Functional and Structural Relationship of V-ATPase Revealed by Single-Molecule Observation
Functional and Structural Relationship of V-ATPase Revealed by Single-Molecule Observation
批准号:
21K15060
负责人:
大友 章裕
金额:
$3.0万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
财政年份:
2021
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2021-04-01 至 2024-03-31
中文摘要
回転型ATPaseは生物に普遍的に存在する分子モータータンパク質であり、ATPの化学結合エネルギーと膜間の電気化学ポテンシャルとを回転運動を介して共役している最小のエネルギー変換装置として知られている。本研究ではその中でもナトリウムイオンを選択的に輸送する腸球菌由来V-ATPaseを用い、その回転機構および反応機構の解明を目指している。2022年度は精製したV-ATPaseの1分子回転計測によりATP加水分解部位とイオン輸送部位との共役機構の一端を明らかにし、その成果を原著論文として発表した。実験の過程でイオン選択性に寄与していると考えられるアミノ酸残基を同定しそれらを変異させることで、腸球菌由来V-ATPaseをナトリウムイオン輸送型からプロトン輸送型に機能転換させることに成功した。この機能転換した変異体の生化学評価および1分子回転挙動を詳細に調べることで、回転型ATPaseにおけるイオン輸送機構の解明が期待できる。並行して、腸球菌由来V-ATPaseの反応可逆性を検証するための生化学測定系およびスクリーニング系の立ち上げ中である。また人工小胞体を用いたナトリウムイオン輸送の定量実験にも取り組んでおり、これら各種生化学測定と1分子回転計測とを組み合わせることで、V-ATPaseの機能と連動した構造ダイナミクス解明を目指す。
英文摘要
回転型ATPaseは生物に普遍的に存在する分子モータータンパク質であり、ATPの化学結合エネルギーと膜間の電気化学ポテンシャルとを回転運動を介して共役している最小のエネルギー変換装置として知られている。本研究ではその中でもナトリウムイオンを選択的に輸送する腸球菌由来V-ATPaseを用い、その回転機構および反応機構の解明を目指している。2022年度は精製したV-ATPaseの1分子回転計測によりATP加水分解部位とイオン輸送部位との共役機構の一端を明らかにし、その成果を原著論文として発表した。実験の過程でイオン選択性に寄与していると考えられるアミノ酸残基を同定しそれらを変異させることで、腸球菌由来V-ATPaseをナトリウムイオン輸送型からプロトン輸送型に機能転換させることに成功した。この機能転換した変異体の生化学評価および1分子回転挙動を詳細に調べることで、回転型ATPaseにおけるイオン輸送機構の解明が期待できる。並行して、腸球菌由来V-ATPaseの反応可逆性を検証するための生化学測定系およびスクリーニング系の立ち上げ中である。また人工小胞体を用いたナトリウムイオン輸送の定量実験にも取り組んでおり、これら各種生化学測定と1分子回転計測とを組み合わせることで、V-ATPaseの機能と連動した構造ダイナミクス解明を目指す。
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Integrated research on rotary V-ATPase approached by single-molecule observation, biochemical assay, and protein engineering
单分子观察、生化分析和蛋白质工程的旋转V-ATP酶综合研究
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Akihiro Otomo, Ryota Iino]
通讯作者:
Ryota Iino
Construction of hybrid molecular motor by engineering kinesin-1 with synthetic linker
通过使用合成连接子改造驱动蛋白-1 构建混合分子马达
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Jakia Jannat Keya, Akasit Visootsat, Takeda Kimitoshi, Akihiro Otomo, Sanghun Han, Kazushi Kinbara, Ryota Iino]
通讯作者:
Ryota Iino
Enterococcus hirae由来V-ATPaseは”硬い”カップリングで対称性の不一致を気にせず回転する
源自海拉肠球菌的 V-ATP 酶可以旋转,无需担心由于“硬”耦合而导致的对称性失配
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大友章裕, 飯田龍也, 上野博史, 村田武士, 飯野亮太]
通讯作者:
飯野亮太
Protein dynamics of a light-driven Na<sup>+</sup> pump rhodopsin probed using a tryptophan residue near the retinal chromophore
使用视网膜发色团附近的色氨酸残基探测光驱动 Na<sup> </sup> 泵视紫红质的蛋白质动力学
DOI:
10.2142/biophysico.bppb-v20.s016
发表时间:
2023
期刊:
Biophysics and Physicobiology
影响因子:
1.5
作者:
[Otomo Akihiro, Mizuno Misao, Inoue Keiichi, Kandori Hideki, Mizutani Yasuhisa]
通讯作者:
Mizutani Yasuhisa
Single-molecule analysis and engineering of rotary V-ATPase
旋转V-ATP酶的单分子分析和工程
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[大友 章裕, 飯田 龍也, 上野 博史, 村田 武士, 飯野 亮太]
通讯作者:
飯野 亮太
共 11 条
V-ATPaseのナトリウム駆動力による回転1分子観察とイオン/ATP共役比の改変
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批准号:24K17026
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项目类别:Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2024
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负责人:大友 章裕
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依托单位:
Elucidation of the rotation mechanism of V-ATPase by electrochemical potential
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批准号:20J01316
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$3.08万
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财政年份:2020
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负责人:大友 章裕
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依托单位:
Molecular Mechanisms of Selective Ion Transport by Common Protein Structures
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批准号:19J10830
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.34万
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财政年份:2019
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负责人:大友 章裕
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依托单位:
国内基金
海外基金
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V-ATPase和S100A10正反馈调控内体pH促进CARDS毒素逆向转运的机制研究
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批准号:
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2026
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负责人:黄呈
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依托单位:
溶酶体DOX阻断V-ATPase亚基聚合诱导耐药胶质瘤细胞巨泡式死亡的机制研究
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批准号:QN25H160010
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2025
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负责人:郭宇航
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依托单位:
V-ATPase 突变通过影响 cGAS-STING 轴阻碍 CCL5 分泌介导滤泡性淋巴瘤荒漠
型肿瘤微环境形成的机制研究
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批准号:24ZR1447900
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项目类别:省市级项目
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资助金额:--
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批准年份:2024
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负责人:王楠
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依托单位:
大补阴丸经GSK-3β/mTORC1/TFEB促进v-ATPase维持溶酶体酸化改善AD认知障碍的机制研究
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批准号:82304911
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2023
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负责人:刘潇
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依托单位:
溶酶体v-ATPase相关细胞代谢调控肝细胞癌的机制研究
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批准号:2023J06038
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项目类别:省市级项目
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资助金额:30.0万元
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批准年份:2023
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负责人:王雪枫
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依托单位:
E3泛素连接酶SINATs调控V-ATPase稳态参与植物自噬降解的分子机制
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批准号:32370361
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项目类别:面上项目
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资助金额:50万元
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批准年份:2023
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负责人:齐华
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依托单位:
溶酶体蛋白LAPTM4B通过与V-ATPase相互作用促进EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药发生的机制研究
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批准号:82303637
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2023
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负责人:刘敏霞
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依托单位:
TMEM175/AKT/AMPK/V-ATPase信号通路介导溶酶体质子通道与PD发病机制的相关研究
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批准号:82371258
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项目类别:面上项目
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资助金额:47万元
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批准年份:2023
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负责人:杨新玲
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依托单位:
脉络膜循环高压通过调节溶酶体v-ATPase/Ragulator-Rag信号轴诱发肥厚型息肉状脉络膜血管病变的机制研究
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批准号:82301241
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30.00万元
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批准年份:2023
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负责人:赵欣宇
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依托单位:
NAMPT/HKII/V-ATPase通路调控的糖/能量代谢异常在Fuchs角膜内皮营养不良中的机制研究
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批准号:--
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2022
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负责人:王君怡
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依托单位: