Characterization of a novel bacteria responsible for the arsenite oxidation in the rhizosphere of arsenic hyper-accumulator, Pteris vittata
Characterization of a novel bacteria responsible for the arsenite oxidation in the rhizosphere of arsenic hyper-accumulator, Pteris vittata
批准号:
19K05778
负责人:
宮内 啓介
金额:
$2.75万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-04-01 至 2024-03-31
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英文摘要
ヒ素高蓄積植物であるモエジマシダは、環境中のヒ酸を根から吸収し、亜ヒ酸はヒ酸に酸化してから吸収する。亜ヒ酸酸化細菌Pandoraea sp. NE5株は、モエジマシダ根圏から単離された、亜ヒ酸酸化能を有する細菌である。しかし、そのゲノム配列からは、既知の亜ヒ酸酸化酵素遺伝子であるaioABに相同性をもつORFは見出されなかった。そこで、本菌の亜ヒ酸酸化酵素遺伝子を明らかにするとともに、モエジマシダ根圏での本菌の役割を探ることとした。昨年度までの研究で、NE5株にトランスポゾン(Tn)を導入し、亜ヒ酸酸化能が低下した変異株を24株得ている。そのうち、oxidoreductaseと相同性を示すORF(LOCUS_16990)にTnが挿入された変異株が24株中4株確認され、それぞれ異なる部位に挿入されていたことから、このORFが亜ヒ酸酸化に関わっている可能性が強く示唆された。昨年度に引き続き、相同組換えを用いたこのORFの破壊を試みた。接合伝達を用いて破壊用プラスミド(Km耐性遺伝子及びsacB遺伝子をもつ)を導入した結果、1回目の相同組換え体を得るためのプレーティングにおいて非特異的にコロニーが生じ、選択培地に特異的なコロニー(Km耐性、スクロース感受性)が生じなかった。エレクトロポレーションでプラスミドを導入した結果、選択培地で1回目の組換えが起きた候補株を得ることができたが、2回目の組換え体(Km感受性、スクロース耐性)を得ることができなかった。1回目の組換え体候補株においてプラスミドが挿入されているのか、またその挿入部位を確認する必要がある。LOCUS_16990高発現株についてはプラスミドを作製し、NE5株に導入しているところである。NE5株のゲノム配列については、DDBJに登録したデータを公開し、投稿した。
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Development of arsenic-contaminated groundwater purification technology to secure safe water resources in the Mekong Delta
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批准号:23KK0199
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项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (International Collaborative Research)
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资助金额:$13.4万
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财政年份:2023
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负责人:宮内 啓介
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依托单位:
東南アジア・南アジアにおけるヒ素汚染地下水の生物学的浄化方法の開発
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批准号:18KK0302
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项目类别:Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
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资助金额:$11.56万
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财政年份:2018
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负责人:宮内 啓介
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依托单位:
ジベンゾフラン分解を司る転写制御因子の機能解析
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批准号:18780052
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2006
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负责人:宮内 啓介
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依托单位:
PCB分解酵素系における新規転写制御メカニズムの解明
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批准号:16780052
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$1.92万
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财政年份:2004
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负责人:宮内 啓介
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依托单位:
農薬BHC分解菌をモデルとした細菌の新規物質に対する効率的代謝経路獲得機構の解析
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批准号:99J08881
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.77万
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财政年份:1999
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负责人:宮内 啓介
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依托单位:
細菌由来のγ-HCH分解関与遺伝子群の単離とそれを利用した環境浄化法の研究
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批准号:96J04664
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1998
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负责人:宮内 啓介
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依托单位:
海外基金