豚由来О7群サルモネラの遺伝学的全容の解明と薬剤耐性・病原性を規定する因子の同定

阐明猪源沙门氏菌 O7 组的完整遗传图谱并鉴定决定耐药性和致病性的因素

• 批准号: 21K14980
• 负责人: 新井 暢夫
• 金额: $ 2.91万
• 依托单位: National Agriculture and Food Research Organization
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K14980/
• 关键词: Salmonella Choleraesuis; Salmonella 7:c:-; 全ゲノム解析; 薬剤耐性; 単相変異株; 病原性

Salmonella Choleraesuis（SC、抗原構造; 7:c:1,5）は豚のサルモネラ症の主要な原因血清型の一つであり、豚に消化器症状や全身症状を引き起こすことで養豚経営に被害を与える。SCによるサルモネラ症の制御が求められる一方で、我が国に分布する本血清型の遺伝学的多様性、薬剤耐性、病原性等の特徴は十分明らかにはなっていない。また、野外では7:c:-というSCと類似した抗原構造を示すサルモネラ属菌がしばしば分離されるが、本菌とSCとの遺伝学的関係や病原性は不明である。そこで本研究では、我が国に分布するSCの遺伝学的全容と7:c:-との関係を明らかにすることを目的とした。令和4年度は26都道府県から収集した豚およびイノシシ由来SCと7:c:- 265株、公共データベースに登録されている海外株（29か国由来、205株）を合わせた計474株のコアゲノム内一塩基多型に基づく分子系統解析を実施した。系統解析およびhierBAPSによるクラスタリングの結果、SCおよび7:c:-は5つのクレードに区分された。クレード1と2は主に生物型Choleraesuis（SCC）、クレード3~5は生物型Kunzendorf（SCK）で構成され、日本国内株はクレード2、3、5に集約された。また、2相鞭毛抗原遺伝子を保有しない菌株（7:c:-）は系統に因らず分布したが、日本国内の7:c:-はクレード5に集約された。このため、解析に供した7:c:-はSCの単相変異株であることが示唆された。国内株について、様々なカテゴリーの22薬剤に対する薬剤感受性を調べたところ、両生物型ともにストレプトマイシン、サルファ剤に60％を超える耐性率を示し、95％のSCCはテトラサイクリンに耐性を示した。さらにSCCではアジスロマイシンに耐性を示す亜系統がクレード2に存在し、本系統は多剤耐性傾向が顕著であるため（3～9剤・平均7剤）、薬剤耐性の観点から家畜衛生上の高リスク系統と考えられる。

Salmonella Choleraesuis (SC, antigen structure; 7: c: 1, 5) は dolphin の サ ル モ ネ ラ disease の な main reason serotype の a つ で あ り, dolphin に digesters symptoms や systemic symptom を lead き up こ す こ と で a dolphin 経 営 に murdered を and え る. SC に よ る サ ル モ ネ の ラ disease suppression が o め ら れ る side で す, I が に distribution る this serotype の but 伝 learn more others, 薬 tonic patience, pathogenicity and other の 徴 は ten distinct ら か に は な っ て い な い. ま た, outdoor で は 7: c: - と い う SC と similar し た を antigen structure in す サ ル モ ネ ラ belongs to bacterium が し ば し ば separation さ れ る が, this bacterium と SC と の but 伝 learn masato is や pathogenicity は unknown で あ る. そ こ で this study で は, I が に distribution す る SC の heritage 伝 learn the full capacity of と 7: c: - と の masato を and Ming ら か に す る こ と を purpose と し た. Make and 4 year は 26 all way mansion 県 か ら 収 set し た dolphin お よ び イ ノ シ シ origin SC と 7: c: - 265 strains, public デ ー タ ベ ー ス に login さ れ て い る overseas plant origin, 205 strains (29 か countries) を close わ せ た meter 474 strains の コ ア ゲ ノ ム type within a salt Quito に base づ く molecular system を be applied し た. System analytic お よ び hierBAPS に よ る ク ラ ス タ リ ン グ の results, SC お よ び 7: c: - は 5 つ の ク レ ー ド に distinguish さ れ た. ク レ ー ド 1 と は 2 main に biotype Choleraesuis (SCC), ク レ ー ド 3 ~ 5 は biotype Kunzendorf (SCK) で さ れ, Japan は ク レ ー ド 2, 3, 5 に intensive さ れ た. ま た, 2 phase flagellum antigen heritage 伝 son を retain し な い strains (7: c: -) に は system for ら ず distribution し た が, Japan domestic の 7: c: - は ク レ ー ド 5 に intensive さ れ た. <s:1> ため ため, analysis に for <s:1> た7:c: -に SC 単 単 phase change variant である とが とが とが to suggest された. Domestic strains に つ い て, others 々 な カ テ ゴ リ ー の 22 薬 tonic に す seaborne る 薬 tonic susceptibility を adjustable べ た と こ ろ type, struck biological と も に ス ト レ プ ト マ イ シ ン, サ ル フ ァ tonic に 60% を super え る patience を し, 95% の SCC は テ ト ラ サ イ ク リ ン に patience を shown し た. さ ら に SCC で は ア ジ ス ロ マ イ シ ン に patience を shown す 亜 system が ク レ ー ド 2 に し, this system は tonic patience tend が 顕 the で あ る た め (3 ~ 9 tonic, average 7 tonic), 薬 tonic patience の 観 point か ら の high on animal health リ ス と ク system test え ら れ る.

项目成果

国内外の豚から分離されたSalmonella Choleraesuisの遺伝学的系統とその性状

国内外猪猪霍乱沙门氏菌遗传株及其特性

• 发表时间: 2023
• 作者: 新井暢夫;玉村雪乃;渡部綾子;岩田剛敏;桃木杏奈;楠本正博
• 通讯作者: 楠本正博

我が国の家畜に分布するSalmonella Typhimurium及びその非定型株の遺伝学的背景の解明と流行系統の特徴

家畜鼠伤寒沙门氏菌及其非典型菌株遗传背景及流行菌株特征的阐明

• 发表时间: 2023
• 作者: 新井暢夫;玉村雪乃;渡部綾子;岩田剛敏;桃木杏奈;楠本正博;新井暢夫
• 通讯作者: 新井暢夫