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炭素－炭素結合形成に関わるラジカルＳ－アデノシル－Ｌ－メチオニン酵素の機能解析

参与碳-碳键形成的自由基S-腺苷-L-蛋氨酸酶的功能分析

基本信息

批准号：
19J11692
负责人：
佐藤秀亮
金额：
$ 1.22万
依托单位：
Tokyo Institute of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-25 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究では、ホパノイド生合成におけるユニークな炭素-炭素結合形成反応を触媒すると推定されるラジカルSAM酵素の基質を明らかにし、酵素反応を行って、酵素機能および反応機構を明らかにすることを目的としている。令和2年度は、主として、ホパノイドの側鎖の生合成初期段階の炭素鎖伸長反応を触媒するラジカルSAM酵素HpnHの機能解析を行った。筆者は前年度までの研究により、HpnHがジプロプテンを基質として認識し、ジプロプテンのC29位と5’-デオキシアデノシンのC5’位の間に新たな炭素-炭素結合を形成する反応を触媒し、(22R)-アデノシルホパンを生成することを明らかにした。HpnHが触媒する炭素-炭素結合形成反応の機構について次のように推定している。SAMの還元的開裂によって生じた5’-デオキシアデノシルラジカルがジプロプテンの末端に存在する二重結合にラジカル付加することで、炭素-炭素結合が形成される。このときC22位に生じたラジカルが立体選択的に水素化されることによって(22R)-アデノシルホパンが形成されると考えられる。重水中での反応解析において生成物のC22位に重水素が取り込まれたことから、ラジカル中間体の還元に水とのプロトン交換が可能なアミノ酸残基が関わると推察された。そこで今年度は、水素原子供与残基と考えられるHpnH中のシステインあるいはチロシンの点変異体を合計11種作成し、それらの酵素反応を検討した。その結果、システイン変異体において、収率の大幅な減少および立体選択性の消失が観測されたことから、HpnHが触媒する炭素-炭素結合形成反応の機構において、5’-デオキシアデノシルラジカルのジプロプテンへのラジカル付加反応によって生じたラジカル中間体がチオールから水素原子を立体選択的に引き抜くことによって、(22R)-アデノシルホパンが生成すると結論づけた。

In this study, we proposed that SAM enzyme substrate, enzyme reaction, enzyme function and reaction mechanism should be clarified in the process of biosynthesis. In this paper, the function analysis of SAM enzyme HpnH in the early stage of synthesis of side locks was carried out. In the past year, the author has studied the mechanism of HpnH in the formation of carbon-carbon bonds between C29 and 5'-position of HpnH and C5 '-position of HpnH, and has made clear the mechanism of HpnH in the formation of carbon-carbon bonds between C29 and 5'-position. HpnH is a catalyst for carbon-carbon bonding to form a reaction mechanism. The cracking of SAM is caused by the formation of a 5 '-carbon bond at the end of the ring. The C22-bit sequence is generated by a three-dimensional selection of the water element, and the (22R)-element sequence is formed. The C22 position of heavy water in the product of heavy water analysis is related to the possible exchange of heavy water residues. A total of 11 kinds of enzyme reactions were studied in this paper. As a result, the carbon and carbon bond formation reaction mechanism of HpnH catalyst was investigated. The reaction mechanism of carbon and carbon bond formation reaction was investigated.(22R)-