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Isolation of rare actinomycetes for screening of new compound from deep-sea water

分离稀有放线菌用于从深海水中筛选新化合物

基本信息

批准号：
21K14794
负责人：
春成円十朗
金额：
$ 3万
依托单位：
Toyama Prefectural University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K14794/
关键词：
海洋深層水放線菌 Rhodococcus Streptosporangium 新規pluramycin類縁体希少放線菌

项目摘要

昨年度と同様に、新型コロナ感染症の影響により、申請当初に計画をしていた全国の海洋深層水取水施設へのサンプリングが困難な状況であった。また、今後も計画通りに遂行できない可能性が考えられた。そのため、当初予定していた研究計画を大きく変更し、製品評価基盤機構（NITE）の微生物保存機関であるバイオテクノロジーセンター（NBRC）で提供されているスクリーニング用微生物（RD株）から、海洋深層水由来の放線菌株を検索した。このうち、特に研究報告例の無い北海道羅臼の海洋深層水から分離された55株について、詳細な生産物の解析を実施することで、新規化合物の探索を行うこととした。はじめに、前年度に新規化合物が得られ、海洋深層水に存在する放線菌における有用希少放線菌として選定したRhodococcus属から6株、さらには海洋深層水からの分離例が極めて少ない、Streptosporangium属20株を優先的に研究に用いた。これら26株は3種類の化合物生産用培地にて培養・抽出し、主にHPLCを用いた生産物の詳細な解析を行った。解析の結果、大半の株では生産物の量が検出限界であったり、構造解析が困難であると判断された。構造解析に十分な量の化合物を生産していると判断したRhodococcus属の1株、Streptosporangium属の2株について、追加で生産培養を行い、目的化合物を各種クロマトグラフィーにて精製した。NMR、MSスペクトルによる構造解析の結果、Rhodococcus株から1つ、Streptosporangium属から2つの新規化合物を得た。

In the same year, the new type of infectious disease was in the same situation yesterday, and the application was made to apply for the initial plan to collect water from marine deep water throughout the country. In the future, we will try to find out the possibility in the future. In the first place, we planned to increase the number of microorganisms (RD strains) in marine deep water, and the microbiological preservation mechanism (NITE) was used to save microorganisms. Microorganisms (NBRC) were used to provide information on the use of microorganisms (strains of microorganisms) in marine deep water. Hokkaido, marine deep water, separation of 55 plants, analysis of raw materials, exploration of new compounds, and exploration of new compounds. In the previous year, there were 6 strains in the genus Rhodococcus, 20 strains in the genus Streptosporangium and 20 strains in the deep water. Twenty-six strains of 3-type compounds were extracted by pediatric culture, and the main HPLC was analyzed by biochemistry. The results of the analysis showed that the amount of raw materials of more than half of the plants were out of the limit, and the results were difficult to determine. It was determined that Rhodococcus belonged to 1 strain, Streptosporangium belonged to 2 strains, and all kinds of compounds were identified by biochemical analysis. The results of NMR and MS were analyzed, Rhodococcus strain was isolated from 1 strain, and Streptosporangium was isolated from 2 species of novel compounds.