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Elucidating mechanisms of lower grade glioma recurrences using next generation sequencing

使用下一代测序阐明低级别胶质瘤复发的机制

基本信息

批准号：
19K21240
负责人：
野村昌志
金额：
$ 1.91万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
财政年份：
2018
资助国家：
日本
起止时间：
2018-08-24 至 2020-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-19K21240/
关键词：
低悪性度神経膠腫悪性化脱メチル化神経膠腫オミクス解析

项目摘要

低悪性度神経膠腫の再発、悪性化の分子メカニズム解明を目的として本課題を行なった。まず、これまで当研究室で取得してきた122神経膠腫のマルチオミクスデータによる解析で明らかとなった、再発に伴って星細胞腫に特異的に見られる脱メチル化現象の意義を明らかにすることを目的としてin silico解析を行なった。脱メチル化が見られる再発星細胞腫は細胞周期に関連する遺伝子発現亢進が見られた。このうちIGF2BP3を含むいくつかの遺伝子では脱メチル化が原因となって癌関連遺伝子の発現を亢進させていることが明らかとなり治療標的となりうると考えられた。しかしながら、その他のほとんどの脱メチル化部位は遺伝子発現とは無関係な領域であった。これらの脱メチル化部位はDNA複製の遅い領域に集中していることから、脱メチル化は主には分裂亢進に伴う２次的現象であることが示唆された。このような機序からも脱メチル化は悪性化の重要な指標として臨床上のマーカーとなりうることが示唆された。本解析成果はScientific Reports誌に発表した (Nomura et al., 2019) 。さらに低悪性度神経膠腫のうち、乏突起膠腫においては、WHO grade IVへ悪性化した稀な検体を初発時とともに３ペア集め全エクソーム解析、DNAメチル化アレイ解析を行なった。再発時の検体はCIC, PIK3CAなどの遺伝子変異を獲得しており、悪性化の一因と考えられたが、星細胞腫のような顕著なメチル化の変化は見られず、同病理系の比較的緩徐な生物学的性質を反映していると考えられた。

The low degree of sex is related to the nature of the molecule, the understanding, the purpose, and the nature of the disease. In the laboratory, there is a clear understanding of the situation in the laboratory, which means that the in silico analysis is based on the analysis of the meaning of the image, which means the meaning of the image. There is an increase in the number of cells in the cell cycle in the first place. The reason for the loss of IGF2BP3 is that there is an increase in the number of patients who are suffering from cancer. Please tell me that there is no significant change in the area where you are not affected. In the field of DNA replication, the focus is on hypermitosis, which is accompanied by two signs of abstinence. In the order of the machine, it is important to show that there is an instigation on the bed. The result of this analysis is "Scientific Reports". "Table" (Nomura et al., 2019). The low degree of sexual sensitivity is sensitive, the lack of protuberance is sensitive, the WHO grade IV is sensitive, the whole set is fully analyzed, and the DNA profile is analyzed. At the same time, the results of CIC, PIK3CA and so on were significantly higher than those of the control group, and the results showed that the clinical characteristics of biology in the department of pathology were compared with those of the department of pathology.