权益分类	功能权益	普通用户	{{item.name}}会员
{{category.name}}	{{benefitItem.name}}

Extensive characterization of domestication-related genes in buckwheat by utilizing the genetic resource of Yunnan province, China

利用中国云南省遗传资源对荞麦驯化相关基因进行广泛表征

基本信息

批准号：
18KK0172
负责人：
安井康夫
金额：
$ 11.23万
依托单位：
Kyoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-10-09 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

【目的】野生ソバ（Fagopyrum esculentum ssp. ancestrale）は雲南省を中心とする中国南部にのみ自生し、栽培ソバ（F. esculentumssp. esculentum）と交配可能な重要な植物遺伝資源である。しかし世界のどこにも野生ソバ遺伝資源は構築されておらず、中国の急速な発展とともにその遺伝資源は失われようとしている。そこで本研究では共同研究先の雲南農業大学（YAU）において野生ソバを中心としたソバ遺伝資源の維持管理システムを構築する。また、遺伝資源に含まれる野生および栽培ソバの全ゲノム配列決定から、ソバの栽培化に関与した育種上重要な遺伝子群を網羅的に同定し、最終的にソバの栽培化プロセスを解明する。【結果】昨年度までに、中国南西部（雲南省、四川省、およびチベット自治区）から採取した47の野生種と、中国南西部およびネパール、インド、ブータンなどの近隣諸国からの57の栽培種の全ゲノム解析(WG)の結果から、東チベットの野生集団が栽培種に最も密接に関連していることがわかっていた。本年度はこの結果に基づき、集団分岐統計（PBS）解析により詳細に人為選抜を受けた栽培種のゲノム領域を検出した。その結果、第１染色体上の約52-53Mbの領域が高いPBS値を示し、本領域が強い人為選抜を受けたと考えられた。また、他の野生集団には存在しない東チベット野生集団のマイナーハプロタイプが栽培個体群に広まり、固定化に至ったことが判明した。すなわち、東チベット野生集団から栽培種が起原したと考えられた。さらに、この領域を詳細に調査したところ、アラビドプシスやイネで休眠に関与するSnRK2遺伝子が座乗しており、本遺伝子がソバの栽培化に関与している可能性が高いと推測している【次年度予定】起原地と推定された東チベット周辺の詳細なフィールド調査とサンプル追加を実施する。

[Objective] Fagopyrum esculentum ssp. ancestrale) in the center of Yunnan Province and south of China. esculentumssp. Esculentum) mating may be important for plant heritage resources. The rapid development of China and the rapid development of China's natural resources have been transformed into the world's natural resources. This study is to jointly study the establishment of a system for the maintenance and management of wild resources in Yunnan Agricultural University (YAU). The genetic resources, including wild and cultivated species, are identified for their overall selection, selection, and selection of the most important genetic subpopulations for breeding. [Results] In the past year, 47 wild species were collected from southern and western parts of China (Yunnan Province, Sichuan Province, and Taiwan Autonomous Region), and 57 cultivated species from southern and western parts of China were collected from neighboring countries. This year's results are based on the analysis of population differentiation statistics (PBS). As a result, the region of about 52-53Mb on chromosome 1 is highly selected, and the region is highly selected. The existence of wild populations, other wild populations, and the identification of cultivated individuals The wild population is growing rapidly. In addition, the detailed investigation on the dormancy of SnRK2 gene was carried out in this field, and the possibility of cultivation of SnRK2 gene was high. The detailed investigation on the dormancy of SnRK2 gene was carried out in this field.