Faster genome mapping method using 4-ary Perfect Linear Code

使用 4 进制完美线性码的更快基因组作图方法

• 批准号: 24650155
• 负责人: takenaka yoichi
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2012
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2012-04-01 至 2016-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-24650155/
• 关键词: ゲノム; 完全線形符号; 次世代シークエンサー; DNA配列; ガロア拡大体; ゲノムマッピング; アライメント

项目成果

Reconstruction of Dynamic Gene Regulatory Networks for Cell Differentiation by Separation of Time-course Data

• 发表时间: 2013
• 作者: T. Nakayama;H. Daiyasu;S. Seno;Y. Takenaka;H. Matsuda

共通k-mer種別数に基づくメタゲノム分類手法

基于常见k-mer类型数量的宏基因组分类方法

• 发表时间: 2015
• 作者: 吉田拓真;瀬尾茂人;竹中要一;松田秀雄
• 通讯作者: 松田秀雄

Multiplication of Motif Occurrence Profiles for Metagenome Fragment Classification

用于宏基因组片段分类的基序出现概况的乘法

• 发表时间: 2013
• 作者: Naoki Matsushita;Hiromi Daiyasu;Shigeto Seno;Yoichi Takenaka;Hideo Matsuda
• 通讯作者: Hideo Matsuda

長いリードを計算機で扱うのに完全線形符号が効果的だと思うのです

我认为完全线性代码对于用计算机处理长引线是有效的。

• 发表时间: 2013
• 作者: 竹中要一;瀬尾茂人;松田秀雄
• 通讯作者: 松田秀雄

All the 1+3n one-mismatch sequences of n-mer DNA are involved in 22.2+0.00879n strings of Perfect Linear Code words on DNA

n-mer DNA 的所有 1 3n 个一错配序列均涉及 DNA 上 22.2 0.00879n 串完美线性码字

• 作者: 吉田拓真;竹中要一;瀬尾茂人;松田秀雄;Yoichi Takenaka;Yoichi Takenaka
• 通讯作者: Yoichi Takenaka