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豚由来О7群サルモネラの遺伝学的全容の解明と薬剤耐性・病原性を規定する因子の同定

阐明猪源沙门氏菌 O7 组的完整遗传图谱并鉴定决定耐药性和致病性的因素

基本信息

批准号：
21K14980
负责人：
新井暢夫
金额：
$ 2.91万
依托单位：
National Agriculture and Food Research Organization
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

Salmonella Choleraesuis（SC、抗原構造; 7:c:1,5）は豚のサルモネラ症の主要な原因血清型の一つであり、豚に消化器症状や全身症状を引き起こすことで養豚経営に被害を与える。SCによるサルモネラ症の制御が求められる一方で、我が国に分布する本血清型の遺伝学的多様性、薬剤耐性、病原性等の特徴は十分明らかにはなっていない。また、野外では7:c:-というSCと類似した抗原構造を示すサルモネラ属菌がしばしば分離されるが、本菌とSCとの遺伝学的関係や病原性は不明である。そこで本研究では、我が国に分布するSCの遺伝学的全容と7:c:-との関係を明らかにすることを目的とした。令和4年度は26都道府県から収集した豚およびイノシシ由来SCと7:c:- 265株、公共データベースに登録されている海外株（29か国由来、205株）を合わせた計474株のコアゲノム内一塩基多型に基づく分子系統解析を実施した。系統解析およびhierBAPSによるクラスタリングの結果、SCおよび7:c:-は5つのクレードに区分された。クレード1と2は主に生物型Choleraesuis（SCC）、クレード3~5は生物型Kunzendorf（SCK）で構成され、日本国内株はクレード2、3、5に集約された。また、2相鞭毛抗原遺伝子を保有しない菌株（7:c:-）は系統に因らず分布したが、日本国内の7:c:-はクレード5に集約された。このため、解析に供した7:c:-はSCの単相変異株であることが示唆された。国内株について、様々なカテゴリーの22薬剤に対する薬剤感受性を調べたところ、両生物型ともにストレプトマイシン、サルファ剤に60％を超える耐性率を示し、95％のSCCはテトラサイクリンに耐性を示した。さらにSCCではアジスロマイシンに耐性を示す亜系統がクレード2に存在し、本系統は多剤耐性傾向が顕著であるため（3～9剤・平均7剤）、薬剤耐性の観点から家畜衛生上の高リスク系統と考えられる。

Salmonella Choleraesuis (SC, antigenic structure; 7:c:1,5) The main cause of dolphin disease is serotype の一つであり, digestive symptoms of dolphin, systemic symptoms of dolphin, cause of dolphin disease, and dolphin-raising disease. SCによるサルモネラ Disease Controlがめられる一partyで、Our countryにdistributionするthis serotype The characteristics of genetic diversity, drug resistance, pathogenicity, etc. are very clear.また、野では7:c:-というSCとsimilar したantigen structure をshows すサルモネラ bacteria The pathogenicity of the bacterium is unknown and the genetic relationship between the bacterium and SC is unknown.そこでThis study is a comprehensive study of the distribution of our country and the science of SC. The origin of the 26 metropolitan and municipal prefecture collection projects in Reiwa 4th year SCと7:c:- 265 strains, public registered overseas strains (originating from 29 countries, 205 strains) A total of 474 を合わせた strains of のコアゲノム内一桩-based polytype に-based づく molecular system were analyzed. System analysis およびhierBAPSによるクラスタリングの results, SCおよび7:c:-は5つのクレードにdifferentiation された. The main biotype Choleraesuis (SCC) of クレード1と2は, the biological type Kunzendorf (SCK) of クレード3~5 (SCK), and the Japanese domestic strain はクレード2, 3, 5 are concentrated together.また, 2-phase flagellar antigen genetic strain しない strain (7:c:-) ははらず distribution したが, Japan domestic 7:c:-はクレード5に综合された.このため、ANALYSIS にSupplyした7:c:-はSCの単相変 Different strains of であることが说円された. Domestic plants: について、様々なカテゴリーの22薬剤に対する薬剤sensitivity べたところ、両biotype ともにストレプTobacco, サルファ剤に60% super える resistance rate is shown, and 95% SCC はテトラサイクリンに resistance rate is shown.さらにSCC ではアジスロマイシンにpatienceを Show that the す亜 system がクレード2 exists し, this system has many 剤patience tendencies がThe であるため (3~9 剤・average 7 剤), the の観Point of 薬剤patience and the の高リスクsystem と考えられる on livestock hygiene.