课题基金 / 基金详情

生体分子モーターの内部で起きる非平衡散逸の定量と数理モデル解析

生体分子モーターの内部で起きる非平衡散逸の定量と数理モデル解析
生物分子马达内部发生的非平衡耗散的量化和数学模型分析
批准号:
18K03564
负责人:
有賀 隆行
金额:
$2.83万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
财政年份:
2018
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-04-01 至 2024-03-31

项目摘要

项目成果

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生体内で荷物を運ぶキネシンは、化学エネルギーを力学的な仕事へと変換する分子モーターである。その運動機構の理解の進展とは裏腹に、エネルギー変換の理解は進んでいなかった。私は、これまでの研究で1分子キネシンの力学操作と応答計測を行い、キネシンの運動に伴う非平衡散逸を定量した。その結果、入力された化学エネルギーの大部分が、計測プローブからは見えない形で、キネシン分子の内部から散逸されていることを新たに見いだした。本研究では、その未知の内部散逸がどう生み出されるのか、キネシンの分子内部でのエネルギーの流れの定量的な理解を目的として研究を行ってきた。令和2年度までに、実験結果からの要請を満たしつつ局所詳細釣り合いの条件を組み込んだ、キネシンの新しい理論モデルを構築し、さらに本課題と並行して得られていた外力ゆらぎによるキネシンの運動の応答の実験結果についても本課題で得られた数理モデルを適用して検証を行ってきた。令和3年度は、そのモデルを野生型キネシンだけでなく、キネシンの変異体、特に片方の頭部のみに変異を加えたヘテロ変異体で得られた実験結果にも適用すべく、理論の拡張を行った。その結果、これまでは一つのジャンプする質点として捉えていたキネシンの運動を、両足が交互に踏み出すモデルへと拡張できた。令和4年度はこの新しい数理モデルの確からしさを検証するため、新しい1分子計測系を構築しつつ、ヘテロ変異体キネシンの1分子計測を試みた。しかしながら、ひきつづくコロナ禍の影響もあり、実験結果とモデルのすり合わせには遅れがでている。
期刊论文(29)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: --
发表时间: 2023
期刊: 月刊「細胞」
影响因子: --
作者: [Nakamura Shin, Mitsui Takaya, Kobayashi Yasuhiro, Kurokuzu Masayuki, Shimomura Susumu, 有賀隆行]
通讯作者: 有賀隆行
確率過程模型によるキネシンの特徴付け
使用随机过程模型表征驱动蛋白
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Yuki Matsuoka, Yasuya Nakayama, Toshihisa Kajiwara, 西村和真,有賀隆行,伊丹將人,佐々真一]
通讯作者: 西村和真,有賀隆行,伊丹將人,佐々真一
人工的な疑似細胞内アクティブ環境 におけるキネシンの運動
人工模拟细胞内活动环境中的驱动蛋白运动
DOI: --
发表时间: 2021
期刊:
影响因子: --
作者: [立石圭人, 有賀隆行]
通讯作者: 有賀隆行
Measuring Dissipation of a Molecular Motor, Kinesin-1, and the Mathematical Model Analysis
分子马达 Kinesin-1 耗散的测量和数学模型分析
DOI: --
发表时间: 2020
期刊:
影响因子: --
作者: [Seki Tomotaka, Okuzono Tohru, Toyotama Akiko, Yamanaka Junpei, 眞山博幸, Takayuki Ariga]
通讯作者: Takayuki Ariga
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    力学的摂動応答からひもとく歩行型生体分子モーターの動作原理
    • 批准号:
      24K00600
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.98万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      有賀 隆行
    • 依托单位:
    ヘテロ2量体を用いた双頭ミオシンVの協調した働きによる運動機能の1分子観察
    • 批准号:
      04J07647
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $5.76万
    • 财政年份:
      2004
    • 负责人:
      有賀 隆行
    • 依托单位:
    海外基金