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嫌気性処理プロセスにおけるファージの多様性解明と宿主探索技術の開発

厌氧处理过程中噬菌体多样性的阐明和宿主搜索技术的发展

基本信息

批准号：
19J11931
负责人：
倪嘉苓
金额：
$ 1.34万
依托单位：
Tohoku University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-25 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

本年度の計画は、先ずはファージ多様性解析実験条件を確立して、今まであった問題点の解決と共に、得られたデータの解析を引き続き行うことである。更に、実際的に稼働している低温AnMBR内のコア微生物を明らかにして、リアクター内のファージと機能微生物の関係性を探すことである。本年度の実施状況は以下の通り：計画通り16S rRNA遺伝子のアプリコンシーケンシングで実稼働の嫌気性処理プロセスにおける微生物の群集構造を解析した。PMAで処理した前後、微生物構造の比較を行い、低温リアクター内"生きている"微生物群集を検出した。更に、PMA処理前後リアクター内に有機物分解のパスウェイを比較して、実際的に行った分解プロセスを把握した。低温反応器内の微生物と水処理の状況を全体的に理解することにより、嫌気性低温微生物群集の構造モデルが構築され、低温水処理に関する将来の研究の参考にもなる。研究結果をまとめて、学術雑誌に投稿した。微生物に関する研究だけではなく、ファージ側の研究も進めた。得られたファージのメタゲノムデータを用いて、データベースから検索して、knownとunknownファージのジェネラル情報を明らかにした。更に、メタゲノムによるcontigを作って、幾つのファージのメタゲノムと遺伝子の情報を推測した。従来の方法と比べ、４０％以上のファージのメタゲノム結果によって、高効率のファージ回収の方法を作った。しかし、ウィルスやファージに属したcontigの数は以前の研究より少ないし、タンパク質のBLASTの結果により、低い類似性が出来た。以上の結果によって、本研究ではファージの高回収率を実現した。メタゲノムの解析方法は改善する必要がある。将来的には、Hiseqなどの方法を用いて、深い分析を行い、より完全な情報を取得することを考えている。

The current year's plan has been established, and the conditions for the multiplex analysis have been established.ったThe problem is solved and the problem is solved, and the solution is analyzed and analyzed, and the problem is solved. Update, the real-time low-temperature microorganisms in AnMBR are exposedして、リアクター内のファージと Functional microorganisms’ relationship をExploration すことである. The implementation status of this year is as follows: Planning Pass 16S The rRNA genetic material is used to analyze the cluster structure of microorganisms. Before and after PMA treatment, comparison of microbial structure, and microbial clusters in the low-temperature laboratory. More details, comparison of the decomposition of organic matter in the リアクターにのパスウェイを before and after PMA treatment, and control of the に行った decomposition of the プロセスを. Microorganisms in the low-temperature reactor and the overall understanding of the water treatment situation are as follows: Biomass structure and construction, low temperature water treatment and future research reference. The results of the research are submitted by the academic journal. Microbiological research on the side of microorganisms. Research on the side of microorganisms. It's a good choice , knownとunknownファージのジェネラルinformation を明らかにした.に、メタゲノムによるcontigを为って、九つのファージのメタゲノムと伝子のInformationをspeculationした. The method of recovery is the ratio of the ratio, the result of the recovery is more than 40%, and the recovery method of the high efficiency is the work.しかし、ウィルスやファージに genus したcontigのnumberは Previous research より小ないし、タンパク性のBLASTのRESULTSにより、lowいsimilarityが出た. The above results show that the recovery rate of this study is high and the recovery rate is high. It is necessary to improve the analysis method of メタゲノムの. Future には, Hiseq などの method を use いて, deep い analysis を line い, よりcomplete な information を acquisition することを test えてる.