空間的な単一細胞の遺伝子発現解析による始原生殖細胞の潜在的多能性の制御機構解明

通过空间单细胞基因表达分析阐明原始生殖细胞潜在多能性的调控机制

基本信息

  • 批准号:
    21K15107
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究の目的は、移動期の個々の始原生殖細胞とその周辺環境を構成する細胞の詳細な遺伝子発現解析により、生体内における適切な多能性や分化の制御機構、これに関わる微小環境との相互作用の分子基盤を解明することである。組織内における配置情報とリンクした単一細胞レベルでの詳細な遺伝子発現情報の取得手法の開発について、前年度に決定した手法を用いて、マウスの卵巣を包埋、脱水固定、染色し、卵胞中の卵母細胞、及びその卵母細胞に隣接する顆粒膜細胞と隣接しない顆粒膜細胞をLCMにより単一細胞レベルで切り出し、取得し、cDNA合成の後、定量的PCRによる主要遺伝子の定量により、固定切片上の単一細胞からのRNA回収とcDNA合成効率を評価した。その結果、これまで、培養細胞(マウスのES細胞)で得られていたことと同様に、卵母細胞、顆粒膜細胞の両者から網羅的な遺伝子発現を解析するに十分な質のcDNAを合成できていることが確認できた。さらに、当該cDNAよりNGSライブラリーを作製し、トランスクリプトームの詳細な解析したところ、各細胞において5000~15000程度の遺伝子が検出できていることが確認できた。このことは、我々が開発した手法を用いることで脱水固定し、染色した組織から単一細胞レベルでトランスクリプトームを詳細に解析することが可能であることを示唆している。加えて、単一の顆粒膜細胞のトランスクリプトームを卵母細胞からの位置情報と結び付けて解析することで、卵母細胞に隣接するか、卵母細胞より離れているかで同じ顆粒膜細胞であっても遺伝子発現プロファイルが異なっていることを見出した。
The purpose of this study is to analyze the detailed analysis of individual primordial germ cells during the migration period, the surrounding environment and the structure of the cells, and the living body The control mechanism of the internal control of pluripotency and differentiation, the microenvironment of the microenvironment, and the interaction of the molecular base are explained by the control mechanism. Detailed information on the deployment of information within the organization and the details of the organization's information and the method of obtaining the information, the previous year The technique used in deciding the decision is to use the oocyte embedding, dehydration fixation, staining, oocyte in the egg cell, and adjacent oocyte in the oocyte. Granular membrane cells and adjacent granular membrane cells をLCM により Single cells レベルでり出し, acquisition, cDNA synthesis, and quantification The main parameters of PCR are quantitative analysis, RNA recovery from single cells on fixed sections, and evaluation of cDNA synthesis efficiency.そのRESULTS, これまで, cultured cells (マウスのES cells) でgetられていたことと同様に, oocytes, granulosa membrane cells The analysis of the remaining DNA of the cell and the synthesis of cDNA is a confirmation of the results.さらに、When the cDNA is made by NGSライブラリーを, and the トランスクリプトームのdetailed analysis is doneところ、Each cell is made of 5000~15000 degree の伝子が検出できていることがconfirmationできた.このことは、My 々がopen発したtechniqueをUsing いることでdehydration fixationし、stainingしたtissueから単One cellレベルでトランスクリプトームをDetailsにanalyticsすることがpossibleであることをshows唆している. Add えて, 単一の granulosa membrane cell のトランスクリプトームをoocyte からの location information と knot び pay けて analysis することで, oocyte に neighbor The connection of oocyte and oocyte separation is the same as that of granulosa cells.ても缝子発 appear プロファイルがdifferent なっていることを见出した.

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
細胞の溶解方法
细胞裂解法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Histology-associated transcriptomic heterogeneity in ovarian folliculogenesis revealed by quantitative single-cell RNA-sequencing for tissue sections with DRaqL
  • DOI:
    10.1101/2022.12.14.520513
  • 发表时间:
    2022-12
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hiroki Ikeda;Shintaro Miyao;So I. Nagaoka;Takuya Yamamoto;K. Kurimoto
  • 通讯作者:
    Hiroki Ikeda;Shintaro Miyao;So I. Nagaoka;Takuya Yamamoto;K. Kurimoto
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

池田 宏輝其他文献

池田 宏輝的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('池田 宏輝', 18)}}的其他基金

生体内における卵母細胞の転写、翻訳活性の分子制御機構の解明
阐明体内卵母细胞转录和翻译活动的分子控制机制
  • 批准号:
    24K18374
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
染色体の高次構造解析を用いた多能性獲得機構における遺伝子発現制御システムの解明
利用染色体构象分析阐明获得多能性机制中的基因表达控制系统
  • 批准号:
    14J01800
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似国自然基金

UHRF1编码卵子DNA甲基化介导对羟基苯甲酸丙酯跨代损伤卵巢的机制研究
  • 批准号:
    JCZRYB202500137
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
RPL10A核糖体亚基组装机制的筛选及其在卵子发育中的功能研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    15.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
烟酰胺通过活化Sirtuin7逆转对乙酰氨基酚干扰胎鼠卵子发生的机制 研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
CCDC174突变导致人类卵子成熟障碍的机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
代谢物 L-2-HG 对卵子成熟和胚胎发育的影 响及作用机制研究
  • 批准号:
    Y24H040003
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
牛磺酸对人工繁殖日本鳗鲡肝脏损伤的修复作用及卵子质量的影响
  • 批准号:
    24ZR1428700
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
Actin cap新蛋白DEPDC7调控卵子成熟的分子机制研究
  • 批准号:
    82371663
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    45 万元
  • 项目类别:
    面上项目
KRP调控草地贪夜蛾卵子发生的分子机制及其作为害虫防治靶标的研究
  • 批准号:
    32372524
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
雌核生殖银鲫hax1和gsdf共同调控卵子发生的分子机制研究
  • 批准号:
    32303003
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
IREB2介导铁代谢参与调控卵子质量的机制研究
  • 批准号:
    82301861
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似海外基金

卵巣組織凍結Vitrification法における組織内卵子ミトコンドリア機能向上の探究
卵巢组织冷冻玻璃化冷冻法改善组织内卵母细胞线粒体功能的探索
  • 批准号:
    24K12612
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Expecting Mothers' Study of Consumption or Avoidance of Peanut and Egg (ESCAPE)
准妈妈食用或避免花生和鸡蛋的研究(ESCAPE)
  • 批准号:
    10733927
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
Study on the mechanism of antibody transport to avian egg yolks by PLA2R receptor and its application to produce eggs rich in IgY
PLA2R受体将抗体转运至禽蛋黄的机制研究及其在生产富含IgY鸡蛋中的应用
  • 批准号:
    20H03128
  • 财政年份:
    2020
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Elucidation of the molecular mechanism of polyspermy block system in avian eggs and development of a long-term preservation method for avian egg
禽蛋多精阻断系统分子机制的阐明及禽蛋长期保存方法的开发
  • 批准号:
    19K06363
  • 财政年份:
    2019
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Effect of the timing of nuclear reprogramming and egg activation on the developmental potential of somatic cell-nuclear transferred-quail eggs
核重编程和卵激活时机对体细胞核移植鹌鹑蛋发育潜力的影响
  • 批准号:
    26850211
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
ORAL DESENSITIZATION TO EGG AND SUBSEQUENT INDUCTION OF TOLERANCE
口腔对鸡蛋脱敏并随后诱导耐受
  • 批准号:
    7953701
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
IMMUNOLOGICAL BASIS OF EGG ALLERGY
鸡蛋过敏的免疫学基础
  • 批准号:
    7953683
  • 财政年份:
    2009
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
ORAL DESENSITIZATION TO EGG & INDUCTION OF TOLERANCE FOR EGG ALLERGIC CHILDREN
口腔对鸡蛋脱敏
  • 批准号:
    7718191
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
IMMUNOLOGICAL BASIS OF EGG ALLERGY
鸡蛋过敏的免疫学基础
  • 批准号:
    7718164
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
COFAR 3 EGG ORAL IMMUNOTHERAPY
COFAR 3 鸡蛋口服免疫疗法
  • 批准号:
    7719407
  • 财政年份:
    2008
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了