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ピロール・イミダゾールポリアミドを用いたテロメアにおけるクロマチン高次構造の解析

使用吡咯-咪唑聚酰胺分析端粒染色质高阶结构

基本信息

批准号：
17J10836
负责人：
佐々木飛鳥
金额：
$ 1.22万
依托单位：
The Graduate University for Advanced Studies
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2017
资助国家：
日本
起止时间：
2017-04-26 至 2019-03-31
项目状态：
已结题

项目摘要

真核生物の染色体末端はテロメアという繰り返し配列によって保護されている。この繰り返し配列は細胞分裂のたびに短縮していく。一部のがん細胞では、テロメアDNA同士の相同組み換えによってテロメア長が維持され、細胞が無限増殖能を獲得する。この機構はテロメラーゼ非依存性テロメア伸長(ALT)と呼ばれるが、なぜテロメア間での相同組み換えが働くようになるのかはわかっていない。本研究では、テロメアに特異的に結合するピロール・イミダゾールポリアミド化合物を用いてテロメアDNA上のクロマチン構成因子を網羅的に同定する方法を開発し、ALTの誘導機構とALT細胞の特徴を明らかにすることを目的とした。テロメラーゼ依存的にテロメアを伸長する細胞(ALT(-))およびALT細胞(ALT(+))からテロメアクロマチンを単離し、テロメアに結合するRNAを次世代シークエンサーで解析した。その結果、ALT(-)では期待した通りテロメラーゼRNA構成要素(TERC)が特異的に検出された。一方、ALT(+)では、驚くべきことに多数のイントロンRNAが選別された。これらのイントロンRNAをコードしている遺伝子領域を調べたところ、ALT(+)細胞特異的にテロメア反復配列が挿入されていた。次にALT(+)のイントロン領域と染色体末端のテロメアとの関連性を検討するため、RNA FISHとテロメア共標識を行いイントロン領域と染色体末端領域の局在を調べたところ、イントロンRNAのシグナルがテロメアの近傍もしくはテロメアと共局在した。この結果は、テロメア反復配列が挿入されたイントロン領域が染色体末端に近接していることを示唆する。今回の研究から、ALT(+)の細胞では既知の染色体末端のテロメア同士の相同組み換えだけでなく、染色体末端のテロメアとイントロン領域のテロメア反復配列間での相同組み換えが促進される可能性が考えられる。

Eukaryotic chromosome termini are protected by DNA sequencing. The cell division of the cell is shortened. Some of these cells have the same set of DNA sequences that maintain the same DNA sequence, and the cells have unlimited reproductive potential. This mechanism is not dependent on the attribute extension (ALT), but calls for the same group of attributes. The aim of this study is to develop a method for identifying ALT inducing mechanisms by binding specific ALT molecules to DNA molecules. The cell length (ALT(-)) and ALT cell length (ALT(+)) of the dependent RNA are analyzed in the next generation. The results, ALT(-), are expected to be specific to RNA components (TERC). One side, ALT(+), alarm, alarm. This is the first time that a cell has been identified. Next, ALT(+), RNA FISH, and chromosome terminal regions were identified. The result is that the chromosome ends are located near the chromosome ends. In this paper, we studied the possibility of the same group of mutations in cells with ALT(+) and ALT(+) in the same region of chromosome termini.