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Museomics-based Study of The Evolutionary Dynamics of Gastropods

基于博物馆组学的腹足动物进化动力学研究

基本信息

批准号：
19K12424
负责人：
スティアマルガデフィン
金额：
$ 2.83万
依托单位：
Wakayama National College of Technology
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份：
2019
资助国家：
日本
起止时间：
2019-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K12424/
关键词：
ミュゼオミクス分子系統 DNAバーコーディング生物多様性環境変動分岐年代博物館標本貝殻ミューゼオミックスミトゲノムビッグデータミトコンドリアゲノムフィールドワーク貝殻標本次世代シーケンサー多様性変動

项目摘要

本研究の最大目標は、大量なDNA情報や化石・地質学的情報を含むビッグデータセットで腹足類の大系統の解析を行い、腹足類の多様性変動のパターンと地史に起きた環境変動との関連を解明する。コロナ禍に対応するために一部の研究を変更する必要があったが、R3-R4においては貝殻からDNAを抽出するための実験を行った。その結果、いくつかの手法を検討する必要があることまでは突き止めたが、本研究の最大目標を達成するための手法としては効率が悪いことがわかった。しかし、軟体動物貝殻からどのようなタンパク質が含まれているかを検討するための実験を博物館標本の頭足類のオウムガイやアオイガイで行い、その結果を論文として報告している（１本出版済み、１本査読中）。これが、今後の研究に使える情報と確信している。また、地元の博物館の協力を得て無脊椎動物の古い標本を使った実験を行った結果、古い博物館標本によるDNAバーコーディング実験のためのプロトコルの検討を行った。これは、３本の論文として成果報告をした。このプロトコルを用いて、ベトナムやインドネシア、日本から採取されて日本の博物館に収蔵されている腹足類の標本を用いる。他方、多様性調査を報告した論文（ベトナムのサンプル）及び、腹足類のスガイの多様性変動と日本における地質年代の過去に起きた環境変化との関連性の解明についてを行った。その結果、1000以上の博物館標本から、4000配列以上のDNAの部分配列の新規決定ができた。その一部は、今までや上記したところで報告している。その一部の結果は学会で報告しただけではなく、現在査読中２本の論文としても報告している。このようにしてコロナ禍の影響で研究がやや遅れて、手法を調整して、希望も多少縮小する必要があったため今後に解決すべき課題は残っているが、成果は出せている。

The biggest goal of this research is to collect a large amount of DNA information and fossil and geological information, including gastropods of the same species. The analysis of large systems and the explanation of the relationship between the multiple changes in gastropods and the geological history of the gastropods. R 3-R4においてはshellからDNAをdraw outするための実験を行った.その results, いくつかのtechniques を検question するnecessary があることまでは protruding きstop めたが, The biggest goal of this study is to achieve the goal of achieving the goal of using the method and efficiency of the method. The head of the museum specimen Pediatric nomenclature, no result report, no report (1 book published, 1 book under review). The information and information that will be researched in the future will be confirmed.また、Jigen Museum's cooperation をGet the の古いspecimens of invertebrates and make the った実験を行った results, ancientいMuseum specimenによるDNAバーコーディング実験のためのプロトコルの検事を行った.これは, 3 papers and として results report をした.このプロトコルを用いて, ベトナムやインドネシア, 日本から选Take the gastropod specimen collected by the Japan Museum and use it. Heterogeneous and polymorphic investigation report paper (ベトナムのサンプル) and gastropod polymorphism Changes in Japan's past geological time, changes in the environment, and explanations of correlations. New rules for the results, museum specimens of more than 1,000 pieces, and partial allocation of DNA of more than 4,000 pieces have been decided.その一一は、本までや上记したところでreport している. The result of the first part of the paper is the report of the society, and the two papers currently being checked are the report of the society. Research on the influence of このようにしてコロナ disasterでがやや遅れて、Adjustment of techniques、How much reduction of hope もIt is necessary to solve the problem in the future, and the result will be achieved.

项目成果

期刊论文数量（41）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

スタアンズギセルとシコクギセルのミトコンドリアゲノム全長から見るキセルガイ科の系統的実態

从斯坦恩水烟和 Shikokukah 的全长线粒体基因组中可以看出 Aceridae 科的系统发育状况。

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
石川彰人;スティアマルガ・デフィン;豊田敦;鈴木穣;上島励;廣田主樹，吉田真明，佐々木猛智，スティアマルガ・デフィン;瀬戸麻綾，廣田主樹，吉田真明，スティアマルガ・デフィン;吉田祭，清水萌，石川彰人，上島励，スティアマルガ・デフィン
通讯作者：
吉田祭，清水萌，石川彰人，上島励，スティアマルガ・デフィン

カイダコ類（アオイガイ科）の卵鞘でみられる貝殻微細構造の特質

章鱼（锦葵科）卵囊壳微观结构特征

DOI：
发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
0
作者：
石川彰人;スティアマルガ・デフィン;豊田敦;鈴木穣;上島励;廣田主樹，吉田真明，佐々木猛智，スティアマルガ・デフィン;瀬戸麻綾，廣田主樹，吉田真明，スティアマルガ・デフィン;吉田祭，清水萌，石川彰人，上島励，スティアマルガ・デフィン;スティアマルガデフィン，吉田真明，廣田主樹，佐々木猛智;廣田主樹，吉田真明，佐々木猛智，スティアマルガデフィン
通讯作者：
廣田主樹，吉田真明，佐々木猛智，スティアマルガデフィン

日本産キセルガイのPhylogenomics（予報）

日本蜗牛的系统发育组学（预测）