクレード2ではその欠失範囲が拡大するとともに複数のプロファージが欠失していた。一方、両クレードで複数の薬剤耐性遺伝子を搭載したプラスミドの獲得が認められ、多剤耐性化が進行していた。SGI3の構造及び伝達試験の結果から、本因子が可動性遺伝因子の1つであるintegrative and conjugative elementであることが明らかとなった。続いてトランスコンジュガントと親株の硫酸銅に対する最小発育阻止濃度の比較により、SGI3が宿主細菌の硫酸銅抵抗性を増強することを見出した。以上のように本研究ではSNP9型の我が国における小進化と本系統が保有するSGI3の伝達性及び宿主へ与える影響を明らかにした。

The SNP gene typing method has been developed for the identification of Salmonella Typhimurium (ST) and non-stereotyped (heterotypic) ST, and the genetic mutation of strains isolated from domestic livestock in the past 40 years has been modulated. The purpose of this study is to clarify the function of Salmonella genomic island 3 (SGI3), which is the most dominant system in recent years. From 1998 to 2017, SNP9 type ST and 227 strain were isolated from Japan. The total nucleotide sequence of SNP9 type ST and 227 strain was analyzed. The total nucleotide sequence of SNP 9 type ST and 227 strain was analyzed. The total nucleotide sequence of SNP 9 type ST and 227 strain was analyzed. The results of this study were as follows: 2 strains of ST isolated in 1998 and 2 strains of non-stereotyped ST isolated in 1998. These two strains were characterized by SNP9-type complex, Tn-2 flagellar antigen (fljB), and were closely related. In the year 2000, the division was divided into two parts. The molecular shift from IS26 to fljB is incomplete. The two sides of the fence are out of order. A party, a plurality of agents, a plurality of agents, a plurality SGI3 structure and transmission test results, this factor and mobility transmission factor of 1 Comparison of the minimum growth inhibition concentrations of the host bacteria against copper sulfate showed that SGI3 increased the copper sulfate resistance of the host bacteria. In this study, the small evolution of SNP9 in our system and the influence of SGI3 on its accessibility and host interaction were investigated.