Diversity and transcription of 16S rRNA genes on the genome of halophilic archaea

嗜盐古菌基因组16S rRNA基因的多样性和转录

• 批准号: 23657016
• 负责人: KIMURA Hiroyuki
• 金额: $ 2.41万
• 依托单位: Shizuoka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
• 财政年份: 2011
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2011 至 2012
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-23657016/
• 关键词: 微生物; 生態; 極限環境; 好塩菌; アーキア; 16S Rrna; G+C 含量; 微生物分子温度計; 16S rRNA; GC含量; 好塩性アーキア; 環境適応; 生育温度; 増殖速度定数; 16S rRNA遺伝子; G+C含量; 転写; 定量RT-PCR

Halophilic archaea have a few types of 16S rRNA gene on their genome. The prokaryotes, which live in high temperature, commonly have high G+C content of 16S rRNA genes, whereas the prokaryotes, which live in normal or low temperature, have low G+C content of 16S rRNA genes. In this study, we determined the growth temperatures and transcription amount of 16S rRNA genes of the halophilic archaeal strains in several temperature conditions. The low G+C content of 16S rRNAs showed significant upregulation in 25-30℃. On the other hand, high G+C content of 16S rRNAs were expressed at significantly higher levels in high temperature condition, 40-50℃.

嗜盐古菌的基因组中含有几种类型的16S rRNA基因。生活在高温环境中的原核生物通常具有高G+C含量的16S rRNA基因，而生活在正常或低温环境中的原核生物则具有低G+C含量的16S rRNA基因。在本研究中，我们测定了嗜盐古菌菌株在不同温度条件下的生长温度和16S rRNA基因转录量。低G+C含量的16S rrna在25-30℃下显著上调。另一方面，高G+C含量的16S rrna在40-50℃的高温条件下表达量显著增加。

项目成果

好塩性古細菌Haloarcula の多様な 16S rRNA 遺伝子と生育温度

嗜盐古菌Haloarcula的多样化16S rRNA基因和生长温度

• 发表时间: 2013
• 作者: 佐藤 悠;木村浩之
• 通讯作者: 木村浩之

Growth temperatures of archaeal communities can be estimated from the guanine-plus-cytosine contents of 16S rRNA gene fragments

• DOI: 10.1111/1758-2229.12035
• 发表时间: 2013-06-01
• 期刊: ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS
• 影响因子: 3.3
• 作者: Kimura, Hiroyuki;Mori, Kousuke;Ishibashi, Jun-Ichiro
• 通讯作者: Ishibashi, Jun-Ichiro

微生物分子温度計による地下圏の温度プロファイリング

使用微生物分子温度计对地下球体进行温度分析

• 发表时间: 2012
• 期刊: 月刊地球
• 作者: Shohei Hattori;Hiroaki Nashimoto;Hiroyuki Kimura;Keisuke Koba;Keita Yamada;Mikio Shimizu;Hiroshi Watanabe;Muneoki Yoh;Naohiro Yoshida;木村浩之
• 通讯作者: 木村浩之

プロテオロドプシンを有する海洋細菌の光エネルギー利用と代謝メカニズム

具有蛋白视紫红质的海洋细菌的光能利用及代谢机制

• 作者: 木村浩之;Young C;Martinez A;DeLong EF;木村浩之
• 通讯作者: 木村浩之

Hydrogen and carbon isotope fractionation by thermophilic hydrogenotrophic methanogens from a deep aquifer under coculture with fermenters

• DOI: 10.2343/geochemj.1.0161
• 发表时间: 2012-06
• 期刊: Geochemical Journal
• 影响因子: 0.8
• 作者: S. Hattori;Hiroaki Nashimoto;Hiroyuki Kimura;K. Koba;Keita Yamada;Mikio Shimizu;Hiroshi Watanabe;M. Yoh;N. Yoshida