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がん細胞浸潤のモデリングと解析と数値シミュレーション

がん細胞浸潤のモデリングと解析と数値シミュレーション
癌细胞侵袭的建模、分析和数值模拟
批准号:
19F19701
负责人:
野津 裕史
金额:
$0.51万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2019
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2019-07-24 至 2021-03-31

项目摘要

项目成果

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英文摘要
本研究において、がん細胞が広がる現象について、数値シミュレーションの研究を進めました。特に、効率的かつ数学的信頼性のある数値シミュレーション手法の開発を行いました。本研究で取り組むがん細胞浸潤モデルは、細胞が局所的に集中する効果を持つ、いわゆるケラー・シーゲル型の方程式系です。このモデルを安定かつ高精度に解くためには、細胞が集中する空間的な位置に適切な解像度の節点を配置する必要があります。[J.A. Carrillo, N. Kolbe, and M. Lukacova-Medvid’ova. J. Sci. Comput., 2019]で提案された数値計算スキームはWasserstein測度を用いた興味深いものですが、空間1次元であることを本質的に利用した方程式の変換が行われており、空間多次元への拡張は容易ではありませんでした。我々は、新たにラグランジアン・アダプティブ・ムービング・メッシュ法を開発し、方程式の変換を行わずに、十分な計算精度の結果を得ることに成功しました。空間1次元性を用いないため、2次元への拡張が比較的容易です。汎用的な数値計算スキーム構築のために、2次元では三角形分割を用い、比較的単純な移流を伴う問題に対して有効性を確認しました。有限体積法と組み合わせた、ラグランジアン・アダプティブ・ムービング・メッシュ有限体積スキームの基礎アイデアを構築しました。数値解析を行い、移流問題について、スキームが質量を保存することを示し、また、(メッシュを動かすが細分化・粗化しない場合の)誤差評価も得ました。比較のために、癌の進行と転移において重要な役割を果たすことで知られる uPA モデルについて、1次元での実装を行い、良好な結果を得ました。これらの結果をいくつかの学会において報告しました。
期刊论文(6)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
An adaptive Lagrangian Finite-Volume method for convection-diffusion equations
对流扩散方程的自适应拉格朗日有限体积法
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Kolbe Niklas, Sfakianakis Nikolaos, Stinner Christian, Surulescu Christina, Lenz Jonas, Niklas Kolbe and Hirofumi Notsu]
通讯作者: Niklas Kolbe and Hirofumi Notsu
Stochastic modelling of TGF-β signalling in single cells
单细胞中 TGF-β 信号传导的随机模型
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Kolbe Niklas, Sfakianakis Nikolaos, Stinner Christian, Surulescu Christina, Lenz Jonas, Niklas Kolbe and Hirofumi Notsu, Niklas Kolbe and Hirofumi Notsu, Niklas Kolbe]
通讯作者: Niklas Kolbe
A Lagrangian moving mesh scheme for advection-diffusion equations
平流扩散方程的拉格朗日移动网格格式
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Kolbe Niklas, Sfakianakis Nikolaos, Stinner Christian, Surulescu Christina, Lenz Jonas, Niklas Kolbe and Hirofumi Notsu, Niklas Kolbe and Hirofumi Notsu]
通讯作者: Niklas Kolbe and Hirofumi Notsu
A mass transport finite element scheme for chemotaxis models
趋化模型的质量传递有限元方案
DOI: --
发表时间: 2019
期刊:
影响因子: --
作者: [N. Kolbe, M. Lukacova-Medvidova, J.A. Carrillo]
通讯作者: J.A. Carrillo
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