空間的な単一細胞の遺伝子発現解析による始原生殖細胞の潜在的多能性の制御機構解明

通过空间单细胞基因表达分析阐明原始生殖细胞潜在多能性的调控机制

基本信息

  • 批准号:
    21K15107
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 3万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 财政年份:
    2021
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2021-04-01 至 2024-03-31
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

本研究の目的は、移動期の個々の始原生殖細胞とその周辺環境を構成する細胞の詳細な遺伝子発現解析により、生体内における適切な多能性や分化の制御機構、これに関わる微小環境との相互作用の分子基盤を解明することである。組織内における配置情報とリンクした単一細胞レベルでの詳細な遺伝子発現情報の取得手法の開発について、前年度に決定した手法を用いて、マウスの卵巣を包埋、脱水固定、染色し、卵胞中の卵母細胞、及びその卵母細胞に隣接する顆粒膜細胞と隣接しない顆粒膜細胞をLCMにより単一細胞レベルで切り出し、取得し、cDNA合成の後、定量的PCRによる主要遺伝子の定量により、固定切片上の単一細胞からのRNA回収とcDNA合成効率を評価した。その結果、これまで、培養細胞(マウスのES細胞)で得られていたことと同様に、卵母細胞、顆粒膜細胞の両者から網羅的な遺伝子発現を解析するに十分な質のcDNAを合成できていることが確認できた。さらに、当該cDNAよりNGSライブラリーを作製し、トランスクリプトームの詳細な解析したところ、各細胞において5000~15000程度の遺伝子が検出できていることが確認できた。このことは、我々が開発した手法を用いることで脱水固定し、染色した組織から単一細胞レベルでトランスクリプトームを詳細に解析することが可能であることを示唆している。加えて、単一の顆粒膜細胞のトランスクリプトームを卵母細胞からの位置情報と結び付けて解析することで、卵母細胞に隣接するか、卵母細胞より離れているかで同じ顆粒膜細胞であっても遺伝子発現プロファイルが異なっていることを見出した。
The purpose of this study is to elucidate the molecular basis for the interaction between protogerm cells and their surrounding environments during migration, and to elucidate the molecular basis for the detailed analysis of germ cell development, in vivo pluripotency, and differentiation control mechanisms. Disposition information in tissue, single cell cycle, detailed gene expression information, acquisition procedure, prior year determination procedure, egg embedding, desiccation fixation, staining, oocyte in oocyte, and adjacent granular membrane cells in oocyte LCM, single cell cycle, acquisition procedure, cDNA synthesis procedure Quantification of major genes by quantitative PCR, RNA recovery from single cells on fixed sections, and cDNA synthesis efficiency were evaluated. The results of this study were as follows: (1) The synthesis of cDNA in cultured cells (ES cells) was confirmed by the analysis of the gene expression in oocytes, granulosa cells, and host cells. In addition, when the cDNA sequence is controlled, the cDNA sequence is analyzed in detail, and the cDNA sequence is detected at a level of 5000~15000 in each cell. This is the first time that we have been able to open up a new way to use this technology. This is the first time that we have been able to open up a new way to use this technology. This is the second time that we have been able to open up a new way to use this technology. Add information on the location of oocytes and the analysis of oocytes, oocytes, and granular membrane cells.

项目成果

期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
細胞の溶解方法
细胞裂解法
  • DOI:
  • 发表时间:
    2022
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
Histology-associated transcriptomic heterogeneity in ovarian folliculogenesis revealed by quantitative single-cell RNA-sequencing for tissue sections with DRaqL
  • DOI:
    10.1101/2022.12.14.520513
  • 发表时间:
    2022-12
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Hiroki Ikeda;Shintaro Miyao;So I. Nagaoka;Takuya Yamamoto;K. Kurimoto
  • 通讯作者:
    Hiroki Ikeda;Shintaro Miyao;So I. Nagaoka;Takuya Yamamoto;K. Kurimoto
{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}

{{ item.title }}
  • 作者:
    {{ item.author }}

数据更新时间:{{ patent.updateTime }}

池田 宏輝其他文献

池田 宏輝的其他文献

{{ item.title }}
{{ item.translation_title }}
  • DOI:
    {{ item.doi }}
  • 发表时间:
    {{ item.publish_year }}
  • 期刊:
  • 影响因子:
    {{ item.factor }}
  • 作者:
    {{ item.authors }}
  • 通讯作者:
    {{ item.author }}

{{ truncateString('池田 宏輝', 18)}}的其他基金

生体内における卵母細胞の転写、翻訳活性の分子制御機構の解明
阐明体内卵母细胞转录和翻译活动的分子控制机制
  • 批准号:
    24K18374
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
染色体の高次構造解析を用いた多能性獲得機構における遺伝子発現制御システムの解明
利用染色体构象分析阐明获得多能性机制中的基因表达控制系统
  • 批准号:
    14J01800
  • 财政年份:
    2014
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows

相似国自然基金

UHRF1编码卵子DNA甲基化介导对羟基苯甲酸丙酯跨代损伤卵巢的机制研究
  • 批准号:
    JCZRYB202500137
  • 批准年份:
    2025
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
RPL10A核糖体亚基组装机制的筛选及其在卵子发育中的功能研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    15.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
烟酰胺通过活化Sirtuin7逆转对乙酰氨基酚干扰胎鼠卵子发生的机制 研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
CCDC174突变导致人类卵子成熟障碍的机制研究
  • 批准号:
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    0 万元
  • 项目类别:
    面上项目
代谢物 L-2-HG 对卵子成熟和胚胎发育的影 响及作用机制研究
  • 批准号:
    Y24H040003
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
牛磺酸对人工繁殖日本鳗鲡肝脏损伤的修复作用及卵子质量的影响
  • 批准号:
    24ZR1428700
  • 批准年份:
    2024
  • 资助金额:
    0.0 万元
  • 项目类别:
    省市级项目
Actin cap新蛋白DEPDC7调控卵子成熟的分子机制研究
  • 批准号:
    82371663
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    45 万元
  • 项目类别:
    面上项目
KRP调控草地贪夜蛾卵子发生的分子机制及其作为害虫防治靶标的研究
  • 批准号:
    32372524
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    50 万元
  • 项目类别:
    面上项目
雌核生殖银鲫hax1和gsdf共同调控卵子发生的分子机制研究
  • 批准号:
    32303003
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目
IREB2介导铁代谢参与调控卵子质量的机制研究
  • 批准号:
    82301861
  • 批准年份:
    2023
  • 资助金额:
    30 万元
  • 项目类别:
    青年科学基金项目

相似海外基金

卵巣組織凍結Vitrification法における組織内卵子ミトコンドリア機能向上の探究
卵巢组织冷冻玻璃化冷冻法改善组织内卵母细胞线粒体功能的探索
  • 批准号:
    24K12612
  • 财政年份:
    2024
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Fertilization-induced maturation of cortical ER clusters in oocytes; impact of maternal age
受精诱导卵母细胞皮质 ER 簇的成熟;
  • 批准号:
    10720185
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
Developmental Biology of the Sea Urchin and Marine Invertebrates (DBSUMI) Meeting XXVII
海胆和海洋无脊椎动物发育生物学 (DBSUMI) 会议 XXVII
  • 批准号:
    10754145
  • 财政年份:
    2023
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
Membrane proteins driving a cell-cell fusion reaction during fertilization
受精过程中驱动细胞-细胞融合反应的膜蛋白
  • 批准号:
    10428846
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
Membrane proteins driving a cell-cell fusion reaction during fertilization
受精过程中驱动细胞-细胞融合反应的膜蛋白
  • 批准号:
    10598164
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
Integrating 'omics', evolution, and biochemistry to understand fertilization
整合“组学”、进化论和生物化学来理解受精
  • 批准号:
    10693344
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
Integrating 'omics', evolution, and structural biochemistry to understand animal fertilization
整合“组学”、进化和结构生物化学来了解动物受精
  • 批准号:
    10267662
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
Integrating 'omics', evolution, and biochemistry to understand fertilization
整合“组学”、进化论和生物化学来理解受精
  • 批准号:
    10668578
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
Integrating 'omics', evolution, and structural biochemistry to understand animal fertilization
整合“组学”、进化和结构生物化学来了解动物受精
  • 批准号:
    9761558
  • 财政年份:
    2018
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
Drying, Storing, and Reanimating Egg Germinal Vesicles to Preserve Fertility
干燥、储存和复活卵子胚泡以保持生育能力
  • 批准号:
    10464007
  • 财政年份:
    2017
  • 资助金额:
    $ 3万
  • 项目类别:
{{ showInfoDetail.title }}

作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了