不全型TSCのためのTSC1/TSC2遺伝子特異的な変異解析法の新規確立

针对 TSC 缺陷的 TSC1/TSC2 基因特异性突变分析新方法的建立

• 批准号: 18K15291
• 负责人: 加藤 麻希
• 金额: $ 2.66万
• 依托单位: Fujita Health University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2018
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2018-04-01 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18K15291/
• 关键词: 結節性硬化症; TSC1; TSC2; NGS; LongPCR; TSC; long PCR; Target Caprure; InDel; 不全型結節性硬化症; 変異解析手法の確立; 次世代シーケンス解析

結節性硬化症(tuberous sclerosis complex, TSC)は、皮膚/神経系/腎/肺/骨など全身症状を伴う常染色体優性遺伝性疾患でTSC1遺伝子とTSC2遺伝子が同定されている。臨床診断が比較的容易な疾患であるので、診療ガイドラインにおいて遺伝学的検査の推奨度は高くないが、多彩な臨床症状を呈し発症年齢が多様なことから、若年者や診断基準を満たさない不全型の場合には遺伝学的検査が確定診断に最短となると考えられる。TSC1/2は、エクソン数が多いため従来法では遺伝学的検査に多大な時間と労力を要していたが、次世代シーケンス解析(NGS)によるエクソーム解析の登場により、一度に当該遺伝子を検査することが可能になったものの国内外のコホート研究から変異検出率（16%～85%）の低さやコストが問題となっていた。これらの問題を解決するために、本研究では、NGSを用いた高感度で迅速・安価なTSC特異的遺伝子変異解析法を確立をすることを目的とし、遺伝学的検査こそが早期介入への近道とされる不全型患者の拾い上げを目指した。2015年から2019年10月までに解析を行ったTSC50症例において、安価かつTSC1/2遺伝子のみを網羅的に解析可能なLongPCR法と、TSC以外も解析対象となり時間・コスト面に課題のあるターゲットエクソーム法との比較検討を行った。LongPCR法はエクソーム解析では捉えることが難しいイントロンにあるバリアントやモザイクも検出可能となる。ターゲットエクソーム法により既同定のバリアントはLongPCR法においても再現良く同定に至ったことから、ターゲットエクソーム法の代替法となり得ることがわかった。遺伝子解析を行う過程で、TSC2遺伝子に同定されたバリアントにInDelが多いという特徴的な結果が得られたもののTSC2特異的な結果の原因究明は途中となっている。

Tuberous sclerosis (tuberous sclerosis complex, TSC) は, skin/god 経 department/renal/lung/bone な ど systemic symptom を with う autosomal dominance heritage 伝 disorder で TSC1 posthumous son 伝 と TSC2 heritage 伝 が son be さ れ て い る. な disease clinical diagnosis が comparison で あ る の で, diagnosis and treatment ガ イ ド ラ イ ン に お い て but 伝 learn 検 check の push award degrees high は く な い が, colorful な clinical symptoms を し 発 disease years 齢 が others more な こ と か ら, if years や diagnosis benchmark を against た さ な い insufficiency type の occasions に は but 伝 learn 検 check が definite diagnosis に shortest と な る と exam え ら れ る. TSC1/2 は, エ ク ソ ン が much い た め 従 to method で は 伝 learn how な 検 check に time と を 労 force to し て い た が, next generation シ ー ケ ン ス parsing (NGS) に よ る エ ク ソ ー ム parsing の appearance に よ り, once に when the legacy 伝 son を 検 check す る こ と が may に な っ た も の の at home and abroad の コ ホ ー ト research か ら - 検 out rate (16% - 85%) <s:1> low さやコストが problem となって た た た. こ れ ら の を solve す る た め に, this study で は, NGS を with い た Gao Gan degrees で quickly Ann 価 な TSC specific heritage 伝 sub - different analytic method を establish を す る こ と を purpose と し, but 伝 learn 検 こ そ が early intervention へ の faster route と さ れ る の is not all patients with pick up on い げ を refers し た. In October 2019 2015 か ら ま で に parsing line を っ た TSC50 cases に お い て, Ann 価 か つ TSC1/2 heritage 伝 son の み を snare に resolution may な と LongPCR method, TSC も parsing like と seaborne な り time · コ ス ト surface に subject の あ る タ ー ゲ ッ ト エ ク ソ ー ム method と の compare 検 line for を っ た. Analytical で LongPCR method は エ ク ソ ー ム は catch え る こ と が difficult し い イ ン ト ロ ン に あ る バ リ ア ン ト や モ ザ イ ク も 検 makes possible と な る. タ ー ゲ ッ ト エ ク ソ ー ム method に よ り are ordered with の バ リ ア ン ト は LongPCR method に お い て も reappear with good く に to っ た こ と か ら, タ ー ゲ ッ ト エ ク ソ ー ム の replace method と な り have る こ と が わ か っ た. Heritage 伝 analytic process line を う で, traces of TSC2 伝 に son be さ れ た バ リ ア ン ト に InDel が more い と い う of 徴 な results ら が れ た も の の TSC2 specific な の reasons in Ming は way と な っ て い る.

项目成果

IRUD-Pで変異同定に至らなかった事例に対する着床前診断

IRUD-P 未识别突变病例的植入前诊断

• 发表时间: 2018
• 作者: 加藤麻希;稲垣秀人;石原尚子;大江瑞恵;倉橋浩樹
• 通讯作者: 倉橋浩樹

A female patient with retinoblastoma and severe intellectual disability carrying an X;13 balanced translocation without rearrangement in the RB1 gene: a case report

一名患有视网膜母细胞瘤和严重智力障碍的女性患者，携带 X;13 平衡易位，但 RB1 基因未重排：病例报告

• DOI: 10.1186/s12920-019-0640-2
• 发表时间: 2019
• 期刊: BMC Medical Genomics
• 影响因子: 2.7
• 作者: Tsutsumi Makiko;Hattori Hiroyoshi;Akita Nobuhiro;Maeda Naoko;Kubota Toshinobu;Horibe Keizo;Fujita Naoko;Kawai Miki;Shinkai Yasuko;Kato Maki;Kato Takema;Kawamura Rie;Suzuki Fumihiko;Kurahashi Hiroki
• 通讯作者: Kurahashi Hiroki

造血器腫瘍のクリニカルシーケンスにおける遺伝診療体制の構築

造血肿瘤临床测序基因治疗体系的建立

• 发表时间: 2018
• 期刊: 日本小児血液・がん学会雑誌
• 作者: 加藤 麻希;倉橋 浩樹
• 通讯作者: 倉橋 浩樹

Optimization of PGD for recurrent t (11; 22) carrier

复发性 t (11; 22) 携带者的 PGD 优化

• DOI: 10.1016/j.rbmo.2019.03.077
• 发表时间: 2019
• 期刊: Reproductive BioMedicine Online
• 影响因子: 4
• 作者: Takema Kato;Maki Kato;Yasuko Shinkai;Haruki Nishizawa;Toshiaki Endo;Chikako Kani;Masanori Ochi;Shin Hayashi;Johji Inazawa;Hiroki Kurahashi.
• 通讯作者: Hiroki Kurahashi.

これでわかる 網羅的手法による着床前診断のすべて ―最新技術から遺伝カウンセリング,フォローアップまで

以下是您需要了解的有关使用综合方法进行植入前诊断的所有信息 - 从最新技术到遗传咨询和随访

• 发表时间: 2019
• 作者: 重藤 元;大槻高史;秋山靖人;山村 昌平;澤井英明,中岡義晴,遠藤俊明,馬場剛,尾崎守,竹内一浩,加藤武馬,宮井俊輔,福田愛作,宇津宮隆史,加藤麻希,田中温,田中あず見,倉橋浩樹
• 通讯作者: 澤井英明,中岡義晴,遠藤俊明,馬場剛,尾崎守,竹内一浩,加藤武馬,宮井俊輔,福田愛作,宇津宮隆史,加藤麻希,田中温,田中あず見,倉橋浩樹