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免疫遺伝子発現シグネチャーによる食道がん術前化学療法の奏効予測

使用免疫基因表达特征预测食管癌新辅助化疗的反应

基本信息

批准号：
19K09206
负责人：
藤田征志
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Institute of Physical and Chemical Research
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2021-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K09206/
关键词：
食道がん

项目摘要

食道扁平上皮癌73症例のサンプルをご提供いただき、解析を行った。性別は男性60症例、女性13症例であった。術前化学療法の奏効性はResponder 54症例、Non-responder 19症例であった。腫瘍組織を浸潤T細胞の多寡に基づいて、Hot, Coldの二群に分類した。具体的にはRNA-Seqで得られた遺伝子発現量から、Spranger et al, 2015のT細胞シグネチャー13遺伝子 (CD8A, ICOS, CXCL9, CXCL10, GZMK, IRF1, HLA-DOA, HLA-DOB, HLA-DMA, HLA-DMB, CCL2, CCL3, CCL4)の値を抽出し、これに階層的クラスタリング法を適用した。36症例がHot群、37症例がCold群に分類された。術前化学療法の奏効率はHotクラスにおいて86.1% (31/36)、Coldクラスにおいて62.2% (23/37)であり、オッズ比は3.71 (95%信頼区間1.07-15.10)、Fisher検定によるp値は0.032であり、統計学的に有意な差が認められた。性別との関連では、男性における奏効率が73.3% (44/60)、女性で76.9% (10/13)であり、統計的有意差は見られなかった。すなわち食道扁平上皮癌の腫瘍内微小環境、特に浸潤T細胞量が、術前化学療法の高い奏効率と関連することが確認された。今後の研究の展開としては、T細胞以外の免疫細胞と化学療法奏効性の関連を調べることが考えられる。

73 cases of esophageal squamous cell carcinoma Sex: 60 cases male, 13 cases female. Preoperative chemotherapy was performed in 54 cases and in 19 cases. The number of infiltrating T cells in tumor tissue was classified into two groups: Hot, Cold and white. Specific RNA-Seq results show that T-cell generation 13 genes (CD8A, ICOS, CXCL9, CXCL10, GZMK, IRF1, HLA-DOA, HLA-DOB, HLA-DMA, HLA-DMB, CCL2, CCL3, CCL4) can be extracted and classified according to the classification method. 36 cases were classified into Hot group and 37 cases into Cold group. Preoperative chemotherapy efficacy rate Hot category: 86.1% (31/36), Cold category: 62.2% (23/37), Fisher category: p = 0.032, Statistical category: p = 3.71 (95% CI: 1.07-15.10). The correlation between gender and sex was 73.3% (44/60) for males and 76.9% (10/13) for females. The relationship between the microenvironment within the lesion, specifically the amount of infiltrating T cells, and the high effectiveness of preoperative chemotherapy in esophageal squamous cell carcinoma has been confirmed. Future research will be conducted on the relationship between immune cells other than T cells and chemotherapy.