分散が駆動する海産巻貝の放散：貝殻遺骸・集団ゲノミクスを用いた検証

海洋蜗牛的扩散驱动扩散：使用贝壳遗骸和种群基因组学进行验证

• 批准号: 21K15161
• 负责人: 山崎 大志
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Kochi University (2022)Tohoku University (2021)
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-04-01 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-21K15161/
• 关键词: 貝塚標本; 遺跡; 博物館; 貝類; 形態進化; 浮遊幼生; 種多様性; 埋蔵文化財; 海産貝類

2022年度は、昨年度に新型コロナウイルス感染症による社会情勢の変化のため大きく制約されていた野外におけるフィールド調査が実施でき、生態データの取得および新規のサンプルを入手した。本年度得られたサンプルに加え、これまでに取得済みのサンプルを用いて、浅海域の海産巻貝を対象とした形態解析および遺伝的解析を実施している。次世代シークエンサーを用いた集団ゲノミクス解析を進めた結果、潮間帯性の巻貝であるイシダタミ属において島嶼部（トカラ列島および琉球列島・伊豆諸島・小笠原諸島）を中心に独自の遺伝的系統が出現することが明らかとなった。このうち一部は筆者による先行研究（Yamazaki et al., 2017. Mar Biol）においても示唆されていたものの、本研究のように核遺伝子をゲノムワイドに検討することで、より詳細な遺伝的構造のパターンが得られた。現在これらの系統群を対象とした集団動態推定の解析から集団拡大および縮小と分岐の時系列解明を進めている。同様に、東北太平洋沿岸域において複数の巻貝種群を用いた集団構造の比較を進め、共通の遺伝的境界を検出した。加えて本年度は博物館等の機関に収蔵されている貝塚遺骸標本が実見できた。これも野外調査と同様、昨年度は十分に実施できなかった研究活動である。特にバテイラ属を中心とした浅海性巻貝や、二枚貝類の実見および撮影を行い、形態解析に供した。バテイラ属を中心とした巻貝類を対象として、過去および現生サンプルの形態解析との結果と比較するため、集団ゲノミクス解析を実施するための次世代シークエンサー用のライブラリー作成を進めている。これらについて概ね現生種のサンプルは揃い、殻形態の定量化ができている。

In 2022 and last year, there were new infectious diseases and changes in the social situation and restrictions on the new disease.いたOutdoor にけるフィールドinvestigation が実事でき, Ecological データの Obtain およびNew Regulations のサンプルを Start した. This year, I got the られたサンプルに卡え, the これまでに got the 済みのサンプルを用いて, The morphological analysis of the marine clams in shallow waters is the analysis of the morphology of the clams in the shallow sea. Analysis of the next generation シークエンサーをいた集団ゲノミクスたRESULT, intertidal 寯性の巻贝であるイシダタミ genus において Island Department (The Ryukyu Islands, the Izu Islands, and the Ogasawara Islands) The center of the system is the appearance of the system. The author of このうち一一はによる conducted the first research (Yamazaki et al., 2017. Mar Biol) においても说憆されていたものの、This study is a nuclear legacy 伝子をゲノムワイドに検多することで、よりDetails of the structure of the な伝のパターンが得られた. Now the system group を対 resembles と し た set 団 dynamic estimation の analysis か ら set 団 拡大 お よ び と divergence の time series explanation を advance め て い る. The same species as the Tohoku Pacific Coast area and the Tohoku Pacific Coast area are the plural species of clams. This year, museums and other institutions will collect specimens from the remains of the shell mound. This field survey was carried out together with the research activities carried out last year. Special にバテイラ genus をcenter としたShallow sea sex scallops や, two pieces of shellfish の実见およびphotography を行い, morphological analysis にSupply した. The バテイラ genus をcenter とした巻shellfish を対Elephant として, the past およびpresent サンプルのmorphological analysis とのresult とするため, 集団ゲノミクスanalytic を実士するための Next-generation シークエンサー用のライブラリー 成を入めている.これらについてねのサンプルは揃い, quantification of shell morphology ができている.

项目成果

Two shell color polymorphisms of Littorina horikawai in Tsushima Island, Japan

日本对马岛堀川滨鳀的两种贝壳颜色多态性

• 发表时间: 2021
• 期刊: Aquatic Animals
• 作者: Yamazaki Daishi;Saito Takumi;Fukuda Hiroshi
• 通讯作者: Fukuda Hiroshi

クボガイ（古腹足類:ニシキウズ目:クボガイ科）の有効名

蜗牛的有效名称（古腹足纲：Chrysophylla：蜗牛科）

• 发表时间: 2021
• 期刊: Molluscan Diversity
• 作者: 福田宏;山崎大志
• 通讯作者: 山崎大志

海産無脊椎動物多様性学

海洋无脊椎动物多样性

• 发表时间: 2022
• 作者: 京都大学フィールド科学教育研究センター瀬戸臨海実験所創立100周年記念出版編集委員会;朝倉 彰;下村 通誉;中野 智之;後藤 龍太郎;山守 瑠奈
• 通讯作者: 山守 瑠奈

Comparing the genetic diversity and population structure of sister marine snails having contrasting habitat specificity

• DOI: 10.1007/s11033-021-06885-x
• 发表时间: 2021-11
• 期刊: Molecular Biology Reports
• 影响因子: 2.8
• 作者: D. Yamazaki;S. Chiba

Genetic variation of <i>Littorina horikawai</i> endemic to the western coast and the adjacent islands around Kyushu, Japan inferred by mtDNA analyses

通过mtDNA分析推断日本西海岸及九州周边岛屿特有的<i>Littorina hokawawai</i>遗传变异

• DOI: 10.3800/pbr.17.271
• 发表时间: 2022
• 期刊: Plankton and Benthos Research
• 影响因子: 0.6
• 作者: Yamazaki Daishi;Seo Tomoki;Hirano Takahiro;Saito Takumi;Kameda Yuichi;Fukuda Hiroshi;Chiba Satoshi
• 通讯作者: Chiba Satoshi