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RNAの転写後制御を介した葉原基分化の時間的調節機構の解明

通过 RNA 转录后控制阐明叶原基分化的时间调控机制

基本信息

批准号：
21K14833
负责人：
三村真生
金额：
$ 2.91万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份：
2021
资助国家：
日本
起止时间：
2021-04-01 至 2024-03-31
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K14833/
关键词：
イネ葉間期葉原基発生・分化翻訳調節 RNA顆粒転写後制御

项目摘要

本研究では、イネの葉間期(葉原基分化の時間的間隔)を調節するRNAの転写後制御を介した分子機構を明らかにすることを目的とする。今年度は以下の解析を行なった。(1)RNA結合タンパク質PLA2が標的RNAの翻訳に与える影響を調べるために、野生型とpla2変異体の茎頂と若い葉原基をサンプリングし、DIAプロテオーム解析を行なった。その結果、野生型と変異体でそれぞれ1700弱のタンパク質が同定され、そのうちPLA2の標的候補遺伝子は88個と少なかったが、これらのタンパク質量は野生型と比べて変異体では減少している傾向が見られた。このことから、PLA2は標的RNAと結合し、その翻訳を促進する機能を持つことが推測された。今回サンプル数が少なかったため、今後再現性を確認する予定である。(2)PLA2と結合する候補遺伝子のうち葉間期との関係が示されている遺伝子に対して、CRISPR/Cas9により結合すると考えられる3'非翻訳配列を欠損させた個体の作出を試みた。結果として、結合配列を含む一部の配列を欠損させた個体を少なくとも２系統得ることができた。世代促進をしたのち、得られた系統の葉間期や葉サイズなどの表現型解析を行い、欠損させた3'非翻訳配列の機能について考察を行う予定である。(3)葉間期が短縮する表現型を亢進するインディカ品種背景の突然変異体を解析し、日本晴と交配して得られたF2世代の植物体を用いてMutmap法による原因遺伝子の同定を試みた。その結果、すでに葉間期制御に関わることが知られている酵素と相同性のある遺伝子のスプライシングサイトに変異を発見した。この遺伝子の発現は複数のpla変異体で上昇していたため、フィードバックによる発現制御が働く可能性が示唆された。

The aim of this study was to regulate the interleaf interphase (the time interval between leaf primordia differentiation) and the molecular mechanism of RNA control. This year's analysis of the following is done. (1) RNA-binding plasmid PLA2-targeted RNA is transduced and is affected by RNA binding, wild typeとpla2変variantのstemtopと如い叶primordium をサンプリングし, DIAプロテオームanalytic を行なった.その results, wild-type と変 allogeneic でそれぞれ1700 weak のタンパクquality が同定され, そのうちPLA2の standard candidate There are 88 children in the wild type and the quality is low and the quality is low compared to the wild type.このことから、PLA2はtargeted RNAとbindingし、そのturn訳をpromoting するfunctionをholdingつことがspeculationされた. This time the number of サンプルががなかったため will be confirmed, and the reproducibility will be confirmed in the future. (2)PLA2 is combined with candidate supplementary material, CR. ISPR/Cas9 is combined with the test of 3' non-translated configuration and loss of individuality. The result is that the combination of the arrangement and the combination of the arrangement and the combination of the arrangement and the combination of the arrangement and the loss of the individual and the combination of the system and the combination of the system and the system are obtained. Phenotypic analysis of the interleaf period of the generation promotion systemを行い, owed loss させた3' non-translation arrangement of the function について inspection を行う predetermined である. (3) Interleaf period shortening, phenotype, hyperplasia, variety background, sudden change, allotype analysis, Nipponbare Mating して got られた F2 generation の plant body を used いて Mutmap method による reason left 伝子の Same determination を test みた.その Results, すでに interleaf phase control に关わることが知られているenzyme とSamenessのある伝子のスプライシングサイトに変differentを発见した.この缝子の発 appearはpluralのpla変variantでriseしていたため, フィードバックによる発开户が働くpossibilityがshows instigation された.