広域集団ゲノム解析によるアオサンゴの異時的な種分化起源と分子機構の解明

通过广域种群基因组分析阐明蓝珊瑚异时物种形成的起源和分子机制

• 批准号: 19J21342
• 负责人: 谷中 絢貴
• 金额: $ 1.98万
• 依托单位: University of Miyazaki
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-25 至 2022-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19J21342/
• 关键词: アオサンゴ; 八放サンゴ; MIG-seq; 系統地理; 系統解析; 集団遺伝解析; インド太平洋; サンゴ礁生態系; 種分化; インド太平洋系統地理解析; 生殖時期の異時性; 生物時計

前年度までにMIG-seq法に基づく集団遺伝学的・系統学的解析によって明らかにしたインド太平洋広域のアオサンゴ属の系統地理パターンについて、第一著者として査読付き国際学術誌（Frontiers in Marine Science）へ公表するとともに、前年度から延期されていた国際学会（ICRS2021）で口頭発表を行った。また本研究過程で、サンゴ礁に生息する同一のアオサンゴ集団内で生じる配偶子・幼生分散距離推定を目的に、MIG-seq解析およびマイクロサテライト解析による空間自己相関分析を行った結果、アオサンゴは同一個体群内でも狭い空間範囲で強い遺伝構造を有し、配偶子・幼生の分散範囲は先行研究の野外実測データとほぼ一致する約４００m以内に限られることを遺伝学的にも裏付けた。この結果は、底生性海洋生物種の野外における幼生分散実測値と空間遺伝構造学的推定値を検証した初の研究例であり、共同第一著者として査読付き国際学術誌（Frontiers in Marine Science）へ公表した。生物時計遺伝子に関連するアオサンゴ種分化の分子機構解明研究については、初年度に実施した予備実験以降、収束しないコロナ感染拡大や現地の研究協力機関の受け入れ制限や判断を受け、前年度に引き続き、最終年度である今年度内も沖縄県での現地フィールド調査および飼育実験が実施できなかった。その結果、網羅的な発現遺伝解析に必要十分量のサンプルが確保できず、本研究の目的達成の鍵となるアオサンゴの生物時計遺伝子群の同定および発現動態解明にまで至らなかった。最終年度の研究成果の公表については、上記の第一著者としての査読付き国際学術誌２報に加え、共著者として査読付き国際学術誌３報を公表し、計５報の論文をリリースした。学会発表は、上記の第一著者としての国際学会発表１つに加え、共著者として国内学会発表１つを行った。

Before annual ま で に MIG - seq subgrade に づ く set 団 heritage, 伝 studied systematics, analytical に よ っ て Ming ら か に し た イ ン hiroo ド Pacific domain の ア オ サ ン ゴ の system geographic パ タ ー ン に つ い て, first author と し て check 読 pay き international academic ambition (Frontiers in Marine Science) へ male table す る と と も に, former annual か ら extension さ れ て い た international society (ICRS2021) で oral 発 table line を っ た. ま た で this study process, サ ン ゴ reef に interest-bearing す る same の ア オ サ ン ゴ set within 団 で raw じ る spouse, child born baby spitting distance, constructive purpose を に, MIG - seq analytic お よ び マ イ ク ロ サ テ ラ イ ト parsing に よ る space their line phase masato analysis を っ た results, ア オ サ ン ゴ は で within the same group of individual も narrow space い van 囲 で strong い を have 伝 structure し, spouse, child, larval の scattered van 囲 は の leading research field be surveying デ ー タ と ほ ぼ consistent す る に limit within about 400 m ら れ る こ と を but 伝 learn に も in pay け た. こ の results は, natural disposition is Marine species の wild に お け る larval dispersed be measured numerical と space heritage 伝 tectonics on the presumption of numerical を 検 card し た の early research example で あ り, common first author と し て check 読 pay き international academic ambition (Frontiers in Marine Science) へ male table し た. Biological clock heritage 伝 son に masato even す る ア オ サ ン ゴ differentiation of interpret の molecular mechanisms に つ い て は, at the beginning of year に be applied し た reserve be 験 onwards, 収 beam し な い コ ロ company, big や ナ infection in situ の study together machine masato の limitations by け into れ や judgment before を け, annual に lead き 続 き, final annual で あ る inside our も blunt 縄 県 で の in situ フ ィ ー ル ド adjustable Check および breeding practice が practice で な った った. そ の results, and snare な 発 now heritage 伝 parsing に ten necessary component の サ ン プ ル が ensure で き ず purpose, this study の reached の key と な る ア オ サ ン ゴ の biological clock heritage 伝 subgroup の with fixed お よ び 発 dynamic now interpret に ま で to ら な か っ た. Final year の research の male table に つ い て は, written in the first author と の し て の check 読 pay き international academic ambition 2 quote に add え, author と し て check 読 pay き international academic ambition 3 reported し を male table, 5 reported の paper を リ リ ー ス し た. The first author of the academic society と て て て international academic societies publish table 1 に え and え co-authors と て domestic academic societies publish table 1 を った line った.

项目成果

Limited fine-scale larval dispersal of the threatened brooding corals Heliopora spp. as evidenced by population genetics and numerical simulation

受威胁的孵卵珊瑚 Heliopora spp. 的幼虫小规模扩散有限。

• DOI: 10.1007/s10592-019-01228-7
• 发表时间: 2019
• 期刊: Conservation Genetics
• 影响因子: 2.2
• 作者: Taninaka H.;Bernardo L.;Saito Y.;Nagai S.;Ueno M.;Kitano Y.;Nakamura T.;Yasuda N.
• 通讯作者: Yasuda N.

Hidden damage to the reproduction of blue coral that survived a mass bleaching event.

在大规模白化事件中幸存下来的蓝珊瑚的繁殖受到了隐藏的损害。

• 发表时间: 2019
• 期刊: PROCEEDINGS OF THE2019 INTERNATIONAL CONFERENCE ON CLIMATE CHANGE,DISASTER MANAGEMENT AND ENVIRONMENTAL SUSTAINABILITY
• 作者: Junior Taka Lomas;Hiroki Taninaka and Nina Yasuda
• 通讯作者: Hiroki Taninaka and Nina Yasuda

Phylogeography of Blue Corals (Genus Heliopora) Across the Indo-West Pacific

印度-西太平洋蓝珊瑚（Heliopora 属）的系统发育地理学

• DOI: 10.3389/fmars.2021.714662
• 发表时间: 2021
• 期刊: Frontiers in Marine Science
• 影响因子: 3.7
• 作者: Taninaka Hiroki;Maggioni Davide;Seveso Davide;Huang Danwei;Townsend Abram;Richards Zoe T.;Tang Sen-Lin;Wada Naohisa;Kikuchi Taisei;Yuasa Hideaki;Kanai Megumi;De Palmas Stephane;Phongsuwan Niphon;Yasuda Nina
• 通讯作者: Yasuda Nina

Comparison of the genetic diversity and connectivity of the commercially important precious corals Corallium Japonicum and Pleurocorallium Konojoi using high-throughput sequencing and the implications for conservation

使用高通量测序比较具有商业价值的珍贵珊瑚 Corallium Japonicum 和 Pleurocorallium Konojoi 的遗传多样性和连通性及其对保护的影响

• 发表时间: 2019
• 期刊: Proceedings of 2019 International Conference on CLIMATE CHANGE, DISASTER MANAGEMENT and ENVIRONMENTAL SUSTAINABILITY organized by CWMD, Kumamoto University
• 作者: Kenji Takata;Hiroki Taninaka;Masanori Nonaka;Fumihito Iwase;Taisei Kikuchi;Yoshihisa Suyama;Satoshi Nagai;Nina Yasuda
• 通讯作者: Nina Yasuda

An integrated approach revealed on-going speciation in the living fossil coral (Heliopora coerulea) in Japan

综合方法揭示了日本活化石珊瑚（Heliopora coerulea）中正在进行的物种形成

• 发表时间: 2019
• 作者: Kenji Takata;Hiroki Taninaka;Masanori Nonaka;Fumihito Iwase;Taisei Kikuchi;Yoshihisa Suyama;Satoshi Nagai;Nina Yasuda;Hiroki Taninaka
• 通讯作者: Hiroki Taninaka