Functional and Structural Relationship of V-ATPase Revealed by Single-Molecule Observation

单分子观察揭示V-ATP酶的功能和结构关系

基本信息

  • 批准号:
    21K15060
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

回転型ATPaseは生物に普遍的に存在する分子モータータンパク質であり、ATPの化学結合エネルギーと膜間の電気化学ポテンシャルとを回転運動を介して共役している最小のエネルギー変換装置として知られている。本研究ではその中でもナトリウムイオンを選択的に輸送する腸球菌由来V-ATPaseを用い、その回転機構および反応機構の解明を目指している。2022年度は精製したV-ATPaseの1分子回転計測によりATP加水分解部位とイオン輸送部位との共役機構の一端を明らかにし、その成果を原著論文として発表した。実験の過程でイオン選択性に寄与していると考えられるアミノ酸残基を同定しそれらを変異させることで、腸球菌由来V-ATPaseをナトリウムイオン輸送型からプロトン輸送型に機能転換させることに成功した。この機能転換した変異体の生化学評価および1分子回転挙動を詳細に調べることで、回転型ATPaseにおけるイオン輸送機構の解明が期待できる。並行して、腸球菌由来V-ATPaseの反応可逆性を検証するための生化学測定系およびスクリーニング系の立ち上げ中である。また人工小胞体を用いたナトリウムイオン輸送の定量実験にも取り組んでおり、これら各種生化学測定と1分子回転計測とを組み合わせることで、V-ATPaseの機能と連動した構造ダイナミクス解明を目指す。
The common existence of reverse ATPase bioassay is molecular chemistry, ATP chemistry combined with electrical chemistry in the interfilm of electrical chemistry, the introduction of mass transfer in common service, the minimum amount of equipment in the air, and the equipment in which the equipment is known. The purpose of this study was to determine the origin of V-ATPase that was selected in this study. The anti-virus mechanism was used to identify the target target. In the year 2022, the V-ATPase molecular return program was used to analyze the water decomposition parts of the ATP and send the parts to the common service agency. The results of the original paper were published in the table. In the course of the process, you can send an optional message and determine that the acid residue is the same as that of V-ATPase, the source of bacteria, the delivery type, the delivery type and the success rate. The machine can be used in biochemistry, biochemistry Concomitant infection of bacteria and cocci V-ATPase, anti-reversibility, biochemistry, biochemistry and biochemistry. The artificial small cell bodies were used to determine the molecular biochemistry of the artificial small cell bodies by means of quantitative assay, biochemical assay, molecular regression assay, molecular regression assay, and V-ATPase mechanism. the results showed that the target was obtained.

项目成果

期刊论文数量(12)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Integrated research on rotary V-ATPase approached by single-molecule observation, biochemical assay, and protein engineering
单分子观察、生化分析和蛋白质工程的旋转V-ATP酶综合研究
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Akihiro Otomo;Ryota Iino
  • 通讯作者:
    Ryota Iino
Construction of hybrid molecular motor by engineering kinesin-1 with synthetic linker
通过使用合成连接子改造驱动蛋白-1 构建混合分子马达
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Jakia Jannat Keya;Akasit Visootsat;Takeda Kimitoshi;Akihiro Otomo;Sanghun Han;Kazushi Kinbara;Ryota Iino
  • 通讯作者:
    Ryota Iino
Enterococcus hirae由来V-ATPaseは”硬い”カップリングで対称性の不一致を気にせず回転する
源自海拉肠球菌的 V-ATP 酶可以旋转,无需担心由于“硬”耦合而导致的对称性失配
  • DOI:
  • 发表时间:
    2021
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大友章裕;飯田龍也;上野博史;村田武士;飯野亮太
  • 通讯作者:
    飯野亮太
Protein dynamics of a light-driven Na<sup>+</sup> pump rhodopsin probed using a tryptophan residue near the retinal chromophore
使用视网膜发色团附近的色氨酸残基探测光驱动 Na<sup> </sup> 泵视紫红质的蛋白质动力学
  • DOI:
    10.2142/biophysico.bppb-v20.s016
  • 发表时间:
    2023
  • 期刊:
  • 影响因子:
    1.5
  • 作者:
    Otomo Akihiro;Mizuno Misao;Inoue Keiichi;Kandori Hideki;Mizutani Yasuhisa
  • 通讯作者:
    Mizutani Yasuhisa
Single-molecule analysis and engineering of rotary V-ATPase
旋转V-ATP酶的单分子分析和工程
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    大友 章裕;飯田 龍也;上野 博史;村田 武士;飯野 亮太
  • 通讯作者:
    飯野 亮太
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  • 作者:
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  • 通讯作者:
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  • 作者:
    大友 章裕;水野 操;井上 圭一;神取 秀樹;水谷 泰久
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    水谷 泰久
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  • 作者:
    大友 章裕;飯田 龍也,上野 博史,村田 武士,飯野 亮太
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