piRNA生合成におけるPapiリン酸化修飾の生物学的意義の解明
piRNA生合成におけるPapiリン酸化修飾の生物学的意義の解明
批准号:
19J13939
负责人:
山田 紘実
金额:
$1.34万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-25 至 2021-03-31
中文摘要
生殖組織で高発現する小分子ノンコーディングRNAのpiRNAは、PIWIタンパク質と複合体を形成し、相補的な配列を持つトランスポゾンの転移を抑制することで、ゲノムを安定的に維持している。カイコ卵巣由来生殖細胞株BmN4では、ミトコンドリア局在型タンパク質PapiがpiRNA成熟化の足場として機能することで、piRNAの生成を促進していると考えられている。これまでの当研究室の解析により、Papiのリン酸化修飾とPapiのRNA結合との間に関連が示唆されていたが、その詳細なメカニズムやpiRNA生合成におけるリン酸化修飾の生物学的意義は不明であった。本研究ではまず、質量分析によりPapiのリン酸化修飾残基を複数同定した。同定されたリン酸化修飾残基の非リン酸化変異体を用いた解析により、1つのセリン残基のリン酸化修飾が、PapiのRNA結合能さらにはpiRNA生合成に必要であることが明らかとなった。また、in vitroリン酸化アッセイ系の確立により精製が可能となったPapiを標的としたリン酸化酵素を含むタンパク質群をショットガン質量分析することで、リン酸化酵素の候補因子群が得られた。これらの候補因子に対し、piRNA生合成量及びPapiのリン酸化レベルを指標とした遺伝子ノックダウン(KD)スクリーニングを行った結果、先に同定したPapiのRNA結合能及びpiRNA生合成に重要なリン酸化を担う修飾酵素の同定に成功した。リン酸化修飾酵素の相互作用因子の解析や、カイコPIWIタンパク質Siwiを欠失した条件での解析により、BmN4細胞におけるpiRNA生合成には、PapiとSiwiの相互作用と、Papiのリン酸化修飾の両方が必要であることが明らかとなった。今後は、擬似リン酸化変異体を用いた解析を行うことで、piRNA生合成におけるPapiリン酸化修飾の意義を明らかにする。
英文摘要
生殖組織で高発現する小分子ノンコーディングRNAのpiRNAは、PIWIタンパク質と複合体を形成し、相補的な配列を持つトランスポゾンの転移を抑制することで、ゲノムを安定的に維持している。カイコ卵巣由来生殖細胞株BmN4では、ミトコンドリア局在型タンパク質PapiがpiRNA成熟化の足場として機能することで、piRNAの生成を促進していると考えられている。これまでの当研究室の解析により、Papiのリン酸化修飾とPapiのRNA結合との間に関連が示唆されていたが、その詳細なメカニズムやpiRNA生合成におけるリン酸化修飾の生物学的意義は不明であった。本研究ではまず、質量分析によりPapiのリン酸化修飾残基を複数同定した。同定されたリン酸化修飾残基の非リン酸化変異体を用いた解析により、1つのセリン残基のリン酸化修飾が、PapiのRNA結合能さらにはpiRNA生合成に必要であることが明らかとなった。また、in vitroリン酸化アッセイ系の確立により精製が可能となったPapiを標的としたリン酸化酵素を含むタンパク質群をショットガン質量分析することで、リン酸化酵素の候補因子群が得られた。これらの候補因子に対し、piRNA生合成量及びPapiのリン酸化レベルを指標とした遺伝子ノックダウン(KD)スクリーニングを行った結果、先に同定したPapiのRNA結合能及びpiRNA生合成に重要なリン酸化を担う修飾酵素の同定に成功した。リン酸化修飾酵素の相互作用因子の解析や、カイコPIWIタンパク質Siwiを欠失した条件での解析により、BmN4細胞におけるpiRNA生合成には、PapiとSiwiの相互作用と、Papiのリン酸化修飾の両方が必要であることが明らかとなった。今後は、擬似リン酸化変異体を用いた解析を行うことで、piRNA生合成におけるPapiリン酸化修飾の意義を明らかにする。
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Biological significance of Papi phosphorylation in piRNA biogenesis in silkworm ovarian germ cells
家蚕卵巢生殖细胞 piRNA 生物合成中 Papi 磷酸化的生物学意义
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Hiromi Yamada, Kazumichi M. Nishida, Lumi Negishi, Mikiko C. Siomi]
通讯作者:
Mikiko C. Siomi
東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻塩見研究室ホームページ
东京大学研究生院理学研究科生物科学系潮见实验室主页
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
核酸科学ハンドブック
核酸科学手册
DOI:
--
发表时间:
2020
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山田勇磨, 原島秀吉, 原島秀吉(共著)]
通讯作者:
原島秀吉(共著)
カイコ卵巣由来生殖細胞のpiRNA生合成機構におけるPapiリン酸化修飾の生物学的意義
家蚕卵巢生殖细胞piRNA生物发生机制中Papi磷酸化修饰的生物学意义
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[山田紘実, 西田知訓, 根岸瑠美, 塩見美喜子]
通讯作者:
塩見美喜子
核内構造と空間配置が確立する転写状態の解明
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批准号:24K18057
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.08万
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财政年份:2024
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负责人:山田 紘実
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依托单位:
海外基金