イネNLR型抵抗性遺伝子の進化様式を利用した罹病性遺伝子の同定

利用水稻NLR型抗性基因的进化模式鉴定易感基因

基本信息

  • 批准号:
    21K14834
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.91万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

いもち病抵抗性タンパク質Piasは、2つのNLR型受容体(Pias-1とPias-2)をによって構成され、Pias-1は抵抗性反応の実行因子としての役割を持つ一方で、Pias-2はいもち病菌因子の認識に関わる役割を持つ。Pias-2には、IDとしてDUF761が存在する。Oryza属に含まれる様々な種(O. sativa、O. rufipogon、O. punctataなど)や他のイネ科植物のゲノム配列情報を利用してPias遺伝子座の変異を調査したところ、Pias-2対立遺伝子産物にはDUF761の位置にPKc_MAPKKやWRKYなどの様々な種類のタンパク質の断片が存在していた。さらに、Pias-2対立遺伝子産物のIDの種類を集計したところ、Aゲノム種が持つIDとしてはDUF761、HMA、DUF677が優占する一方で、他のゲノム種においては、HMA、DUF677、PKc_MAPKKが優占していた。興味深いことに、DUF761をIDとして持つPias-2対立遺伝子産物はAゲノム種のみに見られ、PKc_MAPKKをIDとして持つものはO. punctataなどの系統に限られた。Pias-2を特定した「Keiboba」のゲノム情報を詳細に調べるとPias-2のごく近傍にO. punctataが持つID(PKc_MAPKK)領域と高い相同性の領域があることを見出した。これらの結果から、Pias-2の進化過程においてIDの着脱(PKc_MAPKKからDUF761)が起きたと推定される。Oryza属における、IDの分布を詳細に調べた結果から、着目すべきイネ遺伝子を7つまでに絞り込んだ。
Disease resistance (Pias), Pias-1 disease Pias-2 (NLR), Pias-1 resistance (line factor), pathogen (pathogen), pathogen (pathogen), and so on. There is a certificate in the Pias-2 account, ID address and DUF761 address. Oryza belongs to the species (O. Sativa, O. Rufipogon, O. punctata) of the family Euphorbiaceae. The configuration of plants of the family Euphorbiaceae makes use of the location of the DUF761 in the pedestal of the Pias tree, the location of the DUF761, the location of the DUF761, and the existence of the fragments of the plant of the family Olividae. The data of Pias-2, HMA, DUF677, PKc_MAPKK, DUF761, HMA, and PKc_MAPKK account for one side of the list, while those of HMA, DUF677 and PKc_MAPKK account for each other. DUF761, Pias-2, DUF761, punctata, DUF761, DUF7 Pias-2 has specific information, such as "Keiboba", "information", "information", "Pias-2", "near", "punctata", "ID" (PKc_MAPKK), "homology", "domain", "high", "homogeneity", "field", "market", and so on. The results of the experiment show that the Pias-2 improvement process requires ID DUF761 to cause a presumption of error. Oryza belongs to the distribution system of Oryza. The results show that the results of the distribution are similar to those of the distribution system.

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
イネいもち病抵抗性タンパク質は付加ドメインを"擬似餌"として病原抵抗性を誘導する
稻瘟病抗性蛋白通过使用额外的结构域作为“猎物”来诱导病原体抗性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yoshihisa Ayaka;Yoshimura Satomi;Shimizu Motoki;Sato Sayaka;Matsuno Shogo;Mine Akira;Yamaguchi Koji;Kawasaki Tsutomu;Motoki Shimizu; Adam Bentham; Soichiro Asuke; Yukio Tosa; Sophien Kamoun; Mark Banfield; Ryohei Terauchi;清水 元樹; 杉原 優; 宮路 直実; 阿部 陽; 寺内 良平;清水 元樹; 寺内 良平
  • 通讯作者:
    清水 元樹; 寺内 良平
Genomic exploration of host specificity determinants identifies wheat blast effectors that are recognized by rice NLR
宿主特异性决定因素的基因组探索确定了水稻 NLR 识别的小麦稻瘟病效应子
  • DOI:
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yoshihisa Ayaka;Yoshimura Satomi;Shimizu Motoki;Sato Sayaka;Matsuno Shogo;Mine Akira;Yamaguchi Koji;Kawasaki Tsutomu;Motoki Shimizu; Adam Bentham; Soichiro Asuke; Yukio Tosa; Sophien Kamoun; Mark Banfield; Ryohei Terauchi
  • 通讯作者:
    Motoki Shimizu; Adam Bentham; Soichiro Asuke; Yukio Tosa; Sophien Kamoun; Mark Banfield; Ryohei Terauchi
イネいもち病抵抗性遺伝子Piasと対応する非病原力遺伝子AVR-Piasの単離
稻瘟病抗性基因Pias及相应无毒基因AVR-Pias的分离
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yoshihisa Ayaka;Yoshimura Satomi;Shimizu Motoki;Sato Sayaka;Matsuno Shogo;Mine Akira;Yamaguchi Koji;Kawasaki Tsutomu;Motoki Shimizu; Adam Bentham; Soichiro Asuke; Yukio Tosa; Sophien Kamoun; Mark Banfield; Ryohei Terauchi;清水 元樹; 杉原 優; 宮路 直実; 阿部 陽; 寺内 良平
  • 通讯作者:
    清水 元樹; 杉原 優; 宮路 直実; 阿部 陽; 寺内 良平
イネのいもち病抵抗性機構の解明
阐明稻瘟病抗性机制
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Isolation of <i>Pikps</i>, an allele of <i>Pik</i>, from the <i>aus</i> rice cultivar Shoni
从 <i>aus</i> 水稻品种 Shoni 中分离出 <i>Pikps</i>(<i>Pik</i> 的等位基因)
  • DOI:
    10.1266/ggs.22-00002
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.1
  • 作者:
    Kovi B;Sakai T;Abe A;Kanzaki E;Terauchi R;Shimizu M
  • 通讯作者:
    Shimizu M
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

清水 元樹其他文献

Brassica oleracea FLC2 領域を移入交雑で導入したBrassica rapa の特性解析
甘蓝FLC2区基因渗入杂交引入的白菜特性分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    シェイ ダニエル;戸丸 祐貴; 板橋 悦子;宮﨑 俊夫;柿崎 智博;清水 元樹;藤本 龍;深井 英吾;岡崎 桂一
  • 通讯作者:
    岡崎 桂一
Brassica rapaにおける小国カブの近交系統間で起きる一側性不和合性を制御する雌雄因子の同定に向けた遺伝学的解析
遗传分析识别控制小国芜菁自交系之间单侧不亲和性的雄性和雌性因素
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    金 あおい;高田 美信;清水 元樹;高山 誠司;鈴木  剛;小林 恭士;渡辺 正夫
  • 通讯作者:
    渡辺 正夫
B.rapa近交系統間交雑時に生じた新規受粉時一側性不和合性現象の解析
白菜自交系杂交新授粉过程中单侧不亲和性分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    金 あおい;高田 美信;清水 元樹;高山 誠司;鈴木  剛;小林 恭士;渡辺 正夫
  • 通讯作者:
    渡辺 正夫
発ガン過程を進化として捉える:数理的アプローチ
将致癌过程理解为进化:数学方法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    シェイ ダニエル;戸丸 祐貴; 板橋 悦子;宮﨑 俊夫;柿崎 智博;清水 元樹;藤本 龍;深井 英吾;岡崎 桂一;巌佐 庸
  • 通讯作者:
    巌佐 庸
サルの二足「走行」とヒトの二足「歩行」
猴子双足“跑”和人类双足“走”
  • DOI:
  • 发表时间:
    2015
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    シェイ ダニエル;戸丸 祐貴; 板橋 悦子;宮﨑 俊夫;柿崎 智博;清水 元樹;藤本 龍;深井 英吾;岡崎 桂一;巌佐 庸;荻原直道
  • 通讯作者:
    荻原直道

清水 元樹的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('清水 元樹', 18)}}的其他基金

アブラナ科植物における病害抵抗性遺伝子の同定と進化遺伝学的研究
十字花科植物抗病基因的鉴定及进化遗传学研究
  • 批准号:
    12J05450
  • 财政年份:
    2012
  • 资助金额:
    $ 2.91万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了