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豚由来О7群サルモネラの遺伝学的全容の解明と薬剤耐性・病原性を規定する因子の同定

阐明猪源沙门氏菌 O7 组的完整遗传图谱并鉴定决定耐药性和致病性的因素

基本信息

批准号：
21K14980
负责人：
新井暢夫
金额：
$ 2.91万
依托单位：
National Agriculture and Food Research Organization
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

Salmonella Choleraesuis（SC、抗原構造; 7:c:1,5）は豚のサルモネラ症の主要な原因血清型の一つであり、豚に消化器症状や全身症状を引き起こすことで養豚経営に被害を与える。SCによるサルモネラ症の制御が求められる一方で、我が国に分布する本血清型の遺伝学的多様性、薬剤耐性、病原性等の特徴は十分明らかにはなっていない。また、野外では7:c:-というSCと類似した抗原構造を示すサルモネラ属菌がしばしば分離されるが、本菌とSCとの遺伝学的関係や病原性は不明である。そこで本研究では、我が国に分布するSCの遺伝学的全容と7:c:-との関係を明らかにすることを目的とした。令和4年度は26都道府県から収集した豚およびイノシシ由来SCと7:c:- 265株、公共データベースに登録されている海外株（29か国由来、205株）を合わせた計474株のコアゲノム内一塩基多型に基づく分子系統解析を実施した。系統解析およびhierBAPSによるクラスタリングの結果、SCおよび7:c:-は5つのクレードに区分された。クレード1と2は主に生物型Choleraesuis（SCC）、クレード3~5は生物型Kunzendorf（SCK）で構成され、日本国内株はクレード2、3、5に集約された。また、2相鞭毛抗原遺伝子を保有しない菌株（7:c:-）は系統に因らず分布したが、日本国内の7:c:-はクレード5に集約された。このため、解析に供した7:c:-はSCの単相変異株であることが示唆された。国内株について、様々なカテゴリーの22薬剤に対する薬剤感受性を調べたところ、両生物型ともにストレプトマイシン、サルファ剤に60％を超える耐性率を示し、95％のSCCはテトラサイクリンに耐性を示した。さらにSCCではアジスロマイシンに耐性を示す亜系統がクレード2に存在し、本系統は多剤耐性傾向が顕著であるため（3～9剤・平均7剤）、薬剤耐性の観点から家畜衛生上の高リスク系統と考えられる。

Salmonella Choleraesuis (SC, antigenic structure; 7:c:1,5) is the main cause of the disease serotype, digestive symptoms and systemic symptoms. The genetic diversity, drug resistance, pathogenicity and other characteristics of this serotype are very clear. In the wild, the antigen structure is similar to that of SC, and the pathogenicity of SC is unknown. This study is based on the overall content of SC's genetic studies and the relationship between SC's genetic studies and SC'. In 2004, 265 overseas strains (29 national origins, 205 strains) were registered in the public domain, and 474 strains were collected in the provincial government. System analysis: hierBAPS, SC, 7:c:-5:5 The main biotype Cholesuis (SCC), biotype Kunzendorf (SCK), and Japanese strains are closely related to each other. 2-phase flagellum antigen fragments are retained in the strain (7:c:-), which is distributed in the system and concentrated in the domestic strain (7:c:-) 7:c:- The sensitivity of 22 kinds of SCC strains in China was adjusted to 60% and 95% of SCC strains to 60% respectively. The SCC has a high tolerance system (3~9 points, 7 points on average) and a high tolerance system for animal health.