Isolation of rare actinomycetes for screening of new compound from deep-sea water

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昨年度と同様に、新型コロナ感染症の影響により、申請当初に計画をしていた全国の海洋深層水取水施設へのサンプリングが困難な状況であった。また、今後も計画通りに遂行できない可能性が考えられた。そのため、当初予定していた研究計画を大きく変更し、製品評価基盤機構（NITE）の微生物保存機関であるバイオテクノロジーセンター（NBRC）で提供されているスクリーニング用微生物（RD株）から、海洋深層水由来の放線菌株を検索した。このうち、特に研究報告例の無い北海道羅臼の海洋深層水から分離された55株について、詳細な生産物の解析を実施することで、新規化合物の探索を行うこととした。はじめに、前年度に新規化合物が得られ、海洋深層水に存在する放線菌における有用希少放線菌として選定したRhodococcus属から6株、さらには海洋深層水からの分離例が極めて少ない、Streptosporangium属20株を優先的に研究に用いた。これら26株は3種類の化合物生産用培地にて培養・抽出し、主にHPLCを用いた生産物の詳細な解析を行った。解析の結果、大半の株では生産物の量が検出限界であったり、構造解析が困難であると判断された。構造解析に十分な量の化合物を生産していると判断したRhodococcus属の1株、Streptosporangium属の2株について、追加で生産培養を行い、目的化合物を各種クロマトグラフィーにて精製した。NMR、MSスペクトルによる構造解析の結果、Rhodococcus株から1つ、Streptosporangium属から2つの新規化合物を得た。