アブラナ科植物における病害抵抗性遺伝子の同定と進化遺伝学的研究
アブラナ科植物における病害抵抗性遺伝子の同定と進化遺伝学的研究
批准号:
12J05450
负责人:
清水 元樹
金额:
$1.15万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2012
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2012 至 2013
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本研究では, アブラナ科植物における抵抗性遺伝子の単離と, 抵抗性遺伝子の進化遺伝学的解析を目的に実験を行っている。萎黄病抵抗性遺伝子については, Brassica rapaの抵抗性と感受性を示す系統に対して, RNA-Seq法によって系統間で発現量が異なるNBS-LRR型遺伝子を探索した。その中で, 抵抗性系統にのみ存在するBra012688、Bra012689遺伝子から, 遺伝子マーカー(感受性系統では増幅されない)を作成し, 抵抗性・感受性系統の後代F_2分離集団に供試したところ, 各個体の遺伝子型と罹病度の間に強い関連性が示された。また, 感受性系統では, 両遺伝子の欠失により罹病化したと考えられた。これらの結果は, Bra012688, Bra012689が, B. rapaの有力な萎黄病抵抗性遺伝子であることを示唆している。なお, 2遺伝子は同じ転写方向でタンデムに位置するが, アミノ酸配列の相同性が低く最近の重複ではないと考えられた。B. oleraceaの抵抗性遺伝子については, 24年度に, キャベツ(B. oleracea)において, 抵抗性・感受性系統の後代F_2分離集団における組み換え個体を用いた接種試験により, 2つの有力なNBS-LRR型の萎黄病抵抗性候補遺伝子(FocBol-A, -B)を見出した。転写解析によって, 抵抗性系統でFocBol-Bは転写されるがORFが得られない, 一方でFocBol-AではORFが確保できた。また, 感受性系統では一塩基の挿入によりフレームシフトが起きており, FocBo1-Aの機能が喪失したと考えられた。更に, 抵抗性のFocBol-A特異的増幅マーカーによって多数のキャベツ, ブロッコリーF_1品種を用いたMAS (Marker Assisted Selection)を行ったところ, 抵抗性品種と感受性品種を完全に判別することができた。この結果は, FocBo1-Aが真の萎黄病抵抗性遺伝子であることを更に裏付け, 確実なMASの基盤を提供するものと考えられた。また, B. oleraceaのFocBol-Aは, B. rapaのBra012688のオルソログであった。全く異なる手法で同定された遺伝子が互いにオルソログであることは, これら2遺伝子が真の抵抗性遺伝子であることを強く示唆している。
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Screening of DNA markers suitable for purity test of inbred lines in Brassica oleracea
适合甘蓝自交系纯度检测的DNA标记筛选
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
Bull. Facul. Agric. Niigata Univ.
影响因子:
--
作者:
[Hiroya Tomita, Motoki Shimizu and Chiori Kume(These authors equally contributed to this work)]
通讯作者:
Motoki Shimizu and Chiori Kume(These authors equally contributed to this work)
Brassica oleracea 品種における萎黄病抵抗性遺伝子FocBo1連鎖DNA マーカーと抵抗性との関連性
DNA标记与甘蓝品种黄疫病抗性基因FocBo1相关抗性之间的关系
DOI:
--
发表时间:
2013
期刊:
影响因子:
--
作者:
[清水元樹, 川辺隆大, Pu Zi-jing, 藤本龍, 岡崎桂一]
通讯作者:
岡崎桂一
Characterization of NBS-LRR motif genes between S11 and R09 by RNA sequencing in Brassica rapa
通过 RNA 测序鉴定白菜 S11 和 R09 之间的 NBS-LRR 基序基因
DOI:
--
发表时间:
2012
期刊:
影响因子:
--
作者:
[村山恵司, 神谷由紀子, 樫田 啓, 浅沼浩之, 清水元樹]
通讯作者:
清水元樹
DOI:
10.1007/s11032-013-9918-9
发表时间:
2013-12-01
期刊:
MOLECULAR BREEDING
影响因子:
3.1
作者:
[Tomita, Hiroya, Shimizu, Motoki, Okazaki, Keiichi]
通讯作者:
Okazaki, Keiichi
Differential expression解析を用いたハクサイ萎黄病抵抗生遺伝子の同定
差异表达分析鉴定大白菜黄化病抗性基因
DOI:
--
发表时间:
2014
期刊:
影响因子:
--
作者:
[清水元樹, 江部裕介, 川辺隆大, 佐伯なつみ, 加治誠, 岡崎桂一, 藤本龍]
通讯作者:
藤本龍
共 10 条
イネNLR型抵抗性遺伝子の進化様式を利用した罹病性遺伝子の同定
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批准号:21K14834
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$2.91万
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财政年份:2021
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负责人:清水 元樹
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依托单位: