Development of siginal processing and proten structure determination methods for low qulaity NMR data

低质量 NMR 数据的信号处理和蛋白质结构测定方法的开发

• 批准号: 18K06160
• 负责人: IKEYA Teppei
• 金额: $ 2.75万
• 依托单位: Tokyo Metropolitan University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-01 至 2021-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K06160/
• 关键词: NMR; 蛋白質; 立体構造計算; 立体構造決定; 常磁性効果; 溶液NMR; 蛋白質立体構造; 信号処理; ベイズ推定; 蛋白質立体構造決定; スパースモデリング

项目成果

溶液NMRを用いたin situ構造生物学

使用溶液 NMR 进行原位结构生物学

• 发表时间: 2019
• 作者: Takashi Tanaka;Yutaka Ito;et al.;池谷鉄兵，伊藤 隆;伊藤 隆，池谷鉄兵
• 通讯作者: 伊藤 隆，池谷鉄兵

Solution NMR approaches to 3D structure determination of proteins in living eukaryotic cells

溶液 NMR 方法测定活体真核细胞中蛋白质的 3D 结构

• 发表时间: 2021
• 作者: Y. Ito;K. Inomata & T. Ikeya
• 通讯作者: K. Inomata & T. Ikeya

分子クラウディング環境下の蛋白質の緩和解析

分子拥挤环境下蛋白质的弛豫分析

• 发表时间: 2019
• 作者: 田岸亮馬;田中孝;三島正規;池谷鉄兵;伊藤隆
• 通讯作者: 伊藤隆

Multi-state protein structure determination by integrated analysis of several NMR data sets

通过多个 NMR 数据集的综合分析确定多态蛋白质结构

• 发表时间: 2020
• 作者: 優乙石;Po-hung Wang ;杉田有治;杉田 有治;杉田 有治;Yuji Sugita;Yuji Sugita;杉田 有治;八木 清;Jaewoon Jung;杉田 有治;杉田 有治;Yuji Sugita;杉田 有治;田村康一;Ai Niitsu;池谷鉄兵，伊藤 隆
• 通讯作者: 池谷鉄兵，伊藤 隆

Multi-state structure determination and dynamics analysis reveals a new ubiquitin-recognition mechanism in yeast ubiquitin C-terminal hydrolase

• DOI: 10.1101/2021.04.22.440356
• 发表时间: 2021-04
• 期刊: bioRxiv
• 作者: Mayu Okada;Yu Tateishi;Eri Nojiri;T. Mikawa;S. Rajesh;Hiroki Ogasa;Takumi Ueda;H. Yagi;T. Kohno;T. Kigawa;I. Shimada;P. Güntert;Yutaka Ito;T. Ikeya