結合タンパク質の網羅的な解析を指向したタンパク質ラベル化法の開発
結合タンパク質の網羅的な解析を指向したタンパク質ラベル化法の開発
批准号:
18J21621
负责人:
對馬 理彦
金额:
$1.79万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2018
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2018-04-25 至 2021-03-31
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英文摘要
前年度までに、アフィニティービーズ上で有機光触媒のスクリーニングを行った。従来まで用いていたRu/dcbpy錯体には効率は劣るものの、Acriflavin、BODIPY、Coumarinなど蛍光プローブとして汎用される種々の分子がタンパク質ラベル化触媒となることを見出した。これらの有機光触媒は十分な細胞膜透過性を有する。このことから上記で見出した光触媒は生きた細胞内でタンパク質をラベル化できるポテンシャルを秘めている。モデル系として、HEK293FT細胞中膜上にHaloTag-TM(Transmembrane domain of PDGFR)を遺伝子工学的に強制発現させた。このHaloTagに対して前年度に見出されてきた有機光触媒を共有結合で連結し、可視光照射条件下、HaloTag-TMのラベル化を試みた。平面性かつカチオン性を有するAcriflavinを用いることで、HaloTag上で解析対象タンパク質や相互作用タンパク質を効率よくラベル化することに成功した。Acriflavine光触媒を用い、10 nm程度の直径のタンパク質含有複合体nucleosomeに対して本ラベル化法を適用した。H2BをPOIとしたラベル化を実施したところ、細胞内環境においてもacriflavineはHaloTag-POI上で近接ラベル化反応を可能にすることが明らかとなった。本法は1分間の可視光照射という迅速かつ温和な条件で、従来法よりも局所的空間でPOIおよび相互作用タンパク質をラベル化できる。そのため、本法によってH2Bの関連タンパク質やH2Bと非常に近い距離に存在するH2Aの関連タンパク質を選択的にラベル化できることが明らかとなった。本研究で開発したラベル化法は6 nmのラベル化半径もつことから細胞内微小環境における隣接したPPIを高精度に解析できる初めての手法である。
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Ru光触媒を担持したアフィニティービーズを用いたリガンド結合タンパク質の網羅的なラベル化
使用携带 Ru 光催化剂的亲和珠全面标记配体结合蛋白
DOI:
--
发表时间:
2018
期刊:
影响因子:
--
作者:
[對馬理彦, 佐藤伸一, 中村浩之]
通讯作者:
中村浩之
標的タンパク質の部位選択的ラベル化を志向した光触媒担持ビーズ上での近接ラベル化法の開発
开发光催化剂支持的珠子上的邻近标记方法,用于目标蛋白的位点选择性标记
DOI:
--
发表时间:
2019
期刊:
影响因子:
--
作者:
[對馬理彦, 中根啓太, 佐藤伸一, 中村浩之]
通讯作者:
中村浩之
T2R2東京工業大学リサーチリポジトリ
T2R2 东京工业大学研究资料库
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Target Protein Identification on Photocatalyst-Functionalized Magnetic Affinity Beads
光触媒功能化磁力亲和珠上的目标蛋白鉴定
DOI:
10.1002/cpps.108
发表时间:
2020
期刊:
Current Protocols in Protein Science
影响因子:
--
作者:
[對馬理彦, 佐藤伸一, 中根啓太, 中村浩之]
通讯作者:
中村浩之
Utilization of Single Electron Transfer Reaction in Protein Chemical Labeling
单电子转移反应在蛋白质化学标记中的应用
DOI:
10.5059/yukigoseikyokaishi.77.463
发表时间:
2019
期刊:
Journal of Synthetic Organic Chemistry, Japan
影响因子:
--
作者:
[Sato Shinichi, Tsushima Michihiko, Nakamura Hiroyuki]
通讯作者:
Nakamura Hiroyuki
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