Diagnostic and identification of therapeutic target molecules based on functional RNA network search in colorectal cancer.

基于功能RNA网络搜索的结直肠癌治疗靶分子的诊断和鉴定。

• 批准号: 19K09050
• 负责人: 吉満 工平
• 金额: $ 2.08万
• 依托单位: Kagoshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2019
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2019-04-01 至 2021-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K09050/
• 关键词: 大腸癌; マイクロRNA; 治療抵抗性

当科にて大腸癌臨床検体から作成したマイクロRNA発現プロファイルを用い、リスト内のmirRクラスターであるhsa-mir-143およびhsa-mir-145に注目した。それ ぞれのpassenger鎖とguide鎖を併せ、計4カテゴリーに共通する遺伝子の探索を検討するも、期間・資金の面からpassenger鎖のみ、すなわちhsa-mir-143-5pおよ びhsa-mir145-3pの二つに注目し、共通して制御する遺伝子の探索を行った。cell lineに上記mirを導入した検体をgene expression解析に提出し、mir導入に よって抑制された遺伝子群を同定。さらにそれぞれのマイクロRNAのtarget siteを持つ遺伝子群および、GEO databaseにおける大腸癌にてupregulateされている 遺伝子群との共通な遺伝子の存在の有無を検索した。結果5つの遺伝子候補の同定がなされたが、いずれの遺伝子も解析にて5年生存率に有意な影響を与えうる遺 伝子ではなかったことから、mir-143-5pおよびmir145-3pに共通な遺伝子ではなく、各々単独での遺伝子検索へと方針を転換した。同様の解析をmir-143-5pおよ びmir145-3pの各々で施行したところ、143-5pについては24の遺伝子を同定。また145-3pについては30の遺伝子を同定するに至った。さらに各遺伝子について5年 生存率による絞り込みを行い、機能解析を行っていった。しかしながら5年生存率にて有意差の出る遺伝子候補が少なく、145-3pについてはSTC2のみ、143-5pについてはC2orf48のみであった。これらについて臨床検体にてPCRを行ったところ、STC2については有意差がつかず、しかしながらC2orf48については有意差が見られた。これらのことよりC2orf48についての研究進行を検討するも、同遺伝子については抗体の販売などもされておらず、研究設備、残りの研究期間を鑑み、研究継続は困難と考えられた。

When the department of colorectal cancer clinical examination is made, it is made of RNA, and the RNA is now used, and the リスト内のm irRクラスターであるhsa-mir-143およびhsa-mir-145に Noticeした.それぞれのpassenger lock とguide lock を和せ、KEI4カテゴリーに通する伝子のExplorationを検 Discussionするも、Period・Capitalの面からpassenger lockのみ、すなわちhsa-mir-143-5pおよびhsa-mir145-3p の二つに Gaze し, 公公してcontrol する伝子のExploration を行った. On the cell line, note that mirをimportした検bodyをgene expression analysisにproposes, mir importによってsuppressionされた伝subgroupをthe same determination.さらにそれぞれのマイクロRNAのtarget siteをhold つ伝子群および、GEO databaseにおけるColorectal cancerにてupregulateされているThe existence and absence of the existence of the remaining 伝子群との公な伝子の有无を検SOした. Result 5 Analysis of the 5-year survival rate of 5-year survival rate of 5-year survival rate and 5-year survival rate of 5-year survival rate伝子ではなかったことから、mir-143-5pおよびmir145-3 pに common な 伝子 ではなく, each 々単 unique での缝子検SO へと policy を転change した. Same as 様のanalyticをmir-143-5pおよ びmir145-3pのeach々でexecutionしたところ、143-5pについては24の伝子を同定.また145-3pについては30の伝子を同定するに到った.さらにeach legacy 伝子について 5 years survival rate による炊込みを行い, functional analysis を行っていった.しかしながら5-year survival rate にて intentionally poor の出る缝子 candidate が小なく、145-3pについてはSTC2のみ、143-5pについてはC2orf48のみであった. There are これらについてclinical 検体にてPCRを行ったところ、STC2についてはThere is a difference in meaning, and there is a difference in meaning. C2orf48 is different. Research on the C2orf48 C2orf48 antibodyのselling 売などもされておらず, research equipment, residual りのresearch period を见み, research 継続はdifficulty と考えられた.